Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
RPS29P62273 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
RPS29P62273 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
RPS29P62273 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
RPS29P62273 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
RPS29P62273 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
RPS29P62273 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
RPS29P62273 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
RPS29P62273 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
RPS29P62273 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
RPS29P62273 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
RPS29P62273 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
RPS29P62273 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
RPS29P62273 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
RPS29P62273 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
RPS29P62273 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
RPS29P62273 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
RPS29P62273 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
RPS29P62273 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
RPS29P62273 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
RPS29P62273 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
RPS29P62273 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
RPS29P62273 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
RPS29P62273 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
RPS29P62273 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
RPS29P62273 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
RPS29P62273 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
RPS29P62273 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
RPS29P62273 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
RPS29P62273 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
RPS29P62273 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
RPS29P62273 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
RPS29P62273 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
RPS29P62273 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
RPS29P62273 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
RPS29P62273 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
RPS29P62273 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
RPS29P62273 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
RPS29P62273 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
RPS29P62273 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
RPS29P62273 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
RPS29P62273 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
RPS29P62273 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
RPS29P62273 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
RPS29P62273 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
RPS29P62273 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
RPS29P62273 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
RPS29P62273 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
RPS29P62273 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
RPS29P62273 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
RPS29P62273 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
RPS29P62273 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
RPS29P62273 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
RPS29P62273 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
RPS29P62273 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
RPS29P62273 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
RPS29P62273 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
RPS29P62273 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
RPS29P62273 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
RPS29P62273 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
RPS29P62273 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
RPS29P62273 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
RPS29P62273 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
RPS29P62273 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
RPS29P62273 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
RPS29P62273 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
RPS29P62273 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
RPS29P62273 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
RPS29P62273 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
RPS29P62273 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
RPS29P62273 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
RPS29P62273 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
RPS29P62273 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
RPS29P62273 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
RPS29P62273 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
RPS29P62273 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
RPS29P62273 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
RPS29P62273 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
RPS29P62273 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
RPS29P62273 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
RPS29P62273 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
RPS29P62273 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
RPS29P62273 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
RPS29P62273 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
RPS29P62273 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
RPS29P62273 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
RPS29P62273 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
RPS29P62273 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
RPS29P62273 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
RPS29P62273 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
RPS29P62273 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
RPS29P62273 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
RPS29P62273 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
RPS29P62273 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
RPS29P62273 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
RPS29P62273 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
RPS29P62273 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
RPS29P62273 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
RPS29P62273 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
RPS29P62273 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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