Protein–RNA interactions for Protein: Q86WN2

IFNE, Interferon epsilon, humanhuman

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Length 208 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNEQ86WN2 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
IFNEQ86WN2 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IFNEQ86WN2 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IFNEQ86WN2 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IFNEQ86WN2 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IFNEQ86WN2 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IFNEQ86WN2 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IFNEQ86WN2 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IFNEQ86WN2 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IFNEQ86WN2 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IFNEQ86WN2 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IFNEQ86WN2 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IFNEQ86WN2 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IFNEQ86WN2 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IFNEQ86WN2 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IFNEQ86WN2 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IFNEQ86WN2 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IFNEQ86WN2 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
IFNEQ86WN2 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
IFNEQ86WN2 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
IFNEQ86WN2 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
IFNEQ86WN2 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
IFNEQ86WN2 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
IFNEQ86WN2 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
IFNEQ86WN2 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
IFNEQ86WN2 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
IFNEQ86WN2 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
IFNEQ86WN2 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
IFNEQ86WN2 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IFNEQ86WN2 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IFNEQ86WN2 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
IFNEQ86WN2 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
IFNEQ86WN2 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
IFNEQ86WN2 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IFNEQ86WN2 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
IFNEQ86WN2 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IFNEQ86WN2 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IFNEQ86WN2 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
IFNEQ86WN2 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IFNEQ86WN2 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IFNEQ86WN2 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IFNEQ86WN2 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.31■■□□□ 1
IFNEQ86WN2 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
IFNEQ86WN2 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.31■■□□□ 1
IFNEQ86WN2 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
IFNEQ86WN2 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
IFNEQ86WN2 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IFNEQ86WN2 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IFNEQ86WN2 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IFNEQ86WN2 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IFNEQ86WN2 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
IFNEQ86WN2 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
IFNEQ86WN2 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IFNEQ86WN2 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
IFNEQ86WN2 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IFNEQ86WN2 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
IFNEQ86WN2 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IFNEQ86WN2 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IFNEQ86WN2 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.3■■□□□ 1
IFNEQ86WN2 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
IFNEQ86WN2 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IFNEQ86WN2 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
IFNEQ86WN2 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IFNEQ86WN2 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
IFNEQ86WN2 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
IFNEQ86WN2 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
IFNEQ86WN2 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
IFNEQ86WN2 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
IFNEQ86WN2 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
IFNEQ86WN2 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
IFNEQ86WN2 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
IFNEQ86WN2 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IFNEQ86WN2 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
IFNEQ86WN2 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
IFNEQ86WN2 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.29■■□□□ 1
IFNEQ86WN2 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IFNEQ86WN2 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IFNEQ86WN2 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
IFNEQ86WN2 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
IFNEQ86WN2 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IFNEQ86WN2 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
IFNEQ86WN2 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
IFNEQ86WN2 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
IFNEQ86WN2 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IFNEQ86WN2 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IFNEQ86WN2 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IFNEQ86WN2 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
IFNEQ86WN2 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
IFNEQ86WN2 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
IFNEQ86WN2 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IFNEQ86WN2 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
IFNEQ86WN2 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.28■■□□□ 1
IFNEQ86WN2 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
IFNEQ86WN2 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
IFNEQ86WN2 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IFNEQ86WN2 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
IFNEQ86WN2 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IFNEQ86WN2 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IFNEQ86WN2 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IFNEQ86WN2 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
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