Protein–RNA interactions for Protein: Q96FV3

TSPAN17, Tetraspanin-17, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN17Q96FV3 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSPAN17Q96FV3 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSPAN17Q96FV3 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSPAN17Q96FV3 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSPAN17Q96FV3 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSPAN17Q96FV3 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSPAN17Q96FV3 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSPAN17Q96FV3 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSPAN17Q96FV3 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSPAN17Q96FV3 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TSPAN17Q96FV3 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSPAN17Q96FV3 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSPAN17Q96FV3 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSPAN17Q96FV3 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSPAN17Q96FV3 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSPAN17Q96FV3 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSPAN17Q96FV3 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TSPAN17Q96FV3 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TSPAN17Q96FV3 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSPAN17Q96FV3 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSPAN17Q96FV3 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSPAN17Q96FV3 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSPAN17Q96FV3 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSPAN17Q96FV3 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSPAN17Q96FV3 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSPAN17Q96FV3 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSPAN17Q96FV3 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSPAN17Q96FV3 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSPAN17Q96FV3 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSPAN17Q96FV3 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSPAN17Q96FV3 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSPAN17Q96FV3 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSPAN17Q96FV3 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TSPAN17Q96FV3 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSPAN17Q96FV3 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSPAN17Q96FV3 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSPAN17Q96FV3 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSPAN17Q96FV3 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSPAN17Q96FV3 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSPAN17Q96FV3 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSPAN17Q96FV3 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSPAN17Q96FV3 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TSPAN17Q96FV3 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TSPAN17Q96FV3 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TSPAN17Q96FV3 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSPAN17Q96FV3 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSPAN17Q96FV3 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSPAN17Q96FV3 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSPAN17Q96FV3 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TSPAN17Q96FV3 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSPAN17Q96FV3 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSPAN17Q96FV3 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSPAN17Q96FV3 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TSPAN17Q96FV3 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TSPAN17Q96FV3 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TSPAN17Q96FV3 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TSPAN17Q96FV3 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TSPAN17Q96FV3 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TSPAN17Q96FV3 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TSPAN17Q96FV3 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TSPAN17Q96FV3 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TSPAN17Q96FV3 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TSPAN17Q96FV3 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TSPAN17Q96FV3 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TSPAN17Q96FV3 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TSPAN17Q96FV3 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TSPAN17Q96FV3 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TSPAN17Q96FV3 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TSPAN17Q96FV3 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TSPAN17Q96FV3 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TSPAN17Q96FV3 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TSPAN17Q96FV3 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TSPAN17Q96FV3 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TSPAN17Q96FV3 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TSPAN17Q96FV3 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TSPAN17Q96FV3 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TSPAN17Q96FV3 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSPAN17Q96FV3 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSPAN17Q96FV3 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSPAN17Q96FV3 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSPAN17Q96FV3 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSPAN17Q96FV3 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSPAN17Q96FV3 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSPAN17Q96FV3 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSPAN17Q96FV3 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSPAN17Q96FV3 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSPAN17Q96FV3 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSPAN17Q96FV3 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSPAN17Q96FV3 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSPAN17Q96FV3 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSPAN17Q96FV3 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSPAN17Q96FV3 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TSPAN17Q96FV3 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TSPAN17Q96FV3 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TSPAN17Q96FV3 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TSPAN17Q96FV3 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TSPAN17Q96FV3 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSPAN17Q96FV3 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSPAN17Q96FV3 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSPAN17Q96FV3 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms