Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GAPVD1Q14C86 IMPDH1P8-201ENST00000413639 1525 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
GAPVD1Q14C86 BTNL2-201ENST00000374993 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GAPVD1Q14C86 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
GAPVD1Q14C86 LIMK1-208ENST00000538333 2170 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GAPVD1Q14C86 SC5D-208ENST00000534230 1861 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
GAPVD1Q14C86 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
GAPVD1Q14C86 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GAPVD1Q14C86 EPS8L3-201ENST00000361852 2130 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GAPVD1Q14C86 ZNF683-205ENST00000436292 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
GAPVD1Q14C86 CASC4P1-201ENST00000456608 1312 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
GAPVD1Q14C86 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GAPVD1Q14C86 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
GAPVD1Q14C86 MAGEA9B-203ENST00000595065 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GAPVD1Q14C86 DNAJC30-201ENST00000395176 2485 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
GAPVD1Q14C86 PPP3CA-202ENST00000394853 3604 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GAPVD1Q14C86 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
GAPVD1Q14C86 ZNF124-201ENST00000340684 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GAPVD1Q14C86 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GAPVD1Q14C86 SNORA80B-201ENST00000383906 136 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
GAPVD1Q14C86 AL139412.1-201ENST00000441085 523 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GAPVD1Q14C86 LINC01524-202ENST00000454600 745 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GAPVD1Q14C86 BIN3-210ENST00000522268 321 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GAPVD1Q14C86 ODF3-203ENST00000525282 764 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GAPVD1Q14C86 OR7E126P-201ENST00000526217 888 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
GAPVD1Q14C86 AC010601.1-201ENST00000569048 446 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GAPVD1Q14C86 NLK-203ENST00000582037 1503 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GAPVD1Q14C86 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GAPVD1Q14C86 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GAPVD1Q14C86 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GAPVD1Q14C86 ZSCAN29-207ENST00000568898 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GAPVD1Q14C86 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GAPVD1Q14C86 AIFM1P1-201ENST00000413342 1841 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
GAPVD1Q14C86 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GAPVD1Q14C86 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GAPVD1Q14C86 AMD1P4-201ENST00000299540 1345 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
GAPVD1Q14C86 NAA50-203ENST00000477813 1945 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GAPVD1Q14C86 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GAPVD1Q14C86 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GAPVD1Q14C86 TRIT1-202ENST00000372818 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GAPVD1Q14C86 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
GAPVD1Q14C86 ZNF772-209ENST00000615214 1506 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GAPVD1Q14C86 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GAPVD1Q14C86 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GAPVD1Q14C86 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GAPVD1Q14C86 U62317.1-201ENST00000434237 157 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GAPVD1Q14C86 C3orf35-206ENST00000452017 513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GAPVD1Q14C86 RNF139-AS1-202ENST00000519861 359 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GAPVD1Q14C86 CHCHD10-204ENST00000520222 384 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GAPVD1Q14C86 TPD52L1-206ENST00000524679 915 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GAPVD1Q14C86 AP001775.1-201ENST00000532608 586 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
GAPVD1Q14C86 PSMB3-211ENST00000619426 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GAPVD1Q14C86 AC010325.1-203ENST00000636757 380 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GAPVD1Q14C86 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GAPVD1Q14C86 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GAPVD1Q14C86 SQSTM1-201ENST00000360718 2253 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GAPVD1Q14C86 HP-203ENST00000357763 1482 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GAPVD1Q14C86 CCDC149-208ENST00000635206 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GAPVD1Q14C86 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GAPVD1Q14C86 MLPH-202ENST00000338530 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GAPVD1Q14C86 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GAPVD1Q14C86 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GAPVD1Q14C86 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GAPVD1Q14C86 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GAPVD1Q14C86 NRP1-202ENST00000374816 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GAPVD1Q14C86 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GAPVD1Q14C86 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GAPVD1Q14C86 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GAPVD1Q14C86 SIRT4-201ENST00000202967 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GAPVD1Q14C86 NUP85-201ENST00000245544 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GAPVD1Q14C86 LMO7DN-201ENST00000318245 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GAPVD1Q14C86 PMF1-BGLAP-201ENST00000320139 773 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GAPVD1Q14C86 CXorf40B-201ENST00000355203 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GAPVD1Q14C86 RNA5SP469-201ENST00000364165 109 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
GAPVD1Q14C86 SPANXD-201ENST00000370515 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GAPVD1Q14C86 LST1-205ENST00000376089 680 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GAPVD1Q14C86 LST1-206ENST00000376090 689 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GAPVD1Q14C86 LST1-208ENST00000376093 648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GAPVD1Q14C86 LST1-210ENST00000376099 610 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GAPVD1Q14C86 SMIM21-201ENST00000382638 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GAPVD1Q14C86 LST1-214ENST00000418507 726 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GAPVD1Q14C86 SYP-AS1-201ENST00000433499 542 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GAPVD1Q14C86 LST1-217ENST00000438075 764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GAPVD1Q14C86 ESRRAP2-203ENST00000453309 822 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GAPVD1Q14C86 AL358115.1-202ENST00000455257 675 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GAPVD1Q14C86 KIAA1191-211ENST00000533553 560 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GAPVD1Q14C86 AC121757.1-201ENST00000552441 624 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GAPVD1Q14C86 APOC1P1-202ENST00000571466 253 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
GAPVD1Q14C86 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
GAPVD1Q14C86 DDX50-201ENST00000373585 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GAPVD1Q14C86 CCDC32-214ENST00000561011 1577 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GAPVD1Q14C86 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GAPVD1Q14C86 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GAPVD1Q14C86 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GAPVD1Q14C86 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GAPVD1Q14C86 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GAPVD1Q14C86 CARS-AS1-201ENST00000499962 2664 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GAPVD1Q14C86 CES1P1-201ENST00000421606 1704 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
GAPVD1Q14C86 ELP4-225ENST00000640533 1801 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GAPVD1Q14C86 AC073862.5-201ENST00000624129 2027 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
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