Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU0

BEST4, Bestrophin-4, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST4Q8NFU0 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BEST4Q8NFU0 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
BEST4Q8NFU0 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BEST4Q8NFU0 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BEST4Q8NFU0 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BEST4Q8NFU0 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
BEST4Q8NFU0 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BEST4Q8NFU0 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BEST4Q8NFU0 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BEST4Q8NFU0 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BEST4Q8NFU0 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BEST4Q8NFU0 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BEST4Q8NFU0 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BEST4Q8NFU0 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BEST4Q8NFU0 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BEST4Q8NFU0 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BEST4Q8NFU0 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BEST4Q8NFU0 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
BEST4Q8NFU0 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BEST4Q8NFU0 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BEST4Q8NFU0 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BEST4Q8NFU0 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BEST4Q8NFU0 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BEST4Q8NFU0 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BEST4Q8NFU0 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BEST4Q8NFU0 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BEST4Q8NFU0 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
BEST4Q8NFU0 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BEST4Q8NFU0 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BEST4Q8NFU0 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BEST4Q8NFU0 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BEST4Q8NFU0 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
BEST4Q8NFU0 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BEST4Q8NFU0 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BEST4Q8NFU0 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
BEST4Q8NFU0 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BEST4Q8NFU0 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BEST4Q8NFU0 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BEST4Q8NFU0 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BEST4Q8NFU0 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BEST4Q8NFU0 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BEST4Q8NFU0 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BEST4Q8NFU0 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
BEST4Q8NFU0 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
BEST4Q8NFU0 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
BEST4Q8NFU0 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
BEST4Q8NFU0 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
BEST4Q8NFU0 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
BEST4Q8NFU0 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
BEST4Q8NFU0 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
BEST4Q8NFU0 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BEST4Q8NFU0 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
BEST4Q8NFU0 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BEST4Q8NFU0 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
BEST4Q8NFU0 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BEST4Q8NFU0 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
BEST4Q8NFU0 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
BEST4Q8NFU0 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
BEST4Q8NFU0 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
BEST4Q8NFU0 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BEST4Q8NFU0 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BEST4Q8NFU0 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BEST4Q8NFU0 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BEST4Q8NFU0 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BEST4Q8NFU0 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BEST4Q8NFU0 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BEST4Q8NFU0 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BEST4Q8NFU0 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BEST4Q8NFU0 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
BEST4Q8NFU0 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BEST4Q8NFU0 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BEST4Q8NFU0 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BEST4Q8NFU0 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BEST4Q8NFU0 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
BEST4Q8NFU0 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BEST4Q8NFU0 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BEST4Q8NFU0 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BEST4Q8NFU0 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BEST4Q8NFU0 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BEST4Q8NFU0 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BEST4Q8NFU0 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BEST4Q8NFU0 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BEST4Q8NFU0 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BEST4Q8NFU0 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
BEST4Q8NFU0 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BEST4Q8NFU0 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BEST4Q8NFU0 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BEST4Q8NFU0 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BEST4Q8NFU0 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BEST4Q8NFU0 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BEST4Q8NFU0 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BEST4Q8NFU0 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BEST4Q8NFU0 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BEST4Q8NFU0 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BEST4Q8NFU0 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BEST4Q8NFU0 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BEST4Q8NFU0 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BEST4Q8NFU0 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BEST4Q8NFU0 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BEST4Q8NFU0 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms