Protein–RNA interactions for Protein: A1A4Y4

IRGM, Immunity-related GTPase family M protein, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRGMA1A4Y4 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
IRGMA1A4Y4 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
IRGMA1A4Y4 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
IRGMA1A4Y4 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
IRGMA1A4Y4 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
IRGMA1A4Y4 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
IRGMA1A4Y4 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
IRGMA1A4Y4 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
IRGMA1A4Y4 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
IRGMA1A4Y4 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
IRGMA1A4Y4 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
IRGMA1A4Y4 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
IRGMA1A4Y4 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
IRGMA1A4Y4 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
IRGMA1A4Y4 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
IRGMA1A4Y4 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
IRGMA1A4Y4 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
IRGMA1A4Y4 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
IRGMA1A4Y4 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
IRGMA1A4Y4 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
IRGMA1A4Y4 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
IRGMA1A4Y4 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
IRGMA1A4Y4 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
IRGMA1A4Y4 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
IRGMA1A4Y4 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
IRGMA1A4Y4 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.79
IRGMA1A4Y4 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
IRGMA1A4Y4 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
IRGMA1A4Y4 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
IRGMA1A4Y4 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
IRGMA1A4Y4 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
IRGMA1A4Y4 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
IRGMA1A4Y4 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
IRGMA1A4Y4 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
IRGMA1A4Y4 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
IRGMA1A4Y4 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
IRGMA1A4Y4 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
IRGMA1A4Y4 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
IRGMA1A4Y4 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
IRGMA1A4Y4 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
IRGMA1A4Y4 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
IRGMA1A4Y4 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
IRGMA1A4Y4 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
IRGMA1A4Y4 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
IRGMA1A4Y4 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
IRGMA1A4Y4 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
IRGMA1A4Y4 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
IRGMA1A4Y4 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
IRGMA1A4Y4 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
IRGMA1A4Y4 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
IRGMA1A4Y4 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
IRGMA1A4Y4 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
IRGMA1A4Y4 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
IRGMA1A4Y4 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
IRGMA1A4Y4 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
IRGMA1A4Y4 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
IRGMA1A4Y4 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
IRGMA1A4Y4 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
IRGMA1A4Y4 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
IRGMA1A4Y4 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
IRGMA1A4Y4 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
IRGMA1A4Y4 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
IRGMA1A4Y4 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
IRGMA1A4Y4 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
IRGMA1A4Y4 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
IRGMA1A4Y4 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
IRGMA1A4Y4 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
IRGMA1A4Y4 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
IRGMA1A4Y4 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
IRGMA1A4Y4 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
IRGMA1A4Y4 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
IRGMA1A4Y4 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
IRGMA1A4Y4 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
IRGMA1A4Y4 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
IRGMA1A4Y4 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
IRGMA1A4Y4 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
IRGMA1A4Y4 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
IRGMA1A4Y4 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
IRGMA1A4Y4 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
IRGMA1A4Y4 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
IRGMA1A4Y4 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
IRGMA1A4Y4 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
IRGMA1A4Y4 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
IRGMA1A4Y4 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
IRGMA1A4Y4 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
IRGMA1A4Y4 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
IRGMA1A4Y4 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
IRGMA1A4Y4 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
IRGMA1A4Y4 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
IRGMA1A4Y4 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
IRGMA1A4Y4 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
IRGMA1A4Y4 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
IRGMA1A4Y4 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
IRGMA1A4Y4 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
IRGMA1A4Y4 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
IRGMA1A4Y4 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
IRGMA1A4Y4 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
IRGMA1A4Y4 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
IRGMA1A4Y4 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
IRGMA1A4Y4 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms