Protein–RNA interactions for Protein: O43283

MAP3K13, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 13, humanhuman

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K13O43283 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MAP3K13O43283 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MAP3K13O43283 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MAP3K13O43283 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MAP3K13O43283 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MAP3K13O43283 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MAP3K13O43283 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MAP3K13O43283 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MAP3K13O43283 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MAP3K13O43283 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MAP3K13O43283 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MAP3K13O43283 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MAP3K13O43283 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MAP3K13O43283 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MAP3K13O43283 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
MAP3K13O43283 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
MAP3K13O43283 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MAP3K13O43283 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MAP3K13O43283 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MAP3K13O43283 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MAP3K13O43283 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MAP3K13O43283 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MAP3K13O43283 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MAP3K13O43283 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MAP3K13O43283 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MAP3K13O43283 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MAP3K13O43283 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MAP3K13O43283 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MAP3K13O43283 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MAP3K13O43283 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MAP3K13O43283 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MAP3K13O43283 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MAP3K13O43283 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MAP3K13O43283 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MAP3K13O43283 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MAP3K13O43283 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MAP3K13O43283 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MAP3K13O43283 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MAP3K13O43283 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MAP3K13O43283 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MAP3K13O43283 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MAP3K13O43283 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MAP3K13O43283 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MAP3K13O43283 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MAP3K13O43283 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MAP3K13O43283 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
MAP3K13O43283 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MAP3K13O43283 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MAP3K13O43283 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MAP3K13O43283 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MAP3K13O43283 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
MAP3K13O43283 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MAP3K13O43283 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MAP3K13O43283 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MAP3K13O43283 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MAP3K13O43283 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MAP3K13O43283 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MAP3K13O43283 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MAP3K13O43283 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MAP3K13O43283 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MAP3K13O43283 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MAP3K13O43283 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
MAP3K13O43283 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
MAP3K13O43283 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MAP3K13O43283 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MAP3K13O43283 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MAP3K13O43283 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MAP3K13O43283 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MAP3K13O43283 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MAP3K13O43283 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MAP3K13O43283 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MAP3K13O43283 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MAP3K13O43283 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MAP3K13O43283 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
MAP3K13O43283 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MAP3K13O43283 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
MAP3K13O43283 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MAP3K13O43283 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MAP3K13O43283 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MAP3K13O43283 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MAP3K13O43283 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
MAP3K13O43283 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MAP3K13O43283 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MAP3K13O43283 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MAP3K13O43283 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MAP3K13O43283 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MAP3K13O43283 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MAP3K13O43283 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MAP3K13O43283 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MAP3K13O43283 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MAP3K13O43283 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MAP3K13O43283 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MAP3K13O43283 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MAP3K13O43283 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MAP3K13O43283 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
MAP3K13O43283 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MAP3K13O43283 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MAP3K13O43283 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MAP3K13O43283 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MAP3K13O43283 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms