Protein–RNA interactions for Protein: O75396

SEC22B, Vesicle-trafficking protein SEC22b, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22BO75396 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SEC22BO75396 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SEC22BO75396 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SEC22BO75396 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SEC22BO75396 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SEC22BO75396 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SEC22BO75396 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SEC22BO75396 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SEC22BO75396 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SEC22BO75396 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SEC22BO75396 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SEC22BO75396 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SEC22BO75396 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SEC22BO75396 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SEC22BO75396 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SEC22BO75396 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SEC22BO75396 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SEC22BO75396 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SEC22BO75396 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SEC22BO75396 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SEC22BO75396 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SEC22BO75396 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SEC22BO75396 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SEC22BO75396 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
SEC22BO75396 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SEC22BO75396 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SEC22BO75396 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SEC22BO75396 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SEC22BO75396 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SEC22BO75396 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SEC22BO75396 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SEC22BO75396 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SEC22BO75396 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SEC22BO75396 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SEC22BO75396 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SEC22BO75396 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SEC22BO75396 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SEC22BO75396 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SEC22BO75396 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SEC22BO75396 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SEC22BO75396 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SEC22BO75396 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SEC22BO75396 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SEC22BO75396 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SEC22BO75396 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SEC22BO75396 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SEC22BO75396 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SEC22BO75396 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SEC22BO75396 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SEC22BO75396 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SEC22BO75396 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SEC22BO75396 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SEC22BO75396 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SEC22BO75396 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SEC22BO75396 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
SEC22BO75396 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SEC22BO75396 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SEC22BO75396 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SEC22BO75396 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SEC22BO75396 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEC22BO75396 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEC22BO75396 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEC22BO75396 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEC22BO75396 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEC22BO75396 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SEC22BO75396 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SEC22BO75396 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEC22BO75396 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SEC22BO75396 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEC22BO75396 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEC22BO75396 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEC22BO75396 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEC22BO75396 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEC22BO75396 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEC22BO75396 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEC22BO75396 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEC22BO75396 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEC22BO75396 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEC22BO75396 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEC22BO75396 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEC22BO75396 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEC22BO75396 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEC22BO75396 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEC22BO75396 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEC22BO75396 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEC22BO75396 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEC22BO75396 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SEC22BO75396 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEC22BO75396 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEC22BO75396 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEC22BO75396 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEC22BO75396 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEC22BO75396 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEC22BO75396 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEC22BO75396 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEC22BO75396 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEC22BO75396 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEC22BO75396 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEC22BO75396 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SEC22BO75396 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms