Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4K3

TRAF6, TNF receptor-associated factor 6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF6Q9Y4K3 NIN-206ENST00000453196 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
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TRAF6Q9Y4K3 NUP54-201ENST00000264883 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRAF6Q9Y4K3 UHMK1-203ENST00000538489 8446 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRAF6Q9Y4K3 PPP1R15B-201ENST00000367188 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRAF6Q9Y4K3 PGBD1-201ENST00000259883 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRAF6Q9Y4K3 POM121L4P-202ENST00000427789 1891 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
TRAF6Q9Y4K3 ESRRB-204ENST00000509242 2849 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRAF6Q9Y4K3 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRAF6Q9Y4K3 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRAF6Q9Y4K3 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRAF6Q9Y4K3 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRAF6Q9Y4K3 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRAF6Q9Y4K3 MIR1307-201ENST00000408840 149 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
TRAF6Q9Y4K3 AL359979.2-201ENST00000435108 613 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRAF6Q9Y4K3 GS1-124K5.4-201ENST00000445681 540 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRAF6Q9Y4K3 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRAF6Q9Y4K3 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRAF6Q9Y4K3 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRAF6Q9Y4K3 DNM1P51-201ENST00000558149 522 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
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TRAF6Q9Y4K3 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRAF6Q9Y4K3 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRAF6Q9Y4K3 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRAF6Q9Y4K3 AC008982.2-201ENST00000600473 493 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRAF6Q9Y4K3 AC012183.1-201ENST00000625197 499 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
TRAF6Q9Y4K3 ARHGEF9-226ENST00000636392 1920 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRAF6Q9Y4K3 TMX4-201ENST00000246024 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRAF6Q9Y4K3 CPEB4-208ENST00000520867 2607 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRAF6Q9Y4K3 COL6A3-202ENST00000347401 8625 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRAF6Q9Y4K3 COL6A3-209ENST00000472056 8628 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRAF6Q9Y4K3 FHOD3-207ENST00000591635 3035 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRAF6Q9Y4K3 DAXX-203ENST00000414083 2355 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRAF6Q9Y4K3 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRAF6Q9Y4K3 AC009093.1-201ENST00000566070 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRAF6Q9Y4K3 ZSWIM3-201ENST00000255152 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRAF6Q9Y4K3 RBM10-202ENST00000345781 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRAF6Q9Y4K3 ADAMTS5-201ENST00000284987 9056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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TRAF6Q9Y4K3 DDR1-225ENST00000376568 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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TRAF6Q9Y4K3 DCDC2-202ENST00000378454 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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TRAF6Q9Y4K3 CCDC149-208ENST00000635206 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
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TRAF6Q9Y4K3 AGAP5-202ENST00000443782 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TRAF6Q9Y4K3 AGAP4-203ENST00000448048 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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TRAF6Q9Y4K3 TMED7-201ENST00000456936 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TRAF6Q9Y4K3 ACTR3-201ENST00000263238 6718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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TRAF6Q9Y4K3 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
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TRAF6Q9Y4K3 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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TRAF6Q9Y4K3 PAQR3-209ENST00000512733 9811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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TRAF6Q9Y4K3 EPN2-202ENST00000347697 4664 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
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TRAF6Q9Y4K3 PDHB-201ENST00000302746 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TRAF6Q9Y4K3 PINX1-201ENST00000314787 1545 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TRAF6Q9Y4K3 TMC5-204ENST00000541464 3581 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TRAF6Q9Y4K3 CSNK1G1-205ENST00000607537 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TRAF6Q9Y4K3 PSMC4-201ENST00000157812 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TRAF6Q9Y4K3 HTR2C-201ENST00000276198 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TRAF6Q9Y4K3 AP001258.1-201ENST00000501817 2110 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TRAF6Q9Y4K3 HNRNPH1-216ENST00000510411 2105 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TRAF6Q9Y4K3 TRMT61A-202ENST00000389749 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TRAF6Q9Y4K3 GDPD5-209ENST00000529721 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TRAF6Q9Y4K3 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TRAF6Q9Y4K3 CCDC144NL-201ENST00000327925 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TRAF6Q9Y4K3 NPTN-IT1-201ENST00000628401 2283 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
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