Protein–RNA interactions for Protein: Q92485

SMPDL3B, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3b, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPDL3BQ92485 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SMPDL3BQ92485 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMPDL3BQ92485 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMPDL3BQ92485 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMPDL3BQ92485 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMPDL3BQ92485 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMPDL3BQ92485 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMPDL3BQ92485 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMPDL3BQ92485 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMPDL3BQ92485 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMPDL3BQ92485 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMPDL3BQ92485 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMPDL3BQ92485 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SMPDL3BQ92485 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMPDL3BQ92485 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMPDL3BQ92485 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMPDL3BQ92485 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMPDL3BQ92485 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMPDL3BQ92485 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMPDL3BQ92485 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMPDL3BQ92485 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMPDL3BQ92485 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SMPDL3BQ92485 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SMPDL3BQ92485 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SMPDL3BQ92485 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SMPDL3BQ92485 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SMPDL3BQ92485 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SMPDL3BQ92485 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SMPDL3BQ92485 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SMPDL3BQ92485 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SMPDL3BQ92485 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SMPDL3BQ92485 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SMPDL3BQ92485 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SMPDL3BQ92485 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SMPDL3BQ92485 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SMPDL3BQ92485 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SMPDL3BQ92485 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SMPDL3BQ92485 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SMPDL3BQ92485 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
SMPDL3BQ92485 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SMPDL3BQ92485 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SMPDL3BQ92485 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SMPDL3BQ92485 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SMPDL3BQ92485 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SMPDL3BQ92485 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SMPDL3BQ92485 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SMPDL3BQ92485 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMPDL3BQ92485 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMPDL3BQ92485 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMPDL3BQ92485 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMPDL3BQ92485 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMPDL3BQ92485 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMPDL3BQ92485 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMPDL3BQ92485 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SMPDL3BQ92485 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMPDL3BQ92485 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SMPDL3BQ92485 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMPDL3BQ92485 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMPDL3BQ92485 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMPDL3BQ92485 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMPDL3BQ92485 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMPDL3BQ92485 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMPDL3BQ92485 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMPDL3BQ92485 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMPDL3BQ92485 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMPDL3BQ92485 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMPDL3BQ92485 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMPDL3BQ92485 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMPDL3BQ92485 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMPDL3BQ92485 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMPDL3BQ92485 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMPDL3BQ92485 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMPDL3BQ92485 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMPDL3BQ92485 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMPDL3BQ92485 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SMPDL3BQ92485 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMPDL3BQ92485 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMPDL3BQ92485 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMPDL3BQ92485 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMPDL3BQ92485 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMPDL3BQ92485 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMPDL3BQ92485 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMPDL3BQ92485 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMPDL3BQ92485 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMPDL3BQ92485 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMPDL3BQ92485 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMPDL3BQ92485 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMPDL3BQ92485 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMPDL3BQ92485 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMPDL3BQ92485 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMPDL3BQ92485 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMPDL3BQ92485 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMPDL3BQ92485 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMPDL3BQ92485 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMPDL3BQ92485 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SMPDL3BQ92485 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMPDL3BQ92485 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMPDL3BQ92485 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMPDL3BQ92485 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMPDL3BQ92485 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms