Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
VPREB1P12018 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
VPREB1P12018 LMO1-201ENST00000335790 1279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
VPREB1P12018 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
VPREB1P12018 AC106827.1-201ENST00000366454 431 ntBASIC8.81□□□□□ -1
VPREB1P12018 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
VPREB1P12018 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC8.81□□□□□ -1
VPREB1P12018 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC8.81□□□□□ -1
VPREB1P12018 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
VPREB1P12018 C3orf35-206ENST00000452017 513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
VPREB1P12018 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC8.81□□□□□ -1
VPREB1P12018 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC8.81□□□□□ -1
VPREB1P12018 COQ10BP2-201ENST00000513804 724 ntBASIC8.81□□□□□ -1
VPREB1P12018 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC8.81□□□□□ -1
VPREB1P12018 PFDN1-207ENST00000524074 395 ntTSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
VPREB1P12018 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
VPREB1P12018 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
VPREB1P12018 LMO1-204ENST00000534484 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
VPREB1P12018 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC8.81□□□□□ -1
VPREB1P12018 CRADD-205ENST00000548483 1056 ntTSL 2 BASIC8.81□□□□□ -1
VPREB1P12018 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC8.81□□□□□ -1
VPREB1P12018 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC8.81□□□□□ -1
VPREB1P12018 ADSSL1-208ENST00000555674 520 ntTSL 3 BASIC8.81□□□□□ -1
VPREB1P12018 DNM1P51-201ENST00000558149 522 ntBASIC8.81□□□□□ -1
VPREB1P12018 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC8.81□□□□□ -1
VPREB1P12018 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC8.81□□□□□ -1
VPREB1P12018 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.81□□□□□ -1
VPREB1P12018 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC8.81□□□□□ -1
VPREB1P12018 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC8.81□□□□□ -1
VPREB1P12018 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
VPREB1P12018 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
VPREB1P12018 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC8.81□□□□□ -1
VPREB1P12018 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
VPREB1P12018 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
VPREB1P12018 HTR4-213ENST00000631296 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
VPREB1P12018 ABCC4-206ENST00000536256 2840 ntTSL 2 BASIC8.81□□□□□ -1
VPREB1P12018 HRC-201ENST00000252825 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
VPREB1P12018 AC021752.1-202ENST00000613161 2398 ntTSL 2 BASIC8.81□□□□□ -1
VPREB1P12018 DMTF1-202ENST00000394703 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
VPREB1P12018 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC8.81□□□□□ -1
VPREB1P12018 KIAA1549-202ENST00000440172 12379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
VPREB1P12018 SLCO2A1-208ENST00000493729 1918 ntTSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
VPREB1P12018 SMARCA2-254ENST00000636903 2471 ntTSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
VPREB1P12018 TMEM182-202ENST00000409528 3112 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
VPREB1P12018 HOXA7-201ENST00000242159 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
VPREB1P12018 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC8.81□□□□□ -1
VPREB1P12018 PTPN5-203ENST00000396168 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
VPREB1P12018 COL6A2-204ENST00000409416 3430 ntTSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
VPREB1P12018 INSC-205ENST00000525218 1576 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
VPREB1P12018 AC010336.1-201ENST00000539278 4739 ntBASIC8.81□□□□□ -1
VPREB1P12018 ZBED8-201ENST00000408953 2851 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.81□□□□□ -1
VPREB1P12018 DDC-212ENST00000615193 1674 ntTSL 3 BASIC8.81□□□□□ -1
VPREB1P12018 SNX25-201ENST00000264694 3264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
VPREB1P12018 VDR-201ENST00000229022 4773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
VPREB1P12018 SLC28A1-201ENST00000286749 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
VPREB1P12018 MRPS16-202ENST00000372945 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
VPREB1P12018 CELF2-216ENST00000637215 2724 ntTSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
VPREB1P12018 ARHGEF33-201ENST00000398800 4300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
VPREB1P12018 PCMTD1-208ENST00000544451 3697 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
VPREB1P12018 SEZ6L-203ENST00000360929 6307 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
VPREB1P12018 ZNF654-204ENST00000636215 6446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
VPREB1P12018 AKR1C8P-201ENST00000578467 2182 ntTSL 2 BASIC8.8□□□□□ -1
VPREB1P12018 NPTN-IT1-201ENST00000628401 2283 ntBASIC8.8□□□□□ -1
VPREB1P12018 NR3C1-204ENST00000394466 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
VPREB1P12018 TTC4-201ENST00000371281 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
VPREB1P12018 LINC02347-203ENST00000540774 1442 ntTSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
VPREB1P12018 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC8.8□□□□□ -1
VPREB1P12018 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC8.8□□□□□ -1
VPREB1P12018 SRP72-205ENST00000510663 2473 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
VPREB1P12018 TBC1D8-AS1-201ENST00000610202 2478 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
VPREB1P12018 LINC02228-202ENST00000641261 2489 ntBASIC8.8□□□□□ -1
VPREB1P12018 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
VPREB1P12018 AC106788.1-201ENST00000550753 2661 ntTSL 2 BASIC8.8□□□□□ -1
VPREB1P12018 MYRF-202ENST00000278836 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
VPREB1P12018 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
VPREB1P12018 STXBP5L-201ENST00000273666 9496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
VPREB1P12018 CUL4A-203ENST00000375441 4037 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
VPREB1P12018 PES1P2-201ENST00000449745 1735 ntBASIC8.8□□□□□ -1
VPREB1P12018 SPTBN2-210ENST00000611817 2890 ntTSL 2 BASIC8.8□□□□□ -1
VPREB1P12018 ABR-202ENST00000302538 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
VPREB1P12018 GREB1-206ENST00000396123 5296 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
VPREB1P12018 FAM214B-205ENST00000488109 2999 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
VPREB1P12018 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC8.8□□□□□ -1
VPREB1P12018 LEPROTL1-201ENST00000321250 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
VPREB1P12018 ZSCAN32-203ENST00000396852 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
VPREB1P12018 AC009159.4-201ENST00000624606 2031 ntBASIC8.8□□□□□ -1
VPREB1P12018 TTK-201ENST00000230510 3477 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.8□□□□□ -1
VPREB1P12018 AL133387.2-201ENST00000422661 2222 ntTSL 2 BASIC8.8□□□□□ -1
VPREB1P12018 PPP4R3B-206ENST00000616407 4385 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
VPREB1P12018 NCBP1-202ENST00000375147 5178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
VPREB1P12018 SH2D3C-201ENST00000314830 3124 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
VPREB1P12018 SLX4-201ENST00000294008 7307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
VPREB1P12018 CNTNAP5-202ENST00000431078 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
VPREB1P12018 ABL2-204ENST00000502732 12144 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
VPREB1P12018 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
VPREB1P12018 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
VPREB1P12018 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
VPREB1P12018 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
VPREB1P12018 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC8.8□□□□□ -1
VPREB1P12018 IGHV1-3-201ENST00000390595 395 ntAPPRIS P1 BASIC8.8□□□□□ -1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 128.2 ms