RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497251.1

TRAPPC3-207, Transcript of trafficking protein particle complex 3, humanhuman

TSL 2

Gene TRAPPC3, Length 715 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3-207ENST00000497251 NISCHQ9Y2I1 1504 aa42.16■■■■■ 4.34
TRAPPC3-207ENST00000497251 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa37.86■■■■□ 3.65
TRAPPC3-207ENST00000497251 ABCC9O60706 1549 aa37.8■■■■□ 3.64
TRAPPC3-207ENST00000497251 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa36.09■■■■□ 3.37
TRAPPC3-207ENST00000497251 NACADO15069 1562 aa35.88■■■■□ 3.33
TRAPPC3-207ENST00000497251 DCAF8L2P0C7V8 631 aa35.55■■■■□ 3.28
TRAPPC3-207ENST00000497251 DNAJC5BQ9UF47 199 aa35.51■■■■□ 3.28
TRAPPC3-207ENST00000497251 MYO15BQ96JP2 1530 aa35.47■■■■□ 3.27
TRAPPC3-207ENST00000497251 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP35.19■■■■□ 3.22
TRAPPC3-207ENST00000497251 UNC13AQ9UPW8 1703 aa35.06■■■■□ 3.2
TRAPPC3-207ENST00000497251 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa34.95■■■■□ 3.19
TRAPPC3-207ENST00000497251 BICRAQ9NZM4 1560 aa34.92■■■■□ 3.18
TRAPPC3-207ENST00000497251 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP34.91■■■■□ 3.18
TRAPPC3-207ENST00000497251 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa34.72■■■■□ 3.15
TRAPPC3-207ENST00000497251 SCRIBQ14160 1630 aa34.33■■■■□ 3.09
TRAPPC3-207ENST00000497251 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa34.17■■■■□ 3.06
TRAPPC3-207ENST00000497251 CECR2Q9BXF3 1484 aa34.14■■■■□ 3.06
TRAPPC3-207ENST00000497251 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP34.11■■■■□ 3.05
TRAPPC3-207ENST00000497251 NCAPD3P42695 1498 aa33.14■■■□□ 2.9
TRAPPC3-207ENST00000497251 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa32.95■■■□□ 2.87
TRAPPC3-207ENST00000497251 SMARCA2P51531 1590 aa32.92■■■□□ 2.86
TRAPPC3-207ENST00000497251 HMGXB3Q12766 1538 aa32.84■■■□□ 2.85
TRAPPC3-207ENST00000497251 SMARCA4P51532 1647 aa32.84■■■□□ 2.85
TRAPPC3-207ENST00000497251 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa32.82■■■□□ 2.84
TRAPPC3-207ENST00000497251 CUX2O14529 1486 aa32.78■■■□□ 2.84
TRAPPC3-207ENST00000497251 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP32.77■■■□□ 2.84
TRAPPC3-207ENST00000497251 ERCC6Q03468 1493 aa32.73■■■□□ 2.83
TRAPPC3-207ENST00000497251 PEG3Q9GZU2 1588 aa32.63■■■□□ 2.81
TRAPPC3-207ENST00000497251 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP32.62■■■□□ 2.81
TRAPPC3-207ENST00000497251 NESP48681 1621 aa32.41■■■□□ 2.78
TRAPPC3-207ENST00000497251 MROH2BQ7Z745 1585 aa32.4■■■□□ 2.78
TRAPPC3-207ENST00000497251 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa32.36■■■□□ 2.77
TRAPPC3-207ENST00000497251 PDS5BQ9NTI5 1447 aa32.24■■■□□ 2.75
TRAPPC3-207ENST00000497251 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP32.14■■■□□ 2.74
TRAPPC3-207ENST00000497251 CADPSQ9ULU8 1353 aa32.12■■■□□ 2.73
TRAPPC3-207ENST00000497251 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa31.97■■■□□ 2.71
TRAPPC3-207ENST00000497251 WIZO95785 1651 aa31.95■■■□□ 2.7
TRAPPC3-207ENST00000497251 MRC2Q9UBG0 1479 aa31.87■■■□□ 2.69
TRAPPC3-207ENST00000497251 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP31.78■■■□□ 2.68
TRAPPC3-207ENST00000497251 WDR62O43379 1518 aa31.78■■■□□ 2.68
TRAPPC3-207ENST00000497251 CEP164Q9UPV0 1460 aa31.73■■■□□ 2.67
TRAPPC3-207ENST00000497251 CFTRP13569 1480 aa31.72■■■□□ 2.67
TRAPPC3-207ENST00000497251 FANCD2Q9BXW9 1451 aa31.68■■■□□ 2.66
TRAPPC3-207ENST00000497251 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP31.66■■■□□ 2.66
TRAPPC3-207ENST00000497251 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP31.36■■■□□ 2.61
TRAPPC3-207ENST00000497251 OSCARQ8IYS5 282 aa31.31■■■□□ 2.6
TRAPPC3-207ENST00000497251 CCDC88BA6NC98 1476 aa31.29■■■□□ 2.6
TRAPPC3-207ENST00000497251 PRDM2Q13029 1718 aa31.27■■■□□ 2.6
TRAPPC3-207ENST00000497251 TRIM41Q8WV44 630 aa31.2■■■□□ 2.59
TRAPPC3-207ENST00000497251 ABCC8Q09428 1581 aa31.17■■■□□ 2.58
TRAPPC3-207ENST00000497251 IFT140Q96RY7 1462 aa31.14■■■□□ 2.58
TRAPPC3-207ENST00000497251 TOPBP1Q92547 1522 aa31.06■■■□□ 2.56
TRAPPC3-207ENST00000497251 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP30.95■■■□□ 2.55
TRAPPC3-207ENST00000497251 DNMBPQ6XZF7 1577 aa30.95■■■□□ 2.54
TRAPPC3-207ENST00000497251 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP30.77■■■□□ 2.52
TRAPPC3-207ENST00000497251 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP30.75■■■□□ 2.51
TRAPPC3-207ENST00000497251 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP30.73■■■□□ 2.51
TRAPPC3-207ENST00000497251 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP30.7■■■□□ 2.516e-9■■■■■ 53.4
TRAPPC3-207ENST00000497251 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa30.69■■■□□ 2.5
TRAPPC3-207ENST00000497251 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa30.69■■■□□ 2.5
TRAPPC3-207ENST00000497251 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa30.69■■■□□ 2.5
TRAPPC3-207ENST00000497251 ARHGEF11O15085 1522 aa30.66■■■□□ 2.5
TRAPPC3-207ENST00000497251 SOGA1O94964 1423 aa30.65■■■□□ 2.5
TRAPPC3-207ENST00000497251 WDR97A6NE52 1622 aa30.6■■■□□ 2.49
TRAPPC3-207ENST00000497251 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa30.56■■■□□ 2.48
TRAPPC3-207ENST00000497251 FBLN2P98095 1184 aa30.55■■■□□ 2.48
TRAPPC3-207ENST00000497251 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP30.53■■■□□ 2.48
TRAPPC3-207ENST00000497251 FGD5Q6ZNL6 1462 aa30.5■■■□□ 2.47
TRAPPC3-207ENST00000497251 CHD1O14646 1710 aa30.5■■■□□ 2.47
TRAPPC3-207ENST00000497251 CYB5RLQ6IPT4 315 aa30.48■■■□□ 2.47
TRAPPC3-207ENST00000497251 CUX1P39880 1505 aa30.45■■■□□ 2.47
TRAPPC3-207ENST00000497251 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP30.43■■■□□ 2.46
TRAPPC3-207ENST00000497251 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP30.41■■■□□ 2.46
TRAPPC3-207ENST00000497251 GRIN2BQ13224 1484 aa30.4■■■□□ 2.46
TRAPPC3-207ENST00000497251 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa30.38■■■□□ 2.45
TRAPPC3-207ENST00000497251 ARAP1Q96P48 1450 aa30.33■■■□□ 2.45
TRAPPC3-207ENST00000497251 SYNJ2O15056 1496 aa30.31■■■□□ 2.44
TRAPPC3-207ENST00000497251 SYNJ1O43426 1573 aa30.3■■■□□ 2.44
TRAPPC3-207ENST00000497251 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP30.27■■■□□ 2.44
TRAPPC3-207ENST00000497251 CLASP1Q7Z460 1538 aa30.27■■■□□ 2.44
TRAPPC3-207ENST00000497251 GAPVD1Q14C86 1478 aa30.26■■■□□ 2.44
TRAPPC3-207ENST00000497251 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa30.24■■■□□ 2.43
TRAPPC3-207ENST00000497251 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP30.16■■■□□ 2.42
TRAPPC3-207ENST00000497251 TRHP20396 242 aaPredicted RBP30.15■■■□□ 2.42
TRAPPC3-207ENST00000497251 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa30.11■■■□□ 2.41
TRAPPC3-207ENST00000497251 PBRM1Q86U86 1689 aa30.11■■■□□ 2.41
TRAPPC3-207ENST00000497251 TOP2BQ02880 1626 aa30■■■□□ 2.39
TRAPPC3-207ENST00000497251 GRIN2AQ12879 1464 aa29.97■■■□□ 2.39
TRAPPC3-207ENST00000497251 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa29.96■■■□□ 2.39
TRAPPC3-207ENST00000497251 FHAD1B1AJZ9 1412 aa29.92■■■□□ 2.38
TRAPPC3-207ENST00000497251 NUP160Q12769 1436 aa29.9■■■□□ 2.38
TRAPPC3-207ENST00000497251 ERICH3Q5RHP9 1530 aa29.88■■■□□ 2.37
TRAPPC3-207ENST00000497251 ADAMTS12P58397 1594 aa29.88■■■□□ 2.37
TRAPPC3-207ENST00000497251 CEP170Q5SW79 1584 aa29.77■■■□□ 2.36
TRAPPC3-207ENST00000497251 SHROOM2Q13796 1616 aa29.72■■■□□ 2.35
TRAPPC3-207ENST00000497251 ERCC6L2Q5T890 1561 aa29.66■■■□□ 2.34
TRAPPC3-207ENST00000497251 JPH4Q96JJ6 628 aa29.65■■■□□ 2.34
TRAPPC3-207ENST00000497251 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP29.59■■■□□ 2.33
TRAPPC3-207ENST00000497251 KIF27Q86VH2 1401 aa29.51■■■□□ 2.31
TRAPPC3-207ENST00000497251 IGF1RP08069 1367 aa29.48■■■□□ 2.31
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