Protein–RNA interactions for Protein: P12004

PCNA, Proliferating cell nuclear antigen, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNAP12004 PRKCE-201ENST00000306156 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PCNAP12004 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
PCNAP12004 SEC61B-201ENST00000223641 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PCNAP12004 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PCNAP12004 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PCNAP12004 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PCNAP12004 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PCNAP12004 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PCNAP12004 SEC61B-203ENST00000498603 587 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PCNAP12004 LINC02369-202ENST00000540745 801 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PCNAP12004 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PCNAP12004 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PCNAP12004 AC009163.3-201ENST00000563554 852 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PCNAP12004 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
PCNAP12004 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PCNAP12004 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PCNAP12004 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PCNAP12004 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PCNAP12004 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PCNAP12004 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PCNAP12004 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PCNAP12004 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PCNAP12004 BAIAP3-207ENST00000562208 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PCNAP12004 GPHN-203ENST00000478722 4297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PCNAP12004 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PCNAP12004 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PCNAP12004 NIPSNAP3A-201ENST00000374767 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PCNAP12004 MAT2B-204ENST00000518095 3409 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PCNAP12004 BDNF-208ENST00000418212 4125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PCNAP12004 PASK-203ENST00000403638 5161 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PCNAP12004 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PCNAP12004 GDAP2-201ENST00000369442 2436 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PCNAP12004 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PCNAP12004 SH2D7-202ENST00000409568 2162 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PCNAP12004 CCNB2-201ENST00000288207 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PCNAP12004 POM121L14P-201ENST00000406100 1558 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
PCNAP12004 MANEA-AS1-201ENST00000564541 2268 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
PCNAP12004 TRPM4-202ENST00000427978 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PCNAP12004 LSM14A-201ENST00000433627 3424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PCNAP12004 USP19-202ENST00000398888 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PCNAP12004 MGRN1-211ENST00000588994 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PCNAP12004 RASA4CP-203ENST00000446874 3193 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PCNAP12004 DPP8-204ENST00000358939 2822 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PCNAP12004 MUC20-203ENST00000436408 2463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PCNAP12004 SPTBN2-201ENST00000309996 7866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PCNAP12004 TARBP2-202ENST00000394357 1402 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PCNAP12004 KRT8P18-201ENST00000413425 1445 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
PCNAP12004 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PCNAP12004 GOSR2-233ENST00000640068 3103 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PCNAP12004 TNFRSF8-203ENST00000417814 3593 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PCNAP12004 LIPA-205ENST00000456827 2527 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PCNAP12004 AC115284.2-201ENST00000624646 2054 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
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PCNAP12004 TRIB1-201ENST00000311922 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PCNAP12004 MEST-206ENST00000416162 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PCNAP12004 ATXN2L-225ENST00000570200 3635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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PCNAP12004 APOD-201ENST00000343267 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PCNAP12004 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PCNAP12004 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
PCNAP12004 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
PCNAP12004 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
PCNAP12004 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PCNAP12004 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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PCNAP12004 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PCNAP12004 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PCNAP12004 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PCNAP12004 KLF17P1-201ENST00000547105 1126 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
PCNAP12004 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
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PCNAP12004 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PCNAP12004 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
PCNAP12004 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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PCNAP12004 CRISP2-201ENST00000339139 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PCNAP12004 PRDM10-202ENST00000358825 6322 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PCNAP12004 PRDM10-203ENST00000360871 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PCNAP12004 ELOVL4-201ENST00000369816 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PCNAP12004 GATAD2A-203ENST00000404158 5776 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PCNAP12004 COPS7B-223ENST00000611614 2468 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PCNAP12004 TNFRSF8-201ENST00000263932 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PCNAP12004 INSC-205ENST00000525218 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PCNAP12004 PGM3-201ENST00000283977 2219 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PCNAP12004 SARS-201ENST00000234677 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PCNAP12004 CACNA1G-207ENST00000429973 7120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PCNAP12004 CACNA1G-217ENST00000507336 7116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PCNAP12004 XRCC6-201ENST00000359308 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
PCNAP12004 DLGAP1-AS1-201ENST00000317114 1966 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
PCNAP12004 PCMTD1-208ENST00000544451 3697 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
PCNAP12004 AC060814.4-201ENST00000594169 2163 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
PCNAP12004 DPY19L2P2-205ENST00000439473 3994 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PCNAP12004 ATP7B-202ENST00000344297 5861 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PCNAP12004 SETD1B-202ENST00000542440 8185 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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