Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 CRBN-215ENST00000639284 2223 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 ANXA11-202ENST00000372231 6720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 LINC00943-204ENST00000537374 1688 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 RNF213-201ENST00000319921 5316 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 AC139795.2-201ENST00000499900 1751 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 CD27-AS1-209ENST00000545339 1766 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 PRIMPOL-201ENST00000314970 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 SHROOM2P1-201ENST00000434773 2384 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 HNRNPLP1-201ENST00000421896 1501 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 PLAT-211ENST00000524009 1613 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 CSPG4P12-201ENST00000558282 4853 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 SERPING1-203ENST00000378323 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 RIMKLA-202ENST00000431473 8909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 RIN2-202ENST00000440354 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 SMIM21-202ENST00000579022 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 CYP4F12-215ENST00000550308 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 TRPV1-201ENST00000310522 2340 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 ELMOD3-203ENST00000409013 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 NMT2-202ENST00000378165 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 SPOCK3-207ENST00000504953 2900 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 MATN2-218ENST00000524308 3449 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 EGR3-201ENST00000317216 4336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 PTGER3-206ENST00000370924 6982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 DOCK6-201ENST00000294618 6358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 SETD3-204ENST00000436070 2592 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 NCBP2L-202ENST00000639756 1953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 EDEM2-201ENST00000374491 1756 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 GPN1-211ENST00000610189 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 SLIT2-202ENST00000503823 5233 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 NCF4-201ENST00000248899 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 PTPN1-201ENST00000371621 4008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 GRIK1-203ENST00000389125 3140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 GGA1-201ENST00000325180 2528 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 CPSF6-201ENST00000266679 2229 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 ARHGEF9-235ENST00000637723 2146 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 ZKSCAN1-202ENST00000426572 2011 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 AC092902.5-201ENST00000641650 3256 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 DLGAP2-AS1-201ENST00000518009 1810 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 GLYR1-212ENST00000591451 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 KRT42P-202ENST00000438131 2895 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 MEG3-214ENST00000519709 1726 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 IRS4-201ENST00000372129 3928 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 LINC01447-201ENST00000429010 2761 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 AC006144.1-201ENST00000424220 1600 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 PIM1-201ENST00000373509 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 CNTROB-202ENST00000563694 3705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 DRD3-201ENST00000295881 1541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 FAM131A-211ENST00000639617 4450 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 FAM46A-202ENST00000369754 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 ATAT1-202ENST00000319027 2061 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 CAGE1-201ENST00000296742 2821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
SMIM3Q9BZL3 AC090136.3-201ENST00000520834 2704 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 CSAD-201ENST00000267085 2645 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 AC134682.1-201ENST00000569285 3377 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 PTPRS-201ENST00000262963 4766 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 PTPRS-210ENST00000592099 4766 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 RHBDL3-203ENST00000536287 4470 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 RANGAP1-201ENST00000356244 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 TBC1D3P5-203ENST00000586223 3083 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 ASPH-205ENST00000445642 3717 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 PHF10-206ENST00000621772 1651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 TIGAR-204ENST00000635110 3633 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 AC241952.1-201ENST00000612480 6897 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 COL20A1-201ENST00000358894 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 AC005906.2-201ENST00000640877 3408 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 WDR41-201ENST00000296679 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 PIK3R5-218ENST00000611902 4339 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 MTHFSD-201ENST00000360900 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 RFX5-202ENST00000368870 2459 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
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