Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVS0

HABP4, Intracellular hyaluronan-binding protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HABP4Q5JVS0 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HABP4Q5JVS0 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HABP4Q5JVS0 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HABP4Q5JVS0 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HABP4Q5JVS0 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HABP4Q5JVS0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HABP4Q5JVS0 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HABP4Q5JVS0 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HABP4Q5JVS0 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HABP4Q5JVS0 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HABP4Q5JVS0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HABP4Q5JVS0 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HABP4Q5JVS0 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HABP4Q5JVS0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HABP4Q5JVS0 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HABP4Q5JVS0 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HABP4Q5JVS0 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HABP4Q5JVS0 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
HABP4Q5JVS0 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HABP4Q5JVS0 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HABP4Q5JVS0 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HABP4Q5JVS0 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HABP4Q5JVS0 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HABP4Q5JVS0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
HABP4Q5JVS0 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HABP4Q5JVS0 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HABP4Q5JVS0 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
HABP4Q5JVS0 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HABP4Q5JVS0 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HABP4Q5JVS0 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HABP4Q5JVS0 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HABP4Q5JVS0 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HABP4Q5JVS0 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HABP4Q5JVS0 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HABP4Q5JVS0 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HABP4Q5JVS0 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HABP4Q5JVS0 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HABP4Q5JVS0 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HABP4Q5JVS0 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HABP4Q5JVS0 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HABP4Q5JVS0 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HABP4Q5JVS0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HABP4Q5JVS0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HABP4Q5JVS0 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HABP4Q5JVS0 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HABP4Q5JVS0 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HABP4Q5JVS0 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HABP4Q5JVS0 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HABP4Q5JVS0 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HABP4Q5JVS0 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
HABP4Q5JVS0 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HABP4Q5JVS0 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HABP4Q5JVS0 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HABP4Q5JVS0 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HABP4Q5JVS0 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HABP4Q5JVS0 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HABP4Q5JVS0 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HABP4Q5JVS0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HABP4Q5JVS0 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HABP4Q5JVS0 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HABP4Q5JVS0 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
HABP4Q5JVS0 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HABP4Q5JVS0 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HABP4Q5JVS0 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HABP4Q5JVS0 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
HABP4Q5JVS0 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HABP4Q5JVS0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HABP4Q5JVS0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HABP4Q5JVS0 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HABP4Q5JVS0 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HABP4Q5JVS0 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HABP4Q5JVS0 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HABP4Q5JVS0 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
HABP4Q5JVS0 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
HABP4Q5JVS0 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HABP4Q5JVS0 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HABP4Q5JVS0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HABP4Q5JVS0 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HABP4Q5JVS0 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HABP4Q5JVS0 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HABP4Q5JVS0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HABP4Q5JVS0 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HABP4Q5JVS0 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HABP4Q5JVS0 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
HABP4Q5JVS0 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
HABP4Q5JVS0 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
HABP4Q5JVS0 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
HABP4Q5JVS0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HABP4Q5JVS0 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HABP4Q5JVS0 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HABP4Q5JVS0 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HABP4Q5JVS0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HABP4Q5JVS0 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HABP4Q5JVS0 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HABP4Q5JVS0 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HABP4Q5JVS0 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HABP4Q5JVS0 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HABP4Q5JVS0 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HABP4Q5JVS0 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HABP4Q5JVS0 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms