Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 PLAT-211ENST00000524009 1613 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 PHF2-203ENST00000610682 2921 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 MYO1C-218ENST00000575158 4804 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 PHTF2-204ENST00000415251 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 SRP9-201ENST00000304786 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 BAHCC1-201ENST00000307745 10342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 1479 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 ATG7-201ENST00000354449 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 TCF3-201ENST00000262965 4451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 RERE-201ENST00000337907 8026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 ZNF75A-205ENST00000574298 2347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 ART3-201ENST00000341029 1517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 C11orf53-201ENST00000280325 1208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 CAMP-201ENST00000296435 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 ATP5C1-201ENST00000335698 1078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 U3.5-201ENST00000363448 216 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 AC106827.1-201ENST00000366454 431 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 RPL10-203ENST00000406022 748 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 AL929302.1-201ENST00000426556 871 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 BX322557.2-201ENST00000445242 379 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 AC007279.1-201ENST00000448547 837 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 PLSCR1-202ENST00000448787 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 AL451000.1-201ENST00000451300 1186 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 AC079250.1-201ENST00000456046 531 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 RN7SL128P-201ENST00000467883 305 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 GDNF-207ENST00000515058 764 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 C10orf113-201ENST00000529198 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 AC078814.4-201ENST00000546650 327 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 OS9-220ENST00000552285 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 FAAP24-203ENST00000589646 836 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 APOC1-209ENST00000592885 562 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 AL356417.2-202ENST00000608986 532 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 STAG3L1-204ENST00000619870 1192 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 Metazoa_SRP.200-201ENST00000622073 282 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 USP6NL-205ENST00000609104 11377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 PRUNE1-205ENST00000368937 1850 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 WDR26-201ENST00000414423 6872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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HOXA3O43365 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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HOXA3O43365 PRL-201ENST00000306482 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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HOXA3O43365 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 CHRNA2-201ENST00000240132 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 GLIPR1L2-201ENST00000320460 1729 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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HOXA3O43365 BTRC-202ENST00000370187 6134 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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HOXA3O43365 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 MDM1-205ENST00000430606 2170 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 PTPRH-202ENST00000376350 3877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 SLC44A1-202ENST00000374723 9640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 RAB18-208ENST00000611151 4931 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 ZNF691-201ENST00000372502 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 RNF123-203ENST00000433785 1555 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC11□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 REXO1L1P-201ENST00000379010 6598 ntBASIC11□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 SMC6-201ENST00000351948 5173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 FMNL3-205ENST00000550488 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 HMOX2-201ENST00000219700 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 MUC1-223ENST00000611571 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
HOXA3O43365 TNFSF11-201ENST00000239849 911 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
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