Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

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Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 FUT3-201ENST00000303225 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 SLC5A11-211ENST00000569071 1919 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 CNN2-202ENST00000348419 2033 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 MSH2-206ENST00000543555 3024 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 ADD1-207ENST00000446856 3745 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 RBP1-201ENST00000232219 898 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 NDUFB11-201ENST00000276062 948 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 KRTAP10-8-201ENST00000334662 876 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 HNRNPABP1-201ENST00000406003 734 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 AL450322.2-201ENST00000421629 759 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 AC069257.3-201ENST00000431391 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 ATP5G1P7-201ENST00000444398 400 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 SCOC-209ENST00000512749 841 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 EGLN3-209ENST00000553215 1004 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 CIRBP-AS1-201ENST00000585832 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 AC026304.1-201ENST00000597953 561 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 PDLIM2-218ENST00000614502 599 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 RBP1-206ENST00000617459 667 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 AC073592.10-201ENST00000624789 597 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 SULT1A3-202ENST00000395138 1326 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 SPC25-201ENST00000282074 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 AL591368.1-201ENST00000437181 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 AC009093.9-201ENST00000566038 1611 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 DDX19B-208ENST00000563392 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 NDUFAF6-201ENST00000396111 1869 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 CNTD1-204ENST00000588408 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 IGHG4-202ENST00000641978 2597 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 MAGEB1-201ENST00000378981 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 AL356583.1-201ENST00000398739 1371 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 PRDX1-202ENST00000319248 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 GSTM1-204ENST00000369823 852 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 NAA10-205ENST00000393712 908 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 AC099681.2-201ENST00000449899 543 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 RASGRF2-AS1-202ENST00000505694 535 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 AC032044.1-201ENST00000570924 570 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 Z93930.2-203ENST00000585003 516 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 AL512631.1-201ENST00000604086 840 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 AC007274.3-201ENST00000619838 385 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 IKBKE-201ENST00000578328 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 ZDHHC8P1-202ENST00000418264 1403 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 SERPINE3-203ENST00000521255 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 TACR1-202ENST00000409848 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 C2orf27AP2-201ENST00000438438 555 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 OR52X1P-201ENST00000446117 914 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 AC002066.1-201ENST00000446355 514 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 AC005042.2-201ENST00000449526 510 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 AC023157.1-201ENST00000453713 402 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 CHCHD2P6-201ENST00000454346 447 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 SLC25A51P3-201ENST00000521814 889 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 AC010547.1-202ENST00000567341 230 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 BCAS4-206ENST00000609336 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 EFEMP1-201ENST00000355426 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 ZNF683-205ENST00000436292 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 OLAH-203ENST00000378228 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 SLC29A4-201ENST00000297195 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 TARS2-205ENST00000438568 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 NBEAP3-201ENST00000420638 1493 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 CPT1A-202ENST00000376618 2635 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 ARSG-209ENST00000621439 2599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 MRPL17-201ENST00000288937 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 FAM156A-223ENST00000623782 1931 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 CHMP4C-201ENST00000297265 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 APTX-201ENST00000309615 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 LUC7L-203ENST00000397780 1335 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 TNNT2-201ENST00000236918 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 RHCE-203ENST00000346452 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 OR7E122P-201ENST00000383606 1017 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA1SQ13698 MYH9-202ENST00000401701 789 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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