RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588370.5

PTPRH-206, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type H, human

TSL 4

Gene PTPRH, Length 582 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRH-206	ENST00000588370	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		40.04	■■■■■ 4
PTPRH-206	ENST00000588370	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		35.96	■■■■□ 3.35
PTPRH-206	ENST00000588370	ABCC9	O60706	1549 aa		34.98	■■■■□ 3.19
PTPRH-206	ENST00000588370	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		33.76	■■■□□ 2.99
PTPRH-206	ENST00000588370	NACAD	O15069	1562 aa		33.68	■■■□□ 2.98
PTPRH-206	ENST00000588370	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		33.49	■■■□□ 2.95
PTPRH-206	ENST00000588370	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	33.38	■■■□□ 2.93
PTPRH-206	ENST00000588370	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		33.25	■■■□□ 2.91
PTPRH-206	ENST00000588370	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		33.25	■■■□□ 2.91
PTPRH-206	ENST00000588370	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		33	■■■□□ 2.87
PTPRH-206	ENST00000588370	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		32.8	■■■□□ 2.84
PTPRH-206	ENST00000588370	SCRIB	Q14160	1630 aa		32.55	■■■□□ 2.8
PTPRH-206	ENST00000588370	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		32.51	■■■□□ 2.79
PTPRH-206	ENST00000588370	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	32.45	■■■□□ 2.79
PTPRH-206	ENST00000588370	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		32.18	■■■□□ 2.74
PTPRH-206	ENST00000588370	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	31.9	■■■□□ 2.7
PTPRH-206	ENST00000588370	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		31.81	■■■□□ 2.68
PTPRH-206	ENST00000588370	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		31.5	■■■□□ 2.63
PTPRH-206	ENST00000588370	SMARCA4	P51532	1647 aa		31.21	■■■□□ 2.59
PTPRH-206	ENST00000588370	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	31.09	■■■□□ 2.57
PTPRH-206	ENST00000588370	SMARCA2	P51531	1590 aa		31	■■■□□ 2.55
PTPRH-206	ENST00000588370	NCAPD3	P42695	1498 aa		30.99	■■■□□ 2.55
PTPRH-206	ENST00000588370	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		30.99	■■■□□ 2.55
PTPRH-206	ENST00000588370	HMGXB3	Q12766	1538 aa		30.97	■■■□□ 2.55
PTPRH-206	ENST00000588370	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		30.95	■■■□□ 2.55
PTPRH-206	ENST00000588370	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		30.83	■■■□□ 2.53
PTPRH-206	ENST00000588370	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	30.68	■■■□□ 2.5
PTPRH-206	ENST00000588370	WIZ	O95785	1651 aa		30.55	■■■□□ 2.48
PTPRH-206	ENST00000588370	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	30.32	■■■□□ 2.44
PTPRH-206	ENST00000588370	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		30.32	■■■□□ 2.44
PTPRH-206	ENST00000588370	NES	P48681	1621 aa		30.25	■■■□□ 2.43
PTPRH-206	ENST00000588370	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	30.23	■■■□□ 2.43
PTPRH-206	ENST00000588370	ERCC6	Q03468	1493 aa		30.15	■■■□□ 2.42
PTPRH-206	ENST00000588370	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		30.14	■■■□□ 2.41
PTPRH-206	ENST00000588370	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	30.09	■■■□□ 2.41
PTPRH-206	ENST00000588370	CUX2	O14529	1486 aa		30.07	■■■□□ 2.4
PTPRH-206	ENST00000588370	PRDM2	Q13029	1718 aa		29.99	■■■□□ 2.39
PTPRH-206	ENST00000588370	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		29.98	■■■□□ 2.39
PTPRH-206	ENST00000588370	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		29.92	■■■□□ 2.38
PTPRH-206	ENST00000588370	CFTR	P13569	1480 aa		29.86	■■■□□ 2.37
PTPRH-206	ENST00000588370	WDR62	O43379	1518 aa		29.75	■■■□□ 2.35
PTPRH-206	ENST00000588370	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		29.73	■■■□□ 2.35
PTPRH-206	ENST00000588370	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		29.72	■■■□□ 2.35
PTPRH-206	ENST00000588370	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		29.7	■■■□□ 2.35
PTPRH-206	ENST00000588370	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		29.68	■■■□□ 2.34
PTPRH-206	ENST00000588370	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	29.45	■■■□□ 2.31
PTPRH-206	ENST00000588370	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		29.26	■■■□□ 2.28
PTPRH-206	ENST00000588370	TOPBP1	Q92547	1522 aa		29.25	■■■□□ 2.27
PTPRH-206	ENST00000588370	ABCC8	Q09428	1581 aa		29.22	■■■□□ 2.27
PTPRH-206	ENST00000588370	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		29.17	■■■□□ 2.26
PTPRH-206	ENST00000588370	IFT140	Q96RY7	1462 aa		29.08	■■■□□ 2.25
PTPRH-206	ENST00000588370	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	29.06	■■■□□ 2.24
PTPRH-206	ENST00000588370	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	29.05	■■■□□ 2.24
PTPRH-206	ENST00000588370	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	29	■■■□□ 2.23
PTPRH-206	ENST00000588370	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	28.97	■■■□□ 2.23
PTPRH-206	ENST00000588370	CUX1	P39880	1505 aa		28.95	■■■□□ 2.23
PTPRH-206	ENST00000588370	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	28.94	■■■□□ 2.22
PTPRH-206	ENST00000588370	WDR97	A6NE52	1622 aa		28.91	■■■□□ 2.22
PTPRH-206	ENST00000588370	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		28.85	■■■□□ 2.21
PTPRH-206	ENST00000588370	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		28.81	■■■□□ 2.2
PTPRH-206	ENST00000588370	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		28.74	■■■□□ 2.19
PTPRH-206	ENST00000588370	CHD1	O14646	1710 aa		28.73	■■■□□ 2.19
PTPRH-206	ENST00000588370	TOP2B	Q02880	1626 aa		28.72	■■■□□ 2.19
PTPRH-206	ENST00000588370	SOGA1	O94964	1423 aa		28.69	■■■□□ 2.18
PTPRH-206	ENST00000588370	PBRM1	Q86U86	1689 aa		28.67	■■■□□ 2.18
PTPRH-206	ENST00000588370	SYNJ1	O43426	1573 aa		28.67	■■■□□ 2.18
PTPRH-206	ENST00000588370	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	28.66	■■■□□ 2.18	1e-6	■■■■□ 20.4
PTPRH-206	ENST00000588370	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		28.65	■■■□□ 2.18
PTPRH-206	ENST00000588370	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		28.61	■■■□□ 2.17
PTPRH-206	ENST00000588370	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	28.59	■■■□□ 2.17
PTPRH-206	ENST00000588370	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	28.52	■■■□□ 2.16
PTPRH-206	ENST00000588370	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	28.51	■■■□□ 2.16
PTPRH-206	ENST00000588370	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		28.5	■■■□□ 2.15
PTPRH-206	ENST00000588370	GRIN2B	Q13224	1484 aa		28.5	■■■□□ 2.15
PTPRH-206	ENST00000588370	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		28.49	■■■□□ 2.15
PTPRH-206	ENST00000588370	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		28.45	■■■□□ 2.14
PTPRH-206	ENST00000588370	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		28.4	■■■□□ 2.14
PTPRH-206	ENST00000588370	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		28.4	■■■□□ 2.14
PTPRH-206	ENST00000588370	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		28.4	■■■□□ 2.14
PTPRH-206	ENST00000588370	SYNJ2	O15056	1496 aa		28.37	■■■□□ 2.13
PTPRH-206	ENST00000588370	ADAMTS12	P58397	1594 aa		28.36	■■■□□ 2.13
PTPRH-206	ENST00000588370	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		28.35	■■■□□ 2.13
PTPRH-206	ENST00000588370	ARHGEF11	O15085	1522 aa		28.3	■■■□□ 2.12
PTPRH-206	ENST00000588370	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		28.29	■■■□□ 2.12
PTPRH-206	ENST00000588370	GRIN2A	Q12879	1464 aa		28.17	■■■□□ 2.1
PTPRH-206	ENST00000588370	FBLN2	P98095	1184 aa		28.12	■■■□□ 2.09
PTPRH-206	ENST00000588370	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		28.11	■■■□□ 2.09
PTPRH-206	ENST00000588370	CEP170	Q5SW79	1584 aa		28.11	■■■□□ 2.09
PTPRH-206	ENST00000588370	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	28.1	■■■□□ 2.09
PTPRH-206	ENST00000588370	CUL7	Q14999	1698 aa		28.09	■■■□□ 2.09
PTPRH-206	ENST00000588370	NUP160	Q12769	1436 aa		28.09	■■■□□ 2.09
PTPRH-206	ENST00000588370	ARAP1	Q96P48	1450 aa		28.06	■■■□□ 2.08
PTPRH-206	ENST00000588370	SHROOM2	Q13796	1616 aa		28.06	■■■□□ 2.08
PTPRH-206	ENST00000588370	KIF27	Q86VH2	1401 aa		27.99	■■■□□ 2.07
PTPRH-206	ENST00000588370	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		27.97	■■■□□ 2.07
PTPRH-206	ENST00000588370	TRIM41	Q8WV44	630 aa		27.95	■■■□□ 2.06
PTPRH-206	ENST00000588370	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		27.85	■■■□□ 2.05
PTPRH-206	ENST00000588370	IGF1R	P08069	1367 aa		27.85	■■■□□ 2.05
PTPRH-206	ENST00000588370	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		27.72	■■■□□ 2.03
PTPRH-206	ENST00000588370	KIAA0586	Q9BVV6	1533 aa		27.69	■■■□□ 2.02

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