Protein–RNA interactions for Protein: P18206

VCL, Vinculin, humanhuman

Predictions only

Length 1,134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCLP18206 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VCLP18206 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VCLP18206 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VCLP18206 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VCLP18206 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VCLP18206 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VCLP18206 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VCLP18206 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VCLP18206 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VCLP18206 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VCLP18206 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VCLP18206 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VCLP18206 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VCLP18206 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
VCLP18206 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VCLP18206 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VCLP18206 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VCLP18206 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VCLP18206 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VCLP18206 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VCLP18206 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VCLP18206 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VCLP18206 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VCLP18206 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
VCLP18206 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VCLP18206 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VCLP18206 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VCLP18206 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VCLP18206 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VCLP18206 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VCLP18206 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VCLP18206 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VCLP18206 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VCLP18206 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VCLP18206 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
VCLP18206 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
VCLP18206 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
VCLP18206 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VCLP18206 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
VCLP18206 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VCLP18206 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VCLP18206 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VCLP18206 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
VCLP18206 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VCLP18206 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VCLP18206 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VCLP18206 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VCLP18206 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VCLP18206 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VCLP18206 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VCLP18206 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VCLP18206 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VCLP18206 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VCLP18206 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VCLP18206 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VCLP18206 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
VCLP18206 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VCLP18206 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VCLP18206 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VCLP18206 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VCLP18206 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VCLP18206 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VCLP18206 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VCLP18206 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VCLP18206 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VCLP18206 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VCLP18206 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VCLP18206 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VCLP18206 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VCLP18206 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VCLP18206 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VCLP18206 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VCLP18206 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VCLP18206 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
VCLP18206 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VCLP18206 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VCLP18206 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VCLP18206 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VCLP18206 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VCLP18206 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VCLP18206 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VCLP18206 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VCLP18206 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VCLP18206 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VCLP18206 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VCLP18206 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VCLP18206 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VCLP18206 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VCLP18206 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
VCLP18206 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VCLP18206 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VCLP18206 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VCLP18206 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VCLP18206 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
VCLP18206 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VCLP18206 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VCLP18206 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VCLP18206 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
VCLP18206 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
VCLP18206 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms