Protein–RNA interactions for Protein: P25963

NFKBIA, NF-kappa-B inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIAP25963 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NFKBIAP25963 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NFKBIAP25963 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NFKBIAP25963 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NFKBIAP25963 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NFKBIAP25963 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NFKBIAP25963 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NFKBIAP25963 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NFKBIAP25963 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NFKBIAP25963 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NFKBIAP25963 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NFKBIAP25963 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NFKBIAP25963 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NFKBIAP25963 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NFKBIAP25963 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NFKBIAP25963 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NFKBIAP25963 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NFKBIAP25963 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NFKBIAP25963 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NFKBIAP25963 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NFKBIAP25963 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NFKBIAP25963 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NFKBIAP25963 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NFKBIAP25963 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
NFKBIAP25963 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NFKBIAP25963 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NFKBIAP25963 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NFKBIAP25963 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NFKBIAP25963 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NFKBIAP25963 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NFKBIAP25963 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NFKBIAP25963 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NFKBIAP25963 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NFKBIAP25963 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NFKBIAP25963 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NFKBIAP25963 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NFKBIAP25963 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NFKBIAP25963 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NFKBIAP25963 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NFKBIAP25963 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NFKBIAP25963 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NFKBIAP25963 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NFKBIAP25963 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NFKBIAP25963 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NFKBIAP25963 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NFKBIAP25963 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NFKBIAP25963 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NFKBIAP25963 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NFKBIAP25963 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NFKBIAP25963 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NFKBIAP25963 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NFKBIAP25963 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NFKBIAP25963 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NFKBIAP25963 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NFKBIAP25963 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NFKBIAP25963 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NFKBIAP25963 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NFKBIAP25963 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NFKBIAP25963 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NFKBIAP25963 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NFKBIAP25963 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NFKBIAP25963 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NFKBIAP25963 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NFKBIAP25963 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NFKBIAP25963 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NFKBIAP25963 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NFKBIAP25963 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NFKBIAP25963 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NFKBIAP25963 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NFKBIAP25963 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NFKBIAP25963 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NFKBIAP25963 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NFKBIAP25963 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NFKBIAP25963 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NFKBIAP25963 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NFKBIAP25963 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NFKBIAP25963 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NFKBIAP25963 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NFKBIAP25963 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NFKBIAP25963 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NFKBIAP25963 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NFKBIAP25963 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NFKBIAP25963 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NFKBIAP25963 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NFKBIAP25963 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NFKBIAP25963 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NFKBIAP25963 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NFKBIAP25963 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NFKBIAP25963 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NFKBIAP25963 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NFKBIAP25963 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NFKBIAP25963 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NFKBIAP25963 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NFKBIAP25963 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NFKBIAP25963 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NFKBIAP25963 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NFKBIAP25963 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NFKBIAP25963 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NFKBIAP25963 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NFKBIAP25963 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms