Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW34

TMEM239, Transmembrane protein 239, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM239Q8WW34 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMEM239Q8WW34 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMEM239Q8WW34 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMEM239Q8WW34 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMEM239Q8WW34 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
TMEM239Q8WW34 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMEM239Q8WW34 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM239Q8WW34 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM239Q8WW34 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM239Q8WW34 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM239Q8WW34 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM239Q8WW34 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM239Q8WW34 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM239Q8WW34 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM239Q8WW34 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM239Q8WW34 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM239Q8WW34 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM239Q8WW34 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM239Q8WW34 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM239Q8WW34 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM239Q8WW34 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM239Q8WW34 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM239Q8WW34 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM239Q8WW34 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM239Q8WW34 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMEM239Q8WW34 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMEM239Q8WW34 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMEM239Q8WW34 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMEM239Q8WW34 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMEM239Q8WW34 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMEM239Q8WW34 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMEM239Q8WW34 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMEM239Q8WW34 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMEM239Q8WW34 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
TMEM239Q8WW34 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
TMEM239Q8WW34 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMEM239Q8WW34 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
TMEM239Q8WW34 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMEM239Q8WW34 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMEM239Q8WW34 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMEM239Q8WW34 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMEM239Q8WW34 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMEM239Q8WW34 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMEM239Q8WW34 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMEM239Q8WW34 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMEM239Q8WW34 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMEM239Q8WW34 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMEM239Q8WW34 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMEM239Q8WW34 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMEM239Q8WW34 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
TMEM239Q8WW34 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMEM239Q8WW34 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMEM239Q8WW34 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMEM239Q8WW34 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMEM239Q8WW34 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMEM239Q8WW34 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
TMEM239Q8WW34 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
TMEM239Q8WW34 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMEM239Q8WW34 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMEM239Q8WW34 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMEM239Q8WW34 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMEM239Q8WW34 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMEM239Q8WW34 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
TMEM239Q8WW34 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMEM239Q8WW34 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMEM239Q8WW34 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEM239Q8WW34 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEM239Q8WW34 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEM239Q8WW34 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEM239Q8WW34 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEM239Q8WW34 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEM239Q8WW34 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEM239Q8WW34 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEM239Q8WW34 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEM239Q8WW34 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEM239Q8WW34 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEM239Q8WW34 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEM239Q8WW34 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEM239Q8WW34 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM239Q8WW34 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM239Q8WW34 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM239Q8WW34 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM239Q8WW34 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM239Q8WW34 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM239Q8WW34 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM239Q8WW34 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM239Q8WW34 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM239Q8WW34 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM239Q8WW34 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM239Q8WW34 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM239Q8WW34 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM239Q8WW34 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM239Q8WW34 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM239Q8WW34 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM239Q8WW34 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM239Q8WW34 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM239Q8WW34 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM239Q8WW34 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM239Q8WW34 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM239Q8WW34 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms