Protein–RNA interactions for Protein: O60238

BNIP3L, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3-like, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3LO60238 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BNIP3LO60238 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BNIP3LO60238 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BNIP3LO60238 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BNIP3LO60238 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BNIP3LO60238 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BNIP3LO60238 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BNIP3LO60238 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BNIP3LO60238 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BNIP3LO60238 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BNIP3LO60238 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BNIP3LO60238 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BNIP3LO60238 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BNIP3LO60238 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BNIP3LO60238 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BNIP3LO60238 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BNIP3LO60238 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BNIP3LO60238 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BNIP3LO60238 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BNIP3LO60238 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BNIP3LO60238 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BNIP3LO60238 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BNIP3LO60238 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
BNIP3LO60238 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BNIP3LO60238 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BNIP3LO60238 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BNIP3LO60238 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BNIP3LO60238 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BNIP3LO60238 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BNIP3LO60238 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BNIP3LO60238 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BNIP3LO60238 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BNIP3LO60238 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
BNIP3LO60238 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BNIP3LO60238 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BNIP3LO60238 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BNIP3LO60238 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BNIP3LO60238 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BNIP3LO60238 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
BNIP3LO60238 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BNIP3LO60238 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BNIP3LO60238 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BNIP3LO60238 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BNIP3LO60238 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BNIP3LO60238 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BNIP3LO60238 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BNIP3LO60238 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BNIP3LO60238 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BNIP3LO60238 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BNIP3LO60238 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BNIP3LO60238 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BNIP3LO60238 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BNIP3LO60238 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BNIP3LO60238 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BNIP3LO60238 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BNIP3LO60238 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BNIP3LO60238 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BNIP3LO60238 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BNIP3LO60238 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BNIP3LO60238 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BNIP3LO60238 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BNIP3LO60238 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BNIP3LO60238 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BNIP3LO60238 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BNIP3LO60238 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BNIP3LO60238 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BNIP3LO60238 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BNIP3LO60238 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BNIP3LO60238 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BNIP3LO60238 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BNIP3LO60238 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BNIP3LO60238 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BNIP3LO60238 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BNIP3LO60238 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BNIP3LO60238 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BNIP3LO60238 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BNIP3LO60238 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BNIP3LO60238 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BNIP3LO60238 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BNIP3LO60238 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BNIP3LO60238 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BNIP3LO60238 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BNIP3LO60238 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BNIP3LO60238 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BNIP3LO60238 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BNIP3LO60238 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BNIP3LO60238 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BNIP3LO60238 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BNIP3LO60238 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BNIP3LO60238 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BNIP3LO60238 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BNIP3LO60238 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BNIP3LO60238 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BNIP3LO60238 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BNIP3LO60238 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BNIP3LO60238 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BNIP3LO60238 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BNIP3LO60238 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BNIP3LO60238 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
BNIP3LO60238 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms