Protein–RNA interactions for Protein: O76041

NEBL, Nebulette, humanhuman

Predictions only

Length 1,014 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEBLO76041 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
NEBLO76041 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC34.67■■■■□ 3.14
NEBLO76041 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
NEBLO76041 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
NEBLO76041 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
NEBLO76041 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
NEBLO76041 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
NEBLO76041 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
NEBLO76041 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC33.17■■■□□ 2.9
NEBLO76041 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC33.14■■■□□ 2.9
NEBLO76041 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
NEBLO76041 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
NEBLO76041 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
NEBLO76041 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
NEBLO76041 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.64■■■□□ 2.82
NEBLO76041 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.8
NEBLO76041 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC32.44■■■□□ 2.78
NEBLO76041 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
NEBLO76041 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
NEBLO76041 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
NEBLO76041 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
NEBLO76041 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
NEBLO76041 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC31.85■■■□□ 2.69
NEBLO76041 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
NEBLO76041 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.67
NEBLO76041 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
NEBLO76041 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC31.7■■■□□ 2.67
NEBLO76041 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
NEBLO76041 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC31.62■■■□□ 2.65
NEBLO76041 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
NEBLO76041 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
NEBLO76041 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
NEBLO76041 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
NEBLO76041 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
NEBLO76041 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
NEBLO76041 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
NEBLO76041 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
NEBLO76041 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
NEBLO76041 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
NEBLO76041 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
NEBLO76041 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
NEBLO76041 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
NEBLO76041 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
NEBLO76041 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC31.04■■■□□ 2.56
NEBLO76041 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
NEBLO76041 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
NEBLO76041 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
NEBLO76041 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
NEBLO76041 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
NEBLO76041 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
NEBLO76041 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
NEBLO76041 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC30.77■■■□□ 2.52
NEBLO76041 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
NEBLO76041 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
NEBLO76041 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
NEBLO76041 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
NEBLO76041 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
NEBLO76041 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.49
NEBLO76041 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
NEBLO76041 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
NEBLO76041 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
NEBLO76041 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
NEBLO76041 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
NEBLO76041 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
NEBLO76041 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
NEBLO76041 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
NEBLO76041 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
NEBLO76041 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
NEBLO76041 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
NEBLO76041 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
NEBLO76041 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
NEBLO76041 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
NEBLO76041 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
NEBLO76041 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
NEBLO76041 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
NEBLO76041 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
NEBLO76041 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
NEBLO76041 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
NEBLO76041 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
NEBLO76041 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
NEBLO76041 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
NEBLO76041 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
NEBLO76041 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
NEBLO76041 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
NEBLO76041 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC30.04■■■□□ 2.4
NEBLO76041 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
NEBLO76041 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
NEBLO76041 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
NEBLO76041 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
NEBLO76041 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
NEBLO76041 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
NEBLO76041 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
NEBLO76041 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
NEBLO76041 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
NEBLO76041 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
NEBLO76041 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
NEBLO76041 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
NEBLO76041 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
NEBLO76041 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
NEBLO76041 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms