Protein–RNA interactions for Protein: Q14671

PUM1, Pumilio homolog 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,186 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM1Q14671 NSA2-202ENST00000513356 797 ntTSL 38.4□□□□□ -1.064e-8■■■□□ 14.8
PUM1Q14671 MKNK2-207ENST00000588014 2413 ntTSL 215.39■□□□□ 0.053e-6■■■□□ 14.8
PUM1Q14671 MKNK2-206ENST00000587416 4093 ntTSL 211.96□□□□□ -0.53e-6■■■□□ 14.8
PUM1Q14671 MKNK2-211ENST00000591142 875 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.843e-6■■■□□ 14.8
PUM1Q14671 CKB-214ENST00000555770 816 ntTSL 429.15■■■□□ 2.264e-7■■■□□ 14.8
PUM1Q14671 CKB-213ENST00000555659 755 ntTSL 221.03■□□□□ 0.964e-7■■■□□ 14.8
PUM1Q14671 CKB-209ENST00000554705 803 ntTSL 221.03■□□□□ 0.964e-7■■■□□ 14.8
PUM1Q14671 CKB-216ENST00000557530 523 ntTSL 413.07□□□□□ -0.324e-7■■■□□ 14.8
PUM1Q14671 RABL6-208ENST00000464941 3361 ntTSL 215.92■□□□□ 0.144e-8■■■□□ 14.8
PUM1Q14671 KRT8-210ENST00000548998 918 ntTSL 518.23■□□□□ 0.516e-8■■■□□ 14.7
PUM1Q14671 ARHGAP4-222ENST00000494302 2667 ntTSL 517.09■□□□□ 0.331e-6■■■□□ 14.7
PUM1Q14671 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.241e-6■■■□□ 14.7
PUM1Q14671 ARHGAP4-207ENST00000420383 2817 ntTSL 216.18■□□□□ 0.181e-6■■■□□ 14.7
PUM1Q14671 ARHGAP4-205ENST00000404127 3232 ntTSL 515.82■□□□□ 0.121e-6■■■□□ 14.7
PUM1Q14671 ARHGAP4-219ENST00000470209 2889 ntTSL 515.77■□□□□ 0.121e-6■■■□□ 14.7
PUM1Q14671 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.111e-6■■■□□ 14.7
PUM1Q14671 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.141e-6■■■□□ 14.7
PUM1Q14671 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.231e-6■■■□□ 14.7
PUM1Q14671 VASP-202ENST00000586014 1725 ntTSL 518.27■□□□□ 0.522e-6■■■□□ 14.7
PUM1Q14671 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.062e-6■■■□□ 14.7
PUM1Q14671 DIAPH1-214ENST00000524301 561 ntTSL 45.41□□□□□ -1.547e-7■■■□□ 14.7
PUM1Q14671 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.151e-7■■■□□ 14.7
PUM1Q14671 CCT3-206ENST00000368262 2048 ntTSL 213.39□□□□□ -0.271e-7■■■□□ 14.7
PUM1Q14671 CCT3-211ENST00000472765 1858 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.41e-7■■■□□ 14.7
PUM1Q14671 CCT3-204ENST00000368259 1815 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.431e-7■■■□□ 14.7
PUM1Q14671 CCT3-203ENST00000368258 1885 ntTSL 211.65□□□□□ -0.541e-7■■■□□ 14.7
PUM1Q14671 CCT3-205ENST00000368261 863 ntTSL 510.13□□□□□ -0.791e-7■■■□□ 14.7
PUM1Q14671 FBL-210ENST00000599159 1400 ntTSL 1 (best)23.16■■□□□ 1.38e-18■■■□□ 14.7
PUM1Q14671 FBL-211ENST00000601274 877 ntTSL 523.02■■□□□ 1.288e-18■■■□□ 14.7
PUM1Q14671 FBL-203ENST00000594309 603 ntTSL 223.02■■□□□ 1.288e-18■■■□□ 14.7
PUM1Q14671 FBL-209ENST00000599134 500 ntTSL 522.38■■□□□ 1.178e-18■■■□□ 14.7
PUM1Q14671 FBL-208ENST00000598417 581 ntTSL 519.97■□□□□ 0.798e-18■■■□□ 14.7
PUM1Q14671 FBL-207ENST00000597634 726 ntTSL 516.18■□□□□ 0.188e-18■■■□□ 14.7
PUM1Q14671 FBL-206ENST00000597224 732 ntTSL 38.79□□□□□ -18e-18■■■□□ 14.7
PUM1Q14671 MYH9-210ENST00000486218 788 ntTSL 320.53■□□□□ 0.881e-6■■■□□ 14.7
PUM1Q14671 MYH9-208ENST00000475726 768 ntTSL 317.33■□□□□ 0.361e-6■■■□□ 14.7
PUM1Q14671 PUS7-204ENST00000481939 2436 ntTSL 515.89■□□□□ 0.134e-7■■■□□ 14.7
PUM1Q14671 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.094e-7■■■□□ 14.7
PUM1Q14671 PUS7-201ENST00000356362 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.794e-7■■■□□ 14.7
PUM1Q14671 PUS7-205ENST00000482157 395 ntTSL 54.29□□□□□ -1.724e-7■■■□□ 14.7
PUM1Q14671 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.593e-6■■■□□ 14.7
PUM1Q14671 NCL-210ENST00000494618 910 ntTSL 27.2□□□□□ -1.262e-29■■■□□ 14.7
PUM1Q14671 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.156e-9■■■□□ 14.7
PUM1Q14671 CCNB2-201ENST00000288207 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.336e-9■■■□□ 14.7
PUM1Q14671 CCNB2-205ENST00000621385 2503 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.156e-9■■■□□ 14.7
PUM1Q14671 AC092757.2-201ENST00000559026 633 ntTSL 4 BASIC7.27□□□□□ -1.256e-9■■■□□ 14.7
PUM1Q14671 CAVIN2-201ENST00000304141 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.872e-7■■■□□ 14.6
PUM1Q14671 SPEN-201ENST00000375759 12232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.879e-7■■■□□ 14.6
PUM1Q14671 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.234e-8■■■□□ 14.6
PUM1Q14671 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.93e-7■■■□□ 14.6
PUM1Q14671 SAMD1-201ENST00000269724 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 519.23■□□□□ 0.673e-7■■■□□ 14.6
PUM1Q14671 SLTM-223ENST00000560532 559 ntTSL 47.07□□□□□ -1.283e-7■■■□□ 14.6
PUM1Q14671 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.273e-6■■■□□ 14.6
PUM1Q14671 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.153e-6■■■□□ 14.6
PUM1Q14671 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.183e-6■■■□□ 14.6
PUM1Q14671 RSBN1-206ENST00000616024 2703 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.613e-6■■■□□ 14.6
PUM1Q14671 RSBN1-203ENST00000476412 3772 ntTSL 29.69□□□□□ -0.863e-6■■■□□ 14.6
PUM1Q14671 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.051e-9■■■□□ 14.6
PUM1Q14671 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.121e-9■■■□□ 14.6
PUM1Q14671 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.572e-6■■■□□ 14.6
PUM1Q14671 CCDC34-203ENST00000529615 716 ntTSL 39.61□□□□□ -0.872e-6■■■□□ 14.6
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PUM1Q14671 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.183e-6■■■□□ 14.6
PUM1Q14671 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.673e-6■■■□□ 14.6
PUM1Q14671 PPP1CC-204ENST00000546933 2154 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.633e-6■■■□□ 14.6
PUM1Q14671 PPP1CC-205ENST00000550261 747 ntTSL 55.12□□□□□ -1.593e-6■■■□□ 14.6
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PUM1Q14671 C19orf53-203ENST00000588841 499 ntTSL 28.21□□□□□ -1.12e-7■■■□□ 14.6
PUM1Q14671 C19orf53-204ENST00000588858 666 ntTSL 37.83□□□□□ -1.162e-7■■■□□ 14.6
PUM1Q14671 C19orf53-201ENST00000221576 504 ntTSL 26.83□□□□□ -1.322e-7■■■□□ 14.6
PUM1Q14671 AGAP3-221ENST00000490097 604 ntTSL 414.57□□□□□ -0.085e-9■■■□□ 14.6
PUM1Q14671 MIA3-202ENST00000344507 2026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.911e-6■■■□□ 14.6
PUM1Q14671 MIA3-201ENST00000340535 2735 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.371e-6■■■□□ 14.6
PUM1Q14671 MIA3-203ENST00000344922 8142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.61e-6■■■□□ 14.6
PUM1Q14671 CUX1-202ENST00000292538 2930 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.675e-7■■■□□ 14.6
PUM1Q14671 CUX1-212ENST00000547394 2878 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.735e-7■■■□□ 14.6
PUM1Q14671 CUX1-204ENST00000393824 2331 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.745e-7■■■□□ 14.6
PUM1Q14671 CUX1-205ENST00000425244 2776 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.795e-7■■■□□ 14.6
PUM1Q14671 CUX1-221ENST00000622516 2990 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.85e-7■■■□□ 14.6
PUM1Q14671 CUX1-203ENST00000360264 13762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.95e-7■■■□□ 14.6
PUM1Q14671 CUX1-206ENST00000437600 3031 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.975e-7■■■□□ 14.6
PUM1Q14671 CKB-206ENST00000553994 746 ntTSL 229.71■■■□□ 2.355e-7■■■□□ 14.6
PUM1Q14671 CCAR1-204ENST00000480627 561 ntTSL 25.67□□□□□ -1.52e-13■■□□□ 14.5
PUM1Q14671 SMARCC1-203ENST00000454240 636 ntTSL 327.83■■■□□ 2.052e-13■■□□□ 14.5
PUM1Q14671 PRMT1-204ENST00000525616 780 ntTSL 224.56■■□□□ 1.524e-8■■□□□ 14.5
PUM1Q14671 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.512e-6■■□□□ 14.5
PUM1Q14671 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.52e-6■■□□□ 14.5
PUM1Q14671 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.192e-6■■□□□ 14.5
PUM1Q14671 PCGF3-204ENST00000427463 582 ntTSL 322.44■■□□□ 1.182e-6■■□□□ 14.5
PUM1Q14671 PCGF3-210ENST00000482726 538 ntTSL 422.44■■□□□ 1.182e-6■■□□□ 14.5
PUM1Q14671 MXD1-202ENST00000409442 982 ntTSL 222.13■■□□□ 1.135e-9■■□□□ 14.5
PUM1Q14671 ALKBH6-217ENST00000497999 725 ntTSL 521.84■■□□□ 1.092e-6■■□□□ 14.5
PUM1Q14671 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 12e-6■■□□□ 14.5
PUM1Q14671 STXBP2-220ENST00000601061 706 ntTSL 320.93■□□□□ 0.942e-6■■□□□ 14.5
PUM1Q14671 ALKBH6-216ENST00000495116 630 ntTSL 220.68■□□□□ 0.92e-6■■□□□ 14.5
PUM1Q14671 PRMT1-220ENST00000534676 915 ntTSL 220.31■□□□□ 0.844e-8■■□□□ 14.5
PUM1Q14671 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.842e-6■■□□□ 14.5
PUM1Q14671 EIF4E2-209ENST00000454501 1048 ntTSL 320.14■□□□□ 0.812e-6■■□□□ 14.5
PUM1Q14671 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.83e-6■■□□□ 14.5
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