Protein–RNA interactions for Protein: P62333

PSMC6, 26S proteasome regulatory subunit 10B, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMC6P62333 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PSMC6P62333 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PSMC6P62333 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PSMC6P62333 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PSMC6P62333 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PSMC6P62333 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PSMC6P62333 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PSMC6P62333 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PSMC6P62333 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PSMC6P62333 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PSMC6P62333 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PSMC6P62333 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PSMC6P62333 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PSMC6P62333 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PSMC6P62333 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PSMC6P62333 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PSMC6P62333 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PSMC6P62333 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PSMC6P62333 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PSMC6P62333 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PSMC6P62333 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PSMC6P62333 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PSMC6P62333 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PSMC6P62333 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PSMC6P62333 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PSMC6P62333 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PSMC6P62333 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PSMC6P62333 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PSMC6P62333 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PSMC6P62333 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PSMC6P62333 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PSMC6P62333 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PSMC6P62333 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PSMC6P62333 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PSMC6P62333 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PSMC6P62333 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PSMC6P62333 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PSMC6P62333 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PSMC6P62333 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PSMC6P62333 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PSMC6P62333 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PSMC6P62333 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PSMC6P62333 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PSMC6P62333 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PSMC6P62333 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PSMC6P62333 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PSMC6P62333 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PSMC6P62333 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PSMC6P62333 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PSMC6P62333 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PSMC6P62333 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PSMC6P62333 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PSMC6P62333 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PSMC6P62333 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PSMC6P62333 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PSMC6P62333 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PSMC6P62333 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PSMC6P62333 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PSMC6P62333 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PSMC6P62333 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PSMC6P62333 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PSMC6P62333 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PSMC6P62333 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PSMC6P62333 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PSMC6P62333 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PSMC6P62333 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PSMC6P62333 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PSMC6P62333 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PSMC6P62333 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PSMC6P62333 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PSMC6P62333 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PSMC6P62333 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PSMC6P62333 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PSMC6P62333 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PSMC6P62333 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PSMC6P62333 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PSMC6P62333 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PSMC6P62333 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PSMC6P62333 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PSMC6P62333 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PSMC6P62333 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PSMC6P62333 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PSMC6P62333 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PSMC6P62333 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PSMC6P62333 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PSMC6P62333 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PSMC6P62333 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PSMC6P62333 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PSMC6P62333 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PSMC6P62333 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PSMC6P62333 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PSMC6P62333 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PSMC6P62333 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PSMC6P62333 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PSMC6P62333 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PSMC6P62333 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PSMC6P62333 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PSMC6P62333 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PSMC6P62333 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PSMC6P62333 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms