RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299540.6

AMD1P4-201, Transcript of adenosylmethionine decarboxylase 1 pseudogene 4, humanhuman

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Gene AMD1P4, Length 1,345 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMD1P4-201ENST00000299540 NISCHQ9Y2I1 1504 aa29.86■■■□□ 2.37
AMD1P4-201ENST00000299540 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa26.34■■□□□ 1.81
AMD1P4-201ENST00000299540 ABCC9O60706 1549 aa25.41■■□□□ 1.66
AMD1P4-201ENST00000299540 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP25.36■■□□□ 1.65
AMD1P4-201ENST00000299540 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP24.96■■□□□ 1.59
AMD1P4-201ENST00000299540 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa24.76■■□□□ 1.55
AMD1P4-201ENST00000299540 MYO15BQ96JP2 1530 aa24.74■■□□□ 1.55
AMD1P4-201ENST00000299540 NACADO15069 1562 aa24.69■■□□□ 1.54
AMD1P4-201ENST00000299540 DCAF8L2P0C7V8 631 aa24.63■■□□□ 1.53
AMD1P4-201ENST00000299540 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa24.59■■□□□ 1.53
AMD1P4-201ENST00000299540 CHIC1Q5VXU3 224 aa24.32■■□□□ 1.48
AMD1P4-201ENST00000299540 UNC13AQ9UPW8 1703 aa24.1■■□□□ 1.45
AMD1P4-201ENST00000299540 SCRIBQ14160 1630 aa24.02■■□□□ 1.44
AMD1P4-201ENST00000299540 BICRAQ9NZM4 1560 aa23.95■■□□□ 1.43
AMD1P4-201ENST00000299540 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP23.82■■□□□ 1.4
AMD1P4-201ENST00000299540 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa23.69■■□□□ 1.38
AMD1P4-201ENST00000299540 CECR2Q9BXF3 1484 aa23.25■■□□□ 1.31
AMD1P4-201ENST00000299540 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
AMD1P4-201ENST00000299540 DNAJC5BQ9UF47 199 aa23.13■■□□□ 1.29
AMD1P4-201ENST00000299540 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP23.07■■□□□ 1.28
AMD1P4-201ENST00000299540 SMARCA4P51532 1647 aa23.07■■□□□ 1.28
AMD1P4-201ENST00000299540 MROH2BQ7Z745 1585 aa23.03■■□□□ 1.28
AMD1P4-201ENST00000299540 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa23.03■■□□□ 1.28
AMD1P4-201ENST00000299540 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
AMD1P4-201ENST00000299540 PEG3Q9GZU2 1588 aa22.89■■□□□ 1.26
AMD1P4-201ENST00000299540 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa22.88■■□□□ 1.25
AMD1P4-201ENST00000299540 NCAPD3P42695 1498 aa22.83■■□□□ 1.25
AMD1P4-201ENST00000299540 SMARCA2P51531 1590 aa22.82■■□□□ 1.24
AMD1P4-201ENST00000299540 WIZO95785 1651 aa22.76■■□□□ 1.23
AMD1P4-201ENST00000299540 HMGXB3Q12766 1538 aa22.71■■□□□ 1.23
AMD1P4-201ENST00000299540 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
AMD1P4-201ENST00000299540 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
AMD1P4-201ENST00000299540 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
AMD1P4-201ENST00000299540 CCDC88BA6NC98 1476 aa22.3■■□□□ 1.16
AMD1P4-201ENST00000299540 CADPSQ9ULU8 1353 aa22.16■■□□□ 1.14
AMD1P4-201ENST00000299540 NESP48681 1621 aa22.14■■□□□ 1.14
AMD1P4-201ENST00000299540 CFTRP13569 1480 aa22.12■■□□□ 1.13
AMD1P4-201ENST00000299540 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa22.11■■□□□ 1.13
AMD1P4-201ENST00000299540 PDS5BQ9NTI5 1447 aa21.92■■□□□ 1.1
AMD1P4-201ENST00000299540 PRDM2Q13029 1718 aa21.91■■□□□ 1.1
AMD1P4-201ENST00000299540 FANCD2Q9BXW9 1451 aa21.87■■□□□ 1.09
AMD1P4-201ENST00000299540 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa21.85■■□□□ 1.09
AMD1P4-201ENST00000299540 ERCC6Q03468 1493 aa21.79■■□□□ 1.08
AMD1P4-201ENST00000299540 CEP164Q9UPV0 1460 aa21.78■■□□□ 1.08
AMD1P4-201ENST00000299540 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP21.73■■□□□ 1.07
AMD1P4-201ENST00000299540 MRC2Q9UBG0 1479 aa21.69■■□□□ 1.06
AMD1P4-201ENST00000299540 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP21.67■■□□□ 1.06
AMD1P4-201ENST00000299540 WDR62O43379 1518 aa21.65■■□□□ 1.06
AMD1P4-201ENST00000299540 TOPBP1Q92547 1522 aa21.59■■□□□ 1.05
AMD1P4-201ENST00000299540 CUX1P39880 1505 aa21.57■■□□□ 1.04
AMD1P4-201ENST00000299540 ABCC8Q09428 1581 aa21.56■■□□□ 1.04
AMD1P4-201ENST00000299540 DNMBPQ6XZF7 1577 aa21.56■■□□□ 1.04
AMD1P4-201ENST00000299540 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
AMD1P4-201ENST00000299540 CUX2O14529 1486 aa21.53■■□□□ 1.04
AMD1P4-201ENST00000299540 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP21.52■■□□□ 1.04
AMD1P4-201ENST00000299540 SYNJ1O43426 1573 aa21.48■■□□□ 1.03
AMD1P4-201ENST00000299540 TOP2BQ02880 1626 aa21.46■■□□□ 1.03
AMD1P4-201ENST00000299540 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa21.46■■□□□ 1.03
AMD1P4-201ENST00000299540 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
AMD1P4-201ENST00000299540 FGD5Q6ZNL6 1462 aa21.4■■□□□ 1.02
AMD1P4-201ENST00000299540 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
AMD1P4-201ENST00000299540 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
AMD1P4-201ENST00000299540 IFT140Q96RY7 1462 aa21.34■■□□□ 1.01
AMD1P4-201ENST00000299540 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa21.33■■□□□ 1
AMD1P4-201ENST00000299540 SOGA1O94964 1423 aa21.32■■□□□ 1
AMD1P4-201ENST00000299540 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa21.26■□□□□ 0.99
AMD1P4-201ENST00000299540 WDR97A6NE52 1622 aa21.25■□□□□ 0.99
AMD1P4-201ENST00000299540 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP21.24■□□□□ 0.99
AMD1P4-201ENST00000299540 TRIM41Q8WV44 630 aa21.19■□□□□ 0.98
AMD1P4-201ENST00000299540 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP21.16■□□□□ 0.98
AMD1P4-201ENST00000299540 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP21.15■□□□□ 0.98
AMD1P4-201ENST00000299540 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP21.13■□□□□ 0.97
AMD1P4-201ENST00000299540 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa21.13■□□□□ 0.97
AMD1P4-201ENST00000299540 GAPVD1Q14C86 1478 aa21.07■□□□□ 0.96
AMD1P4-201ENST00000299540 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa21.03■□□□□ 0.96
AMD1P4-201ENST00000299540 KIF27Q86VH2 1401 aa21.03■□□□□ 0.96
AMD1P4-201ENST00000299540 GRIN2BQ13224 1484 aa21.02■□□□□ 0.96
AMD1P4-201ENST00000299540 PBRM1Q86U86 1689 aa20.98■□□□□ 0.95
AMD1P4-201ENST00000299540 IGF1RP08069 1367 aa20.98■□□□□ 0.95
AMD1P4-201ENST00000299540 ERICH3Q5RHP9 1530 aa20.97■□□□□ 0.95
AMD1P4-201ENST00000299540 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa20.94■□□□□ 0.94
AMD1P4-201ENST00000299540 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP20.94■□□□□ 0.94
AMD1P4-201ENST00000299540 ADAMTS12P58397 1594 aa20.88■□□□□ 0.93
AMD1P4-201ENST00000299540 EEA1Q15075 1411 aa20.87■□□□□ 0.93
AMD1P4-201ENST00000299540 FHAD1B1AJZ9 1412 aa20.86■□□□□ 0.93
AMD1P4-201ENST00000299540 SYNJ2O15056 1496 aa20.84■□□□□ 0.93
AMD1P4-201ENST00000299540 CSRNP3Q8WYN3 585 aa20.81■□□□□ 0.92
AMD1P4-201ENST00000299540 CUL7Q14999 1698 aa20.81■□□□□ 0.92
AMD1P4-201ENST00000299540 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa20.81■□□□□ 0.92
AMD1P4-201ENST00000299540 PRXQ9BXM0 1461 aa20.79■□□□□ 0.92
AMD1P4-201ENST00000299540 CHD1O14646 1710 aa20.78■□□□□ 0.92
AMD1P4-201ENST00000299540 GRIN2AQ12879 1464 aa20.76■□□□□ 0.91
AMD1P4-201ENST00000299540 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP20.76■□□□□ 0.91
AMD1P4-201ENST00000299540 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP20.74■□□□□ 0.91
AMD1P4-201ENST00000299540 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa20.71■□□□□ 0.91
AMD1P4-201ENST00000299540 FBLN2P98095 1184 aa20.71■□□□□ 0.91
AMD1P4-201ENST00000299540 NUP160Q12769 1436 aa20.71■□□□□ 0.91
AMD1P4-201ENST00000299540 OSCARQ8IYS5 282 aa20.68■□□□□ 0.9
AMD1P4-201ENST00000299540 CEP170Q5SW79 1584 aa20.67■□□□□ 0.9
AMD1P4-201ENST00000299540 KIF21BO75037 1637 aa20.64■□□□□ 0.89
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