Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 FO393412.1-201ENST00000619841 382 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
SGCZQ96LD1 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
SGCZQ96LD1 OR2T11-201ENST00000625105 1072 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SGCZQ96LD1 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SGCZQ96LD1 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SGCZQ96LD1 LARP4-201ENST00000293618 6296 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SGCZQ96LD1 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SGCZQ96LD1 CTSV-201ENST00000259470 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SGCZQ96LD1 NFE2L1-218ENST00000583378 2051 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SGCZQ96LD1 LINC01341-202ENST00000421003 2600 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SGCZQ96LD1 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SGCZQ96LD1 NRROS-201ENST00000328557 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SGCZQ96LD1 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SGCZQ96LD1 KRT8P25-201ENST00000473150 1456 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
SGCZQ96LD1 DRD2-204ENST00000538967 1493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SGCZQ96LD1 SERPINH1-205ENST00000525876 2283 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SGCZQ96LD1 GFAP-214ENST00000588735 6538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SGCZQ96LD1 ABI2-202ENST00000261017 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SGCZQ96LD1 USP47-202ENST00000339865 7775 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SGCZQ96LD1 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SGCZQ96LD1 ALPL-206ENST00000539907 2241 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SGCZQ96LD1 AL805961.2-201ENST00000642139 4817 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
SGCZQ96LD1 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SGCZQ96LD1 TRO-225ENST00000622017 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SGCZQ96LD1 SPTBN2-201ENST00000309996 7866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SGCZQ96LD1 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SGCZQ96LD1 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SGCZQ96LD1 MKRN2-203ENST00000448482 1679 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SGCZQ96LD1 ATG9B-203ENST00000469530 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SGCZQ96LD1 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SGCZQ96LD1 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SGCZQ96LD1 LINC02537-201ENST00000635943 1367 ntTSL 4 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SGCZQ96LD1 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SGCZQ96LD1 SPOUT1-201ENST00000361256 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SGCZQ96LD1 CFAP74-209ENST00000493964 5247 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SGCZQ96LD1 COL6A3-202ENST00000347401 8625 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SGCZQ96LD1 COL6A3-209ENST00000472056 8628 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SGCZQ96LD1 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SGCZQ96LD1 RNF216-205ENST00000425013 5639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SGCZQ96LD1 LRRC8A-203ENST00000372600 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SGCZQ96LD1 MAP7D3-201ENST00000316077 4567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SGCZQ96LD1 ASS1-203ENST00000372393 1548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SGCZQ96LD1 LDB3-202ENST00000361373 5297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SGCZQ96LD1 EPB42-210ENST00000622454 2227 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SGCZQ96LD1 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SGCZQ96LD1 AHI1-201ENST00000265602 4335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SGCZQ96LD1 ALG11-204ENST00000616513 1983 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SGCZQ96LD1 AC022080.1-201ENST00000366255 781 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
SGCZQ96LD1 UQCC2-201ENST00000374214 432 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SGCZQ96LD1 HCG9-201ENST00000376800 663 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SGCZQ96LD1 SERF2-204ENST00000402131 586 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SGCZQ96LD1 LINC01656-201ENST00000415702 630 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SGCZQ96LD1 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
SGCZQ96LD1 AL591242.1-201ENST00000422284 343 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SGCZQ96LD1 AC006372.2-201ENST00000433660 292 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SGCZQ96LD1 LINC00892-203ENST00000454385 686 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SGCZQ96LD1 AL928742.1-201ENST00000497397 548 ntTSL 4 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SGCZQ96LD1 LINC02228-201ENST00000507600 534 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SGCZQ96LD1 AC087203.1-201ENST00000532111 1181 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
SGCZQ96LD1 CYB561A3-208ENST00000536915 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SGCZQ96LD1 CR383656.13-201ENST00000550928 563 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SGCZQ96LD1 AL512310.10-201ENST00000555580 563 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SGCZQ96LD1 AL139316.1-201ENST00000555643 568 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SGCZQ96LD1 HNRNPA1P5-201ENST00000558213 966 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
SGCZQ96LD1 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SGCZQ96LD1 HIST2H4A-201ENST00000578186 583 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SGCZQ96LD1 ETV4-208ENST00000586826 917 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SGCZQ96LD1 C19orf53-202ENST00000588234 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SGCZQ96LD1 AL160191.2-201ENST00000603975 601 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
SGCZQ96LD1 AC126755.5-201ENST00000622756 267 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
SGCZQ96LD1 ESR1-214ENST00000638569 132 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SGCZQ96LD1 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SGCZQ96LD1 CRY2-202ENST00000443527 4203 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SGCZQ96LD1 NCAPG-201ENST00000251496 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SGCZQ96LD1 USP19-207ENST00000434032 4677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SGCZQ96LD1 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SGCZQ96LD1 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SGCZQ96LD1 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SGCZQ96LD1 TXLNA-201ENST00000373609 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SGCZQ96LD1 PPP1R15B-201ENST00000367188 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SGCZQ96LD1 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SGCZQ96LD1 POM121L4P-202ENST00000427789 1891 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
SGCZQ96LD1 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SGCZQ96LD1 ALG11-203ENST00000523764 1404 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SGCZQ96LD1 NDUFA10-201ENST00000252711 4915 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SGCZQ96LD1 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SGCZQ96LD1 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SGCZQ96LD1 STXBP6-202ENST00000396700 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SGCZQ96LD1 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SGCZQ96LD1 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SGCZQ96LD1 CYFIP2-219ENST00000616178 4210 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SGCZQ96LD1 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SGCZQ96LD1 DUSP10-201ENST00000366899 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SGCZQ96LD1 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SGCZQ96LD1 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SGCZQ96LD1 FKBP4P8-201ENST00000610931 1369 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
SGCZQ96LD1 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SGCZQ96LD1 NT5DC4-201ENST00000327581 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SGCZQ96LD1 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SGCZQ96LD1 AC104129.1-202ENST00000480694 4481 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
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