Protein–RNA interactions for Protein: Q2YD98

UVSSA, UV-stimulated scaffold protein A, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UVSSAQ2YD98 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
UVSSAQ2YD98 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
UVSSAQ2YD98 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
UVSSAQ2YD98 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
UVSSAQ2YD98 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
UVSSAQ2YD98 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
UVSSAQ2YD98 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
UVSSAQ2YD98 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
UVSSAQ2YD98 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
UVSSAQ2YD98 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
UVSSAQ2YD98 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
UVSSAQ2YD98 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
UVSSAQ2YD98 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
UVSSAQ2YD98 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
UVSSAQ2YD98 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
UVSSAQ2YD98 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
UVSSAQ2YD98 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
UVSSAQ2YD98 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
UVSSAQ2YD98 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
UVSSAQ2YD98 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
UVSSAQ2YD98 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
UVSSAQ2YD98 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
UVSSAQ2YD98 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
UVSSAQ2YD98 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
UVSSAQ2YD98 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
UVSSAQ2YD98 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
UVSSAQ2YD98 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
UVSSAQ2YD98 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
UVSSAQ2YD98 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
UVSSAQ2YD98 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
UVSSAQ2YD98 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
UVSSAQ2YD98 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
UVSSAQ2YD98 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
UVSSAQ2YD98 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
UVSSAQ2YD98 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
UVSSAQ2YD98 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
UVSSAQ2YD98 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
UVSSAQ2YD98 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
UVSSAQ2YD98 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
UVSSAQ2YD98 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
UVSSAQ2YD98 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
UVSSAQ2YD98 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
UVSSAQ2YD98 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
UVSSAQ2YD98 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
UVSSAQ2YD98 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
UVSSAQ2YD98 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
UVSSAQ2YD98 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
UVSSAQ2YD98 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
UVSSAQ2YD98 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
UVSSAQ2YD98 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
UVSSAQ2YD98 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
UVSSAQ2YD98 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
UVSSAQ2YD98 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
UVSSAQ2YD98 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
UVSSAQ2YD98 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
UVSSAQ2YD98 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
UVSSAQ2YD98 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
UVSSAQ2YD98 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
UVSSAQ2YD98 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
UVSSAQ2YD98 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
UVSSAQ2YD98 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
UVSSAQ2YD98 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
UVSSAQ2YD98 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
UVSSAQ2YD98 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
UVSSAQ2YD98 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
UVSSAQ2YD98 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
UVSSAQ2YD98 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
UVSSAQ2YD98 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
UVSSAQ2YD98 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
UVSSAQ2YD98 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
UVSSAQ2YD98 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
UVSSAQ2YD98 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
UVSSAQ2YD98 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
UVSSAQ2YD98 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
UVSSAQ2YD98 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
UVSSAQ2YD98 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
UVSSAQ2YD98 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
UVSSAQ2YD98 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
UVSSAQ2YD98 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
UVSSAQ2YD98 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
UVSSAQ2YD98 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
UVSSAQ2YD98 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
UVSSAQ2YD98 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
UVSSAQ2YD98 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
UVSSAQ2YD98 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
UVSSAQ2YD98 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
UVSSAQ2YD98 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
UVSSAQ2YD98 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
UVSSAQ2YD98 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
UVSSAQ2YD98 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
UVSSAQ2YD98 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
UVSSAQ2YD98 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
UVSSAQ2YD98 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
UVSSAQ2YD98 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
UVSSAQ2YD98 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
UVSSAQ2YD98 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
UVSSAQ2YD98 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
UVSSAQ2YD98 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
UVSSAQ2YD98 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
UVSSAQ2YD98 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms