Protein–RNA interactions for Protein: P0DJJ0

SRGAP2C, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 2C, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP2CP0DJJ0 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SRGAP2CP0DJJ0 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SRGAP2CP0DJJ0 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SRGAP2CP0DJJ0 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SRGAP2CP0DJJ0 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SRGAP2CP0DJJ0 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SRGAP2CP0DJJ0 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SRGAP2CP0DJJ0 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SRGAP2CP0DJJ0 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SRGAP2CP0DJJ0 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SRGAP2CP0DJJ0 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SRGAP2CP0DJJ0 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SRGAP2CP0DJJ0 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SRGAP2CP0DJJ0 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SRGAP2CP0DJJ0 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SRGAP2CP0DJJ0 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SRGAP2CP0DJJ0 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SRGAP2CP0DJJ0 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SRGAP2CP0DJJ0 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SRGAP2CP0DJJ0 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SRGAP2CP0DJJ0 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SRGAP2CP0DJJ0 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SRGAP2CP0DJJ0 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SRGAP2CP0DJJ0 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SRGAP2CP0DJJ0 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SRGAP2CP0DJJ0 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SRGAP2CP0DJJ0 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SRGAP2CP0DJJ0 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SRGAP2CP0DJJ0 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SRGAP2CP0DJJ0 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SRGAP2CP0DJJ0 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SRGAP2CP0DJJ0 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SRGAP2CP0DJJ0 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SRGAP2CP0DJJ0 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SRGAP2CP0DJJ0 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SRGAP2CP0DJJ0 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SRGAP2CP0DJJ0 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SRGAP2CP0DJJ0 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SRGAP2CP0DJJ0 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SRGAP2CP0DJJ0 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SRGAP2CP0DJJ0 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SRGAP2CP0DJJ0 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SRGAP2CP0DJJ0 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SRGAP2CP0DJJ0 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SRGAP2CP0DJJ0 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SRGAP2CP0DJJ0 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SRGAP2CP0DJJ0 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SRGAP2CP0DJJ0 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SRGAP2CP0DJJ0 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SRGAP2CP0DJJ0 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SRGAP2CP0DJJ0 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SRGAP2CP0DJJ0 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SRGAP2CP0DJJ0 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SRGAP2CP0DJJ0 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SRGAP2CP0DJJ0 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SRGAP2CP0DJJ0 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SRGAP2CP0DJJ0 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SRGAP2CP0DJJ0 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SRGAP2CP0DJJ0 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SRGAP2CP0DJJ0 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SRGAP2CP0DJJ0 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SRGAP2CP0DJJ0 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SRGAP2CP0DJJ0 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SRGAP2CP0DJJ0 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SRGAP2CP0DJJ0 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SRGAP2CP0DJJ0 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SRGAP2CP0DJJ0 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SRGAP2CP0DJJ0 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SRGAP2CP0DJJ0 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SRGAP2CP0DJJ0 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SRGAP2CP0DJJ0 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SRGAP2CP0DJJ0 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SRGAP2CP0DJJ0 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SRGAP2CP0DJJ0 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SRGAP2CP0DJJ0 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SRGAP2CP0DJJ0 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SRGAP2CP0DJJ0 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SRGAP2CP0DJJ0 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SRGAP2CP0DJJ0 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SRGAP2CP0DJJ0 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SRGAP2CP0DJJ0 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SRGAP2CP0DJJ0 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SRGAP2CP0DJJ0 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SRGAP2CP0DJJ0 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SRGAP2CP0DJJ0 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SRGAP2CP0DJJ0 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SRGAP2CP0DJJ0 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SRGAP2CP0DJJ0 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SRGAP2CP0DJJ0 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SRGAP2CP0DJJ0 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SRGAP2CP0DJJ0 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SRGAP2CP0DJJ0 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SRGAP2CP0DJJ0 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SRGAP2CP0DJJ0 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SRGAP2CP0DJJ0 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SRGAP2CP0DJJ0 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SRGAP2CP0DJJ0 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SRGAP2CP0DJJ0 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SRGAP2CP0DJJ0 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SRGAP2CP0DJJ0 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms