RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000371281.3

TTC4-201, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTC4, Length 2,395 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC4-201ENST00000371281 NISCHQ9Y2I1 1504 aa29.77■■■□□ 2.36
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TTC4-201ENST00000371281 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
TTC4-201ENST00000371281 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa24.64■■□□□ 1.53
TTC4-201ENST00000371281 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa24.46■■□□□ 1.51
TTC4-201ENST00000371281 DCAF8L2P0C7V8 631 aa24.35■■□□□ 1.49
TTC4-201ENST00000371281 MYO15BQ96JP2 1530 aa24.21■■□□□ 1.47
TTC4-201ENST00000371281 ABCC9O60706 1549 aa24.06■■□□□ 1.44
TTC4-201ENST00000371281 NACADO15069 1562 aa23.95■■□□□ 1.42
TTC4-201ENST00000371281 SCRIBQ14160 1630 aa23.78■■□□□ 1.4
TTC4-201ENST00000371281 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP23.68■■□□□ 1.38
TTC4-201ENST00000371281 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa23.66■■□□□ 1.38
TTC4-201ENST00000371281 UNC13AQ9UPW8 1703 aa23.28■■□□□ 1.32
TTC4-201ENST00000371281 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
TTC4-201ENST00000371281 CECR2Q9BXF3 1484 aa23.1■■□□□ 1.29
TTC4-201ENST00000371281 MROH2BQ7Z745 1585 aa23.02■■□□□ 1.28
TTC4-201ENST00000371281 BICRAQ9NZM4 1560 aa22.99■■□□□ 1.27
TTC4-201ENST00000371281 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
TTC4-201ENST00000371281 CHIC1Q5VXU3 224 aa22.89■■□□□ 1.26
TTC4-201ENST00000371281 WIZO95785 1651 aa22.87■■□□□ 1.25
TTC4-201ENST00000371281 SMARCA4P51532 1647 aa22.83■■□□□ 1.25
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TTC4-201ENST00000371281 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
TTC4-201ENST00000371281 PEG3Q9GZU2 1588 aa22.55■■□□□ 1.2
TTC4-201ENST00000371281 SMARCA2P51531 1590 aa22.44■■□□□ 1.18
TTC4-201ENST00000371281 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
TTC4-201ENST00000371281 CCDC88BA6NC98 1476 aa22.38■■□□□ 1.17
TTC4-201ENST00000371281 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa22.34■■□□□ 1.17
TTC4-201ENST00000371281 TRIM41Q8WV44 630 aa22.24■■□□□ 1.15
TTC4-201ENST00000371281 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
TTC4-201ENST00000371281 HMGXB3Q12766 1538 aa22.12■■□□□ 1.13
TTC4-201ENST00000371281 NCAPD3P42695 1498 aa22.08■■□□□ 1.13
TTC4-201ENST00000371281 ABCC8Q09428 1581 aa22.04■■□□□ 1.12
TTC4-201ENST00000371281 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa22.01■■□□□ 1.11
TTC4-201ENST00000371281 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
TTC4-201ENST00000371281 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP21.82■■□□□ 1.08
TTC4-201ENST00000371281 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa21.82■■□□□ 1.08
TTC4-201ENST00000371281 SYNJ1O43426 1573 aa21.77■■□□□ 1.08
TTC4-201ENST00000371281 PRDM2Q13029 1718 aa21.7■■□□□ 1.06
TTC4-201ENST00000371281 EEA1Q15075 1411 aa21.7■■□□□ 1.06
TTC4-201ENST00000371281 CFTRP13569 1480 aa21.69■■□□□ 1.06
TTC4-201ENST00000371281 SOGA1O94964 1423 aa21.67■■□□□ 1.06
TTC4-201ENST00000371281 TOP2BQ02880 1626 aa21.65■■□□□ 1.06
TTC4-201ENST00000371281 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa21.65■■□□□ 1.06
TTC4-201ENST00000371281 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa21.58■■□□□ 1.05
TTC4-201ENST00000371281 CADPSQ9ULU8 1353 aa21.52■■□□□ 1.04
TTC4-201ENST00000371281 CUX1P39880 1505 aa21.51■■□□□ 1.03
TTC4-201ENST00000371281 CSRNP3Q8WYN3 585 aa21.51■■□□□ 1.03
TTC4-201ENST00000371281 EHMT2Q96KQ7 1210 aa21.5■■□□□ 1.03
TTC4-201ENST00000371281 KIF21BO75037 1637 aa21.44■■□□□ 1.02
TTC4-201ENST00000371281 GOLGA3Q08378 1498 aa21.42■■□□□ 1.02
TTC4-201ENST00000371281 TNIKQ9UKE5 1360 aa21.41■■□□□ 1.02
TTC4-201ENST00000371281 CEP164Q9UPV0 1460 aa21.38■■□□□ 1.01
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TTC4-201ENST00000371281 CEP162Q5TB80 1403 aa21.32■■□□□ 1
TTC4-201ENST00000371281 FANCD2Q9BXW9 1451 aa21.3■■□□□ 1
TTC4-201ENST00000371281 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa21.3■■□□□ 1
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TTC4-201ENST00000371281 DNMBPQ6XZF7 1577 aa21.21■□□□□ 0.99
TTC4-201ENST00000371281 PRXQ9BXM0 1461 aa21.21■□□□□ 0.99
TTC4-201ENST00000371281 FGD5Q6ZNL6 1462 aa21.2■□□□□ 0.98
TTC4-201ENST00000371281 TOPBP1Q92547 1522 aa21.13■□□□□ 0.97
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TTC4-201ENST00000371281 CUX2O14529 1486 aa21.11■□□□□ 0.97
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TTC4-201ENST00000371281 CLIP1P30622 1438 aa21.07■□□□□ 0.96
TTC4-201ENST00000371281 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa21.05■□□□□ 0.96
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TTC4-201ENST00000371281 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP21.05■□□□□ 0.96
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TTC4-201ENST00000371281 MRC2Q9UBG0 1479 aa20.82■□□□□ 0.92
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TTC4-201ENST00000371281 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP20.7■□□□□ 0.9
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TTC4-201ENST00000371281 APLP2Q06481 763 aa20.66■□□□□ 0.9
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TTC4-201ENST00000371281 IFT140Q96RY7 1462 aa20.61■□□□□ 0.89
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TTC4-201ENST00000371281 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
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