Protein–RNA interactions for Protein: O60304

ZNF500, Zinc finger protein 500, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF500O60304 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF500O60304 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF500O60304 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF500O60304 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF500O60304 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF500O60304 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF500O60304 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF500O60304 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF500O60304 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF500O60304 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF500O60304 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF500O60304 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF500O60304 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF500O60304 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF500O60304 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF500O60304 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF500O60304 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF500O60304 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF500O60304 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF500O60304 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF500O60304 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF500O60304 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF500O60304 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF500O60304 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF500O60304 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF500O60304 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF500O60304 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF500O60304 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF500O60304 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF500O60304 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF500O60304 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF500O60304 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF500O60304 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF500O60304 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF500O60304 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF500O60304 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF500O60304 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF500O60304 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF500O60304 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF500O60304 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF500O60304 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF500O60304 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF500O60304 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF500O60304 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF500O60304 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF500O60304 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF500O60304 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF500O60304 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF500O60304 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF500O60304 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF500O60304 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF500O60304 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF500O60304 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF500O60304 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF500O60304 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF500O60304 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF500O60304 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF500O60304 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF500O60304 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF500O60304 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF500O60304 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF500O60304 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF500O60304 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF500O60304 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF500O60304 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF500O60304 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF500O60304 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF500O60304 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF500O60304 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF500O60304 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF500O60304 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF500O60304 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF500O60304 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF500O60304 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF500O60304 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF500O60304 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF500O60304 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF500O60304 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF500O60304 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF500O60304 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF500O60304 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF500O60304 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF500O60304 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF500O60304 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF500O60304 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF500O60304 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF500O60304 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF500O60304 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF500O60304 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF500O60304 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ZNF500O60304 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ZNF500O60304 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF500O60304 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF500O60304 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF500O60304 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF500O60304 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF500O60304 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF500O60304 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF500O60304 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF500O60304 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms