Protein–RNA interactions for Protein: P62330

ARF6, ADP-ribosylation factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF6P62330 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARF6P62330 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARF6P62330 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARF6P62330 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ARF6P62330 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARF6P62330 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARF6P62330 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARF6P62330 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARF6P62330 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ARF6P62330 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARF6P62330 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARF6P62330 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARF6P62330 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARF6P62330 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARF6P62330 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARF6P62330 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARF6P62330 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARF6P62330 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARF6P62330 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARF6P62330 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARF6P62330 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARF6P62330 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARF6P62330 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARF6P62330 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARF6P62330 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARF6P62330 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARF6P62330 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARF6P62330 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARF6P62330 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARF6P62330 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARF6P62330 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARF6P62330 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARF6P62330 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARF6P62330 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARF6P62330 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARF6P62330 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARF6P62330 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARF6P62330 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ARF6P62330 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ARF6P62330 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARF6P62330 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ARF6P62330 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ARF6P62330 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARF6P62330 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARF6P62330 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARF6P62330 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARF6P62330 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARF6P62330 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARF6P62330 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARF6P62330 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARF6P62330 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARF6P62330 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ARF6P62330 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARF6P62330 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARF6P62330 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ARF6P62330 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARF6P62330 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARF6P62330 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARF6P62330 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARF6P62330 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARF6P62330 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARF6P62330 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARF6P62330 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARF6P62330 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARF6P62330 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARF6P62330 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARF6P62330 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARF6P62330 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARF6P62330 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARF6P62330 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARF6P62330 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARF6P62330 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARF6P62330 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARF6P62330 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ARF6P62330 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARF6P62330 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARF6P62330 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARF6P62330 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARF6P62330 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARF6P62330 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARF6P62330 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARF6P62330 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARF6P62330 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARF6P62330 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARF6P62330 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARF6P62330 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARF6P62330 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARF6P62330 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARF6P62330 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARF6P62330 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARF6P62330 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARF6P62330 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARF6P62330 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ARF6P62330 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARF6P62330 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARF6P62330 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ARF6P62330 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARF6P62330 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARF6P62330 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARF6P62330 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms