Protein–RNA interactions for Protein: P09496

CLTA, Clathrin light chain A, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTAP09496 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLTAP09496 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLTAP09496 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLTAP09496 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLTAP09496 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLTAP09496 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLTAP09496 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLTAP09496 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLTAP09496 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLTAP09496 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLTAP09496 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLTAP09496 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CLTAP09496 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLTAP09496 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLTAP09496 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLTAP09496 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLTAP09496 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLTAP09496 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLTAP09496 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLTAP09496 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLTAP09496 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLTAP09496 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLTAP09496 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CLTAP09496 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CLTAP09496 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CLTAP09496 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLTAP09496 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLTAP09496 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLTAP09496 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLTAP09496 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLTAP09496 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLTAP09496 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLTAP09496 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLTAP09496 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLTAP09496 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLTAP09496 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLTAP09496 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLTAP09496 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CLTAP09496 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLTAP09496 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLTAP09496 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLTAP09496 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLTAP09496 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLTAP09496 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLTAP09496 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLTAP09496 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CLTAP09496 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLTAP09496 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLTAP09496 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLTAP09496 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CLTAP09496 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLTAP09496 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLTAP09496 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLTAP09496 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLTAP09496 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLTAP09496 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLTAP09496 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLTAP09496 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLTAP09496 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLTAP09496 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLTAP09496 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLTAP09496 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLTAP09496 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLTAP09496 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CLTAP09496 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLTAP09496 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CLTAP09496 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLTAP09496 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLTAP09496 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLTAP09496 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLTAP09496 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLTAP09496 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLTAP09496 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLTAP09496 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLTAP09496 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLTAP09496 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLTAP09496 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLTAP09496 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLTAP09496 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CLTAP09496 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLTAP09496 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLTAP09496 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CLTAP09496 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLTAP09496 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLTAP09496 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLTAP09496 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLTAP09496 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLTAP09496 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLTAP09496 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLTAP09496 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLTAP09496 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLTAP09496 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLTAP09496 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLTAP09496 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLTAP09496 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLTAP09496 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLTAP09496 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLTAP09496 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLTAP09496 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLTAP09496 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms