Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGM1

CHRNA9, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA9Q9UGM1 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHRNA9Q9UGM1 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CHRNA9Q9UGM1 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHRNA9Q9UGM1 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHRNA9Q9UGM1 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHRNA9Q9UGM1 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHRNA9Q9UGM1 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHRNA9Q9UGM1 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHRNA9Q9UGM1 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CHRNA9Q9UGM1 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHRNA9Q9UGM1 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHRNA9Q9UGM1 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHRNA9Q9UGM1 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHRNA9Q9UGM1 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHRNA9Q9UGM1 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHRNA9Q9UGM1 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHRNA9Q9UGM1 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHRNA9Q9UGM1 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHRNA9Q9UGM1 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHRNA9Q9UGM1 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CHRNA9Q9UGM1 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHRNA9Q9UGM1 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CHRNA9Q9UGM1 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHRNA9Q9UGM1 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHRNA9Q9UGM1 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHRNA9Q9UGM1 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHRNA9Q9UGM1 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHRNA9Q9UGM1 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHRNA9Q9UGM1 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHRNA9Q9UGM1 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHRNA9Q9UGM1 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHRNA9Q9UGM1 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHRNA9Q9UGM1 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHRNA9Q9UGM1 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHRNA9Q9UGM1 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHRNA9Q9UGM1 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHRNA9Q9UGM1 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHRNA9Q9UGM1 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHRNA9Q9UGM1 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHRNA9Q9UGM1 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHRNA9Q9UGM1 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHRNA9Q9UGM1 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHRNA9Q9UGM1 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHRNA9Q9UGM1 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHRNA9Q9UGM1 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHRNA9Q9UGM1 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHRNA9Q9UGM1 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CHRNA9Q9UGM1 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHRNA9Q9UGM1 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHRNA9Q9UGM1 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHRNA9Q9UGM1 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHRNA9Q9UGM1 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHRNA9Q9UGM1 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHRNA9Q9UGM1 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHRNA9Q9UGM1 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHRNA9Q9UGM1 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHRNA9Q9UGM1 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHRNA9Q9UGM1 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHRNA9Q9UGM1 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHRNA9Q9UGM1 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHRNA9Q9UGM1 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHRNA9Q9UGM1 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHRNA9Q9UGM1 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHRNA9Q9UGM1 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHRNA9Q9UGM1 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHRNA9Q9UGM1 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHRNA9Q9UGM1 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHRNA9Q9UGM1 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHRNA9Q9UGM1 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHRNA9Q9UGM1 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHRNA9Q9UGM1 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHRNA9Q9UGM1 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHRNA9Q9UGM1 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHRNA9Q9UGM1 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHRNA9Q9UGM1 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHRNA9Q9UGM1 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHRNA9Q9UGM1 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHRNA9Q9UGM1 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHRNA9Q9UGM1 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHRNA9Q9UGM1 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHRNA9Q9UGM1 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHRNA9Q9UGM1 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHRNA9Q9UGM1 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHRNA9Q9UGM1 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHRNA9Q9UGM1 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHRNA9Q9UGM1 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHRNA9Q9UGM1 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHRNA9Q9UGM1 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHRNA9Q9UGM1 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHRNA9Q9UGM1 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHRNA9Q9UGM1 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHRNA9Q9UGM1 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHRNA9Q9UGM1 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHRNA9Q9UGM1 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CHRNA9Q9UGM1 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHRNA9Q9UGM1 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CHRNA9Q9UGM1 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHRNA9Q9UGM1 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHRNA9Q9UGM1 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHRNA9Q9UGM1 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms