Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRD0

BUD13, BUD13 homolog, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BUD13Q9BRD0 METTL13-207ENST00000485629 759 ntTSL 520.19■□□□□ 0.829e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 MTMR10-203ENST00000564787 631 ntTSL 520.13■□□□□ 0.819e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.89e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.783e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.787e-7■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 TRAPPC3-207ENST00000497251 715 ntTSL 219.89■□□□□ 0.771e-7■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 IL17RC-204ENST00000412901 1354 ntTSL 219.88■□□□□ 0.771e-7■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 DYRK2-201ENST00000319833 566 ntTSL 319.88■□□□□ 0.779e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.779e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 NTHL1-208ENST00000567727 568 ntTSL 219.85■□□□□ 0.779e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 NCAPD3-210ENST00000533155 727 ntTSL 319.82■□□□□ 0.761e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 RASSF3-201ENST00000283172 1099 ntTSL 219.81■□□□□ 0.769e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 IL17RC-208ENST00000434756 946 ntTSL 519.77■□□□□ 0.761e-7■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.759e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 PKN1-214ENST00000592794 322 ntTSL 419.68■□□□□ 0.749e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 FBXW4-202ENST00000457105 630 ntTSL 519.63■□□□□ 0.739e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.737e-7■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 GNB5-212ENST00000561313 586 ntTSL 419.61■□□□□ 0.739e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 NTHL1-207ENST00000566380 814 ntTSL 319.6■□□□□ 0.739e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.737e-7■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 TBX2-AS1-205ENST00000592009 330 ntTSL 319.55■□□□□ 0.729e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.729e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 CDC42BPB-205ENST00000559245 738 ntTSL 219.44■□□□□ 0.71e-10■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 PPFIA3-202ENST00000421230 2236 ntTSL 219.43■□□□□ 0.79e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 IL17RC-219ENST00000466046 2547 ntTSL 219.41■□□□□ 0.77e-7■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 ASPDH-207ENST00000601207 637 ntTSL 319.36■□□□□ 0.699e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.679e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.679e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.671e-7■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.669e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.669e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 CDC42BPB-203ENST00000558867 635 ntTSL 319.12■□□□□ 0.651e-10■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 RNF31-208ENST00000558907 777 ntTSL 319.01■□□□□ 0.631e-10■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.639e-7■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.629e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.623e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.69e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.69e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 STK11IP-206ENST00000465230 771 ntTSL 318.75■□□□□ 0.599e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 PSMB4-206ENST00000495288 986 ntTSL 218.57■□□□□ 0.563e-15■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 BLCAP-213ENST00000467603 439 ntTSL 318.54■□□□□ 0.569e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.569e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.546e-7■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 PTPRH-206ENST00000588370 582 ntTSL 418.43■□□□□ 0.543e-15■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 CCDC88C-209ENST00000554872 1165 ntTSL 418.43■□□□□ 0.549e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 PTPRH-204ENST00000586852 680 ntTSL 318.41■□□□□ 0.543e-15■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 PPFIA3-207ENST00000602716 2020 ntTSL 1 (best)18.32■□□□□ 0.529e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 GRK6-208ENST00000511244 555 ntTSL 418.31■□□□□ 0.522e-7■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.529e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 NTHL1-205ENST00000562951 523 ntTSL 318.27■□□□□ 0.529e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 DHRS13-204ENST00000581759 824 ntTSL 1 (best)18.23■□□□□ 0.519e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.519e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 SCYL2-204ENST00000548392 790 ntTSL 418.22■□□□□ 0.519e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.59e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.51e-7■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 PIK3R2-203ENST00000459743 465 ntTSL 217.94■□□□□ 0.469e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 QDPR-207ENST00000511609 584 ntTSL 417.94■□□□□ 0.461e-10■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 ASPDH-208ENST00000601287 634 ntTSL 317.93■□□□□ 0.469e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 RHBDF1-204ENST00000428730 2751 ntTSL 517.91■□□□□ 0.466e-7■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 NTHL1-209ENST00000568513 837 ntTSL 317.86■□□□□ 0.459e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 CHFR-224ENST00000545046 2186 ntTSL 217.84■□□□□ 0.459e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 WDR90-219ENST00000550902 374 ntTSL 517.81■□□□□ 0.441e-11■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.449e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 KRT8-207ENST00000546921 542 ntTSL 417.77■□□□□ 0.449e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 MAP3K14-203ENST00000586644 570 ntTSL 417.72■□□□□ 0.439e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.429e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 MKI67-204ENST00000478293 654 ntTSL 517.67■□□□□ 0.429e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.429e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.419e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 RARA-205ENST00000420042 1052 ntTSL 317.62■□□□□ 0.419e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 GATB-208ENST00000511538 1345 ntTSL 217.62■□□□□ 0.419e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 NTHL1-204ENST00000562120 501 ntTSL 217.58■□□□□ 0.49e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 NRBP2-201ENST00000423469 2905 ntTSL 1 (best)17.54■□□□□ 0.43e-7■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.399e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 APH1A-206ENST00000476538 793 ntTSL 217.45■□□□□ 0.389e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.369e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.369e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.365e-7■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 INTS11-240ENST00000531020 548 ntTSL 417.22■□□□□ 0.351e-10■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 CDC37L1-203ENST00000479095 784 ntTSL 217.2■□□□□ 0.349e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.349e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 PLEKHM1-202ENST00000446609 2825 ntTSL 517.15■□□□□ 0.349e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 PPP5C-203ENST00000467502 1235 ntTSL 217.1■□□□□ 0.333e-15■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.329e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 CDC42BPB-204ENST00000559043 1999 ntTSL 517.08■□□□□ 0.321e-10■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 MTMR10-204ENST00000565728 1623 ntTSL 517.07■□□□□ 0.329e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.315e-7■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 SEC14L1-223ENST00000589202 484 ntTSL 316.98■□□□□ 0.319e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.39e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 CHFR-213ENST00000536843 2424 ntTSL 216.95■□□□□ 0.39e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 TNFRSF1A-203ENST00000437813 634 ntTSL 516.94■□□□□ 0.39e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 USP35-206ENST00000530535 2125 ntTSL 216.91■□□□□ 0.39e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 PPP5C-214ENST00000532058 1970 ntTSL 416.91■□□□□ 0.33e-15■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 SH3TC1-218ENST00000509553 627 ntTSL 416.83■□□□□ 0.289e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 SH3TC1-224ENST00000514274 565 ntTSL 416.83■□□□□ 0.289e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 QDPR-204ENST00000505710 1068 ntTSL 316.82■□□□□ 0.281e-10■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 MAP4K2-205ENST00000435926 3169 ntTSL 516.71■□□□□ 0.269e-7■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 GATB-211ENST00000515490 733 ntTSL 416.64■□□□□ 0.259e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.259e-6■■■■■ 27.7
BUD13Q9BRD0 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.259e-6■■■■■ 27.7
Retrieved 100 of 53,381 protein–RNA pairs in 657.5 ms