Protein–RNA interactions for Protein: B4DXG7

cDNA FLJ57652, highly similar to Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DXG7 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
B4DXG7 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
B4DXG7 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
B4DXG7 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
B4DXG7 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
B4DXG7 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
B4DXG7 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
B4DXG7 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
B4DXG7 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
B4DXG7 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
B4DXG7 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
B4DXG7 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
B4DXG7 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
B4DXG7 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
B4DXG7 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
B4DXG7 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
B4DXG7 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
B4DXG7 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
B4DXG7 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
B4DXG7 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
B4DXG7 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
B4DXG7 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
B4DXG7 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
B4DXG7 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
B4DXG7 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
B4DXG7 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
B4DXG7 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
B4DXG7 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
B4DXG7 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
B4DXG7 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
B4DXG7 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
B4DXG7 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
B4DXG7 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
B4DXG7 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
B4DXG7 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
B4DXG7 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
B4DXG7 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
B4DXG7 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
B4DXG7 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
B4DXG7 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
B4DXG7 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
B4DXG7 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
B4DXG7 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
B4DXG7 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
B4DXG7 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
B4DXG7 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
B4DXG7 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
B4DXG7 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
B4DXG7 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
B4DXG7 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
B4DXG7 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
B4DXG7 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
B4DXG7 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
B4DXG7 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
B4DXG7 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
B4DXG7 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
B4DXG7 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
B4DXG7 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
B4DXG7 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
B4DXG7 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
B4DXG7 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
B4DXG7 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
B4DXG7 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
B4DXG7 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
B4DXG7 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
B4DXG7 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
B4DXG7 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
B4DXG7 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
B4DXG7 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
B4DXG7 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
B4DXG7 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
B4DXG7 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
B4DXG7 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
B4DXG7 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
B4DXG7 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
B4DXG7 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
B4DXG7 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
B4DXG7 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
B4DXG7 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
B4DXG7 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
B4DXG7 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
B4DXG7 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
B4DXG7 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
B4DXG7 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
B4DXG7 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
B4DXG7 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
B4DXG7 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
B4DXG7 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
B4DXG7 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
B4DXG7 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
B4DXG7 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
B4DXG7 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
B4DXG7 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
B4DXG7 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
B4DXG7 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
B4DXG7 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
B4DXG7 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
B4DXG7 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
B4DXG7 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
B4DXG7 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms