Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULR0

ISY1, Pre-mRNA-splicing factor ISY1 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ISY1Q9ULR0 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ISY1Q9ULR0 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ISY1Q9ULR0 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ISY1Q9ULR0 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ISY1Q9ULR0 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ISY1Q9ULR0 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ISY1Q9ULR0 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ISY1Q9ULR0 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ISY1Q9ULR0 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ISY1Q9ULR0 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ISY1Q9ULR0 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ISY1Q9ULR0 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ISY1Q9ULR0 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ISY1Q9ULR0 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ISY1Q9ULR0 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ISY1Q9ULR0 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ISY1Q9ULR0 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ISY1Q9ULR0 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
ISY1Q9ULR0 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ISY1Q9ULR0 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ISY1Q9ULR0 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ISY1Q9ULR0 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ISY1Q9ULR0 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ISY1Q9ULR0 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ISY1Q9ULR0 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ISY1Q9ULR0 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ISY1Q9ULR0 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ISY1Q9ULR0 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ISY1Q9ULR0 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ISY1Q9ULR0 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ISY1Q9ULR0 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ISY1Q9ULR0 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ISY1Q9ULR0 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ISY1Q9ULR0 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ISY1Q9ULR0 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ISY1Q9ULR0 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ISY1Q9ULR0 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ISY1Q9ULR0 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ISY1Q9ULR0 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ISY1Q9ULR0 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ISY1Q9ULR0 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
ISY1Q9ULR0 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
ISY1Q9ULR0 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
ISY1Q9ULR0 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
ISY1Q9ULR0 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
ISY1Q9ULR0 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ISY1Q9ULR0 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ISY1Q9ULR0 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
ISY1Q9ULR0 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ISY1Q9ULR0 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ISY1Q9ULR0 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ISY1Q9ULR0 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ISY1Q9ULR0 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ISY1Q9ULR0 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ISY1Q9ULR0 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ISY1Q9ULR0 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ISY1Q9ULR0 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ISY1Q9ULR0 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ISY1Q9ULR0 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ISY1Q9ULR0 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ISY1Q9ULR0 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ISY1Q9ULR0 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ISY1Q9ULR0 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ISY1Q9ULR0 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ISY1Q9ULR0 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ISY1Q9ULR0 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ISY1Q9ULR0 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
ISY1Q9ULR0 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
ISY1Q9ULR0 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ISY1Q9ULR0 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ISY1Q9ULR0 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ISY1Q9ULR0 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ISY1Q9ULR0 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ISY1Q9ULR0 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ISY1Q9ULR0 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
ISY1Q9ULR0 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ISY1Q9ULR0 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ISY1Q9ULR0 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ISY1Q9ULR0 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ISY1Q9ULR0 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ISY1Q9ULR0 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ISY1Q9ULR0 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ISY1Q9ULR0 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ISY1Q9ULR0 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ISY1Q9ULR0 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ISY1Q9ULR0 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ISY1Q9ULR0 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ISY1Q9ULR0 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ISY1Q9ULR0 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ISY1Q9ULR0 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ISY1Q9ULR0 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ISY1Q9ULR0 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ISY1Q9ULR0 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ISY1Q9ULR0 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ISY1Q9ULR0 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ISY1Q9ULR0 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
ISY1Q9ULR0 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ISY1Q9ULR0 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ISY1Q9ULR0 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ISY1Q9ULR0 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms