RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421230.6

PPFIA3-202, Transcript of PTPRF interacting protein alpha 3, humanhuman

TSL 2

Gene PPFIA3, Length 2,236 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3-202ENST00000421230 NISCHQ9Y2I1 1504 aa40.96■■■■■ 4.15
PPFIA3-202ENST00000421230 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa35.79■■■■□ 3.32
PPFIA3-202ENST00000421230 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP34.34■■■■□ 3.09
PPFIA3-202ENST00000421230 ABCC9O60706 1549 aa34.22■■■■□ 3.07
PPFIA3-202ENST00000421230 DCAF8L2P0C7V8 631 aa34.08■■■■□ 3.05
PPFIA3-202ENST00000421230 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa33.79■■■■□ 3
PPFIA3-202ENST00000421230 MYO15BQ96JP2 1530 aa33.47■■■□□ 2.95
PPFIA3-202ENST00000421230 NACADO15069 1562 aa33.41■■■□□ 2.94
PPFIA3-202ENST00000421230 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa33.37■■■□□ 2.93
PPFIA3-202ENST00000421230 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa33.21■■■□□ 2.91
PPFIA3-202ENST00000421230 SCRIBQ14160 1630 aa32.99■■■□□ 2.87
PPFIA3-202ENST00000421230 UNC13AQ9UPW8 1703 aa32.59■■■□□ 2.81
PPFIA3-202ENST00000421230 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP32.27■■■□□ 2.76
PPFIA3-202ENST00000421230 BICRAQ9NZM4 1560 aa32.25■■■□□ 2.75
PPFIA3-202ENST00000421230 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP31.96■■■□□ 2.71
PPFIA3-202ENST00000421230 CECR2Q9BXF3 1484 aa31.92■■■□□ 2.7
PPFIA3-202ENST00000421230 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP31.7■■■□□ 2.67
PPFIA3-202ENST00000421230 MROH2BQ7Z745 1585 aa31.68■■■□□ 2.66
PPFIA3-202ENST00000421230 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP31.63■■■□□ 2.65
PPFIA3-202ENST00000421230 SMARCA4P51532 1647 aa31.55■■■□□ 2.64
PPFIA3-202ENST00000421230 WIZO95785 1651 aa31.42■■■□□ 2.62
PPFIA3-202ENST00000421230 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP31.3■■■□□ 2.6
PPFIA3-202ENST00000421230 PEG3Q9GZU2 1588 aa31.13■■■□□ 2.57
PPFIA3-202ENST00000421230 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa31.11■■■□□ 2.57
PPFIA3-202ENST00000421230 SMARCA2P51531 1590 aa31.04■■■□□ 2.56
PPFIA3-202ENST00000421230 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP31.02■■■□□ 2.56
PPFIA3-202ENST00000421230 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa30.92■■■□□ 2.54
PPFIA3-202ENST00000421230 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP30.92■■■□□ 2.54
PPFIA3-202ENST00000421230 NCAPD3P42695 1498 aa30.85■■■□□ 2.53
PPFIA3-202ENST00000421230 HMGXB3Q12766 1538 aa30.77■■■□□ 2.52
PPFIA3-202ENST00000421230 CCDC88BA6NC98 1476 aa30.75■■■□□ 2.51
PPFIA3-202ENST00000421230 DNAJC5BQ9UF47 199 aa30.48■■■□□ 2.47
PPFIA3-202ENST00000421230 CHIC1Q5VXU3 224 aa30.39■■■□□ 2.46
PPFIA3-202ENST00000421230 CFTRP13569 1480 aa30.11■■■□□ 2.41
PPFIA3-202ENST00000421230 CADPSQ9ULU8 1353 aa30.07■■■□□ 2.4
PPFIA3-202ENST00000421230 ABCC8Q09428 1581 aa30.06■■■□□ 2.4
PPFIA3-202ENST00000421230 TRIM41Q8WV44 630 aa30.02■■■□□ 2.4
PPFIA3-202ENST00000421230 NESP48681 1621 aa29.97■■■□□ 2.39
PPFIA3-202ENST00000421230 PRDM2Q13029 1718 aa29.92■■■□□ 2.38
PPFIA3-202ENST00000421230 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa29.85■■■□□ 2.37
PPFIA3-202ENST00000421230 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP29.83■■■□□ 2.37
PPFIA3-202ENST00000421230 FANCD2Q9BXW9 1451 aa29.75■■■□□ 2.35
PPFIA3-202ENST00000421230 HRCP23327 699 aa29.75■■■□□ 2.35
PPFIA3-202ENST00000421230 SYNJ1O43426 1573 aa29.75■■■□□ 2.35
PPFIA3-202ENST00000421230 PDS5BQ9NTI5 1447 aa29.63■■■□□ 2.33
PPFIA3-202ENST00000421230 CUX1P39880 1505 aa29.63■■■□□ 2.33
PPFIA3-202ENST00000421230 TOP2BQ02880 1626 aa29.61■■■□□ 2.33
PPFIA3-202ENST00000421230 CEP164Q9UPV0 1460 aa29.58■■■□□ 2.33
PPFIA3-202ENST00000421230 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa29.58■■■□□ 2.33
PPFIA3-202ENST00000421230 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa29.57■■■□□ 2.32
PPFIA3-202ENST00000421230 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP29.55■■■□□ 2.32
PPFIA3-202ENST00000421230 SOGA1O94964 1423 aa29.43■■■□□ 2.3
PPFIA3-202ENST00000421230 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP29.41■■■□□ 2.3
PPFIA3-202ENST00000421230 DNMBPQ6XZF7 1577 aa29.41■■■□□ 2.3
PPFIA3-202ENST00000421230 TOPBP1Q92547 1522 aa29.4■■■□□ 2.3
PPFIA3-202ENST00000421230 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa29.36■■■□□ 2.29
PPFIA3-202ENST00000421230 FGD5Q6ZNL6 1462 aa29.35■■■□□ 2.29
PPFIA3-202ENST00000421230 ERCC6Q03468 1493 aa29.34■■■□□ 2.29
PPFIA3-202ENST00000421230 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa29.3■■■□□ 2.28
PPFIA3-202ENST00000421230 MRC2Q9UBG0 1479 aa29.28■■■□□ 2.28
PPFIA3-202ENST00000421230 PCGF6Q9BYE7 350 aa29.25■■■□□ 2.27
PPFIA3-202ENST00000421230 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP29.24■■■□□ 2.27
PPFIA3-202ENST00000421230 EHMT2Q96KQ7 1210 aa29.21■■■□□ 2.27
PPFIA3-202ENST00000421230 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa29.19■■■□□ 2.26
PPFIA3-202ENST00000421230 EEA1Q15075 1411 aa29.19■■■□□ 2.26
PPFIA3-202ENST00000421230 CSRNP3Q8WYN3 585 aa29.16■■■□□ 2.26
PPFIA3-202ENST00000421230 WDR62O43379 1518 aa29.12■■■□□ 2.25
PPFIA3-202ENST00000421230 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP29.12■■■□□ 2.25
PPFIA3-202ENST00000421230 CUX2O14529 1486 aa29.12■■■□□ 2.25
PPFIA3-202ENST00000421230 KIF27Q86VH2 1401 aa29.1■■■□□ 2.25
PPFIA3-202ENST00000421230 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa29.04■■■□□ 2.24
PPFIA3-202ENST00000421230 WDR97A6NE52 1622 aa28.98■■■□□ 2.23
PPFIA3-202ENST00000421230 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP28.98■■■□□ 2.23
PPFIA3-202ENST00000421230 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP28.96■■■□□ 2.23
PPFIA3-202ENST00000421230 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP28.94■■■□□ 2.22
PPFIA3-202ENST00000421230 IGF1RP08069 1367 aa28.89■■■□□ 2.22
PPFIA3-202ENST00000421230 IFT140Q96RY7 1462 aa28.87■■■□□ 2.21
PPFIA3-202ENST00000421230 KIF21BO75037 1637 aa28.87■■■□□ 2.21
PPFIA3-202ENST00000421230 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa28.84■■■□□ 2.21
PPFIA3-202ENST00000421230 GOLGA3Q08378 1498 aa28.83■■■□□ 2.21
PPFIA3-202ENST00000421230 PRXQ9BXM0 1461 aa28.83■■■□□ 2.21
PPFIA3-202ENST00000421230 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa28.83■■■□□ 2.21
PPFIA3-202ENST00000421230 GAPVD1Q14C86 1478 aa28.81■■■□□ 2.2
PPFIA3-202ENST00000421230 UBTFP17480 764 aaKnown RBP28.8■■■□□ 2.2
PPFIA3-202ENST00000421230 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP28.8■■■□□ 2.2
PPFIA3-202ENST00000421230 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP28.79■■■□□ 2.23e-9■■■■■ 38.1
PPFIA3-202ENST00000421230 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa28.74■■■□□ 2.19
PPFIA3-202ENST00000421230 ERICH3Q5RHP9 1530 aa28.71■■■□□ 2.19
PPFIA3-202ENST00000421230 TNIKQ9UKE5 1360 aa28.69■■■□□ 2.18
PPFIA3-202ENST00000421230 PBRM1Q86U86 1689 aa28.67■■■□□ 2.18
PPFIA3-202ENST00000421230 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP28.66■■■□□ 2.18
PPFIA3-202ENST00000421230 CUL7Q14999 1698 aa28.64■■■□□ 2.18
PPFIA3-202ENST00000421230 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP28.63■■■□□ 2.17
PPFIA3-202ENST00000421230 GRIN2BQ13224 1484 aa28.61■■■□□ 2.17
PPFIA3-202ENST00000421230 CEP162Q5TB80 1403 aa28.55■■■□□ 2.16
PPFIA3-202ENST00000421230 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP28.51■■■□□ 2.16
PPFIA3-202ENST00000421230 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa28.49■■■□□ 2.15
PPFIA3-202ENST00000421230 ADAMTS12P58397 1594 aa28.49■■■□□ 2.15
PPFIA3-202ENST00000421230 FHAD1B1AJZ9 1412 aa28.48■■■□□ 2.15
PPFIA3-202ENST00000421230 CLIP1P30622 1438 aa28.39■■■□□ 2.14
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