Protein–RNA interactions for Protein: Q7KZF4

SND1, Staphylococcal nuclease domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 910 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SND1Q7KZF4 NAGLU-204ENST00000591587 1493 ntTSL 516.36■□□□□ 0.214e-7■■■■□ 22.3
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SND1Q7KZF4 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.916e-7■■■■□ 22.2
SND1Q7KZF4 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.266e-7■■■■□ 22.2
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SND1Q7KZF4 SLC11A2-209ENST00000547198 2486 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.616e-7■■■■□ 22.2
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SND1Q7KZF4 SLC11A2-202ENST00000262052 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.986e-7■■■■□ 22.2
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SND1Q7KZF4 SLC4A2-209ENST00000472204 994 ntTSL 515.72■□□□□ 0.114e-8■■■■□ 22.2
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SND1Q7KZF4 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC15.09■□□□□ 0.015e-11■■■■□ 22.2
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SND1Q7KZF4 LIPC-204ENST00000433326 1484 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.374e-7■■■■□ 22.2
SND1Q7KZF4 LIPC-201ENST00000299022 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.674e-7■■■■□ 22.2
SND1Q7KZF4 LIPC-203ENST00000414170 2968 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.884e-7■■■■□ 22.2
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SND1Q7KZF4 CALR-204ENST00000586967 394 ntTSL 215.41■□□□□ 0.066e-28■■■■□ 22.2
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SND1Q7KZF4 GALNT7-205ENST00000506317 583 ntTSL 39.53□□□□□ -0.889e-8■■■■□ 22.2
SND1Q7KZF4 RPN2-208ENST00000470352 511 ntTSL 212.56□□□□□ -0.43e-29■■■■□ 22.2
SND1Q7KZF4 P3H1-209ENST00000462474 581 ntTSL 213.44□□□□□ -0.264e-9■■■■□ 22.2
SND1Q7KZF4 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.329e-9■■■■□ 22.2
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SND1Q7KZF4 CPD-209ENST00000584221 680 ntTSL 36.86□□□□□ -1.313e-8■■■■□ 22.2
SND1Q7KZF4 CPD-202ENST00000543464 4007 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.93e-8■■■■□ 22.2
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SND1Q7KZF4 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.547e-20■■■■□ 22.2
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SND1Q7KZF4 MYL6-212ENST00000548725 582 ntTSL 212.61□□□□□ -0.397e-20■■■■□ 22.2
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SND1Q7KZF4 MYL6-221ENST00000552297 454 ntTSL 36.68□□□□□ -1.347e-20■■■■□ 22.2
SND1Q7KZF4 MYL6-213ENST00000549017 502 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.437e-20■■■■□ 22.2
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SND1Q7KZF4 COPB1-204ENST00000526191 697 ntTSL 210.02□□□□□ -0.819e-9■■■■□ 22.1
SND1Q7KZF4 GANAB-208ENST00000528503 608 ntTSL 212.45□□□□□ -0.428e-27■■■■□ 22.1
SND1Q7KZF4 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.33e-9■■■■□ 22
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SND1Q7KZF4 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.412e-6■■■■□ 22
SND1Q7KZF4 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.412e-6■■■■□ 22
SND1Q7KZF4 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.42e-6■■■■□ 22
SND1Q7KZF4 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.42e-6■■■■□ 22
SND1Q7KZF4 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.12e-6■■■■□ 22
SND1Q7KZF4 DHCR7-211ENST00000534701 456 ntTSL 311.72□□□□□ -0.531e-11■■■■□ 22
SND1Q7KZF4 AIG1-205ENST00000447498 444 ntTSL 512.43□□□□□ -0.421e-6■■■■□ 22
SND1Q7KZF4 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.123e-17■■■■□ 22
SND1Q7KZF4 TMEM59-208ENST00000452421 1074 ntTSL 518.72■□□□□ 0.592e-7■■■■□ 22
SND1Q7KZF4 TMEM59-206ENST00000420738 728 ntTSL 39.11□□□□□ -0.952e-7■■■■□ 22
SND1Q7KZF4 TMEM59-207ENST00000440019 618 ntTSL 29.11□□□□□ -0.952e-7■■■■□ 22
SND1Q7KZF4 NAGPA-211ENST00000566137 574 ntTSL 314.4□□□□□ -0.11e-7■■■■□ 22
SND1Q7KZF4 CD53-204ENST00000476408 756 ntTSL 57.6□□□□□ -1.194e-9■■■■□ 22
SND1Q7KZF4 CD53-201ENST00000271324 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.274e-9■■■■□ 22
SND1Q7KZF4 RPN2-204ENST00000437329 520 ntTSL 311.95□□□□□ -0.51e-26■■■■□ 22
SND1Q7KZF4 RPN2-206ENST00000456400 453 ntTSL 36.87□□□□□ -1.311e-26■■■■□ 22
SND1Q7KZF4 OS9-210ENST00000549307 3870 ntTSL 29.98□□□□□ -0.812e-8■■■■□ 22
SND1Q7KZF4 PSMA3-201ENST00000216455 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.852e-7■■■■□ 22
SND1Q7KZF4 PSMA3-202ENST00000412908 908 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.892e-7■■■■□ 22
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SND1Q7KZF4 PSMA3-209ENST00000555931 606 ntTSL 47.52□□□□□ -1.212e-7■■■■□ 22
SND1Q7KZF4 PSMA3-211ENST00000557087 654 ntTSL 36.92□□□□□ -1.32e-7■■■■□ 22
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