Protein–RNA interactions for Protein: O76041

NEBL, Nebulette, humanhuman

Predictions only

Length 1,014 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEBLO76041 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEBLO76041 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEBLO76041 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
NEBLO76041 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEBLO76041 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEBLO76041 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEBLO76041 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEBLO76041 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEBLO76041 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEBLO76041 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEBLO76041 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEBLO76041 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEBLO76041 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NEBLO76041 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEBLO76041 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEBLO76041 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEBLO76041 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEBLO76041 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEBLO76041 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEBLO76041 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEBLO76041 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEBLO76041 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEBLO76041 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEBLO76041 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEBLO76041 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEBLO76041 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEBLO76041 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEBLO76041 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEBLO76041 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEBLO76041 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEBLO76041 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEBLO76041 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEBLO76041 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEBLO76041 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEBLO76041 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEBLO76041 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEBLO76041 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEBLO76041 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEBLO76041 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEBLO76041 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEBLO76041 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEBLO76041 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEBLO76041 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEBLO76041 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEBLO76041 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEBLO76041 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEBLO76041 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEBLO76041 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEBLO76041 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEBLO76041 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEBLO76041 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEBLO76041 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEBLO76041 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEBLO76041 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEBLO76041 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEBLO76041 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEBLO76041 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEBLO76041 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEBLO76041 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEBLO76041 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEBLO76041 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEBLO76041 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEBLO76041 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEBLO76041 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEBLO76041 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEBLO76041 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NEBLO76041 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NEBLO76041 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NEBLO76041 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NEBLO76041 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NEBLO76041 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NEBLO76041 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NEBLO76041 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NEBLO76041 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NEBLO76041 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NEBLO76041 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NEBLO76041 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
NEBLO76041 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEBLO76041 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEBLO76041 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEBLO76041 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEBLO76041 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEBLO76041 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEBLO76041 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEBLO76041 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEBLO76041 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEBLO76041 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEBLO76041 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEBLO76041 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEBLO76041 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEBLO76041 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEBLO76041 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEBLO76041 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEBLO76041 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEBLO76041 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEBLO76041 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEBLO76041 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEBLO76041 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEBLO76041 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEBLO76041 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms