Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6D2

RNF182, E3 ubiquitin-protein ligase RNF182, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF182Q8N6D2 RIMS1-201ENST00000264839 7055 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 DDX19B-202ENST00000355992 1692 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 RPL18A-205ENST00000600147 1391 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 ATF3-202ENST00000341491 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 PML-210ENST00000563500 4502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 AC005865.2-203ENST00000636557 2959 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 DDC-204ENST00000426377 1700 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 CCDC187-204ENST00000624277 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 NSD2-203ENST00000382888 2666 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 ZNF236-202ENST00000320610 7124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 LAS1L-202ENST00000374807 2386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 LINC00940-201ENST00000418006 2350 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 DLGAP2-214ENST00000612087 10088 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 GATA2-201ENST00000341105 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 KIRREL3-205ENST00000529097 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 MTMR2-201ENST00000346299 4681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 MTMR2-203ENST00000393223 4681 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 STRC-213ENST00000541030 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 AC008040.5-201ENST00000599781 1781 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 ALDH7A1-234ENST00000637782 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 CC2D1A-208ENST00000589606 3117 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 SNRNP27-201ENST00000244227 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 ZNF689-201ENST00000287461 3547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 CDC14B-201ENST00000375240 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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RNF182Q8N6D2 C17orf80-202ENST00000268942 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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RNF182Q8N6D2 NPPA-202ENST00000376480 855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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RNF182Q8N6D2 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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RNF182Q8N6D2 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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RNF182Q8N6D2 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
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RNF182Q8N6D2 LMCD1-201ENST00000157600 8405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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RNF182Q8N6D2 RHOH-224ENST00000622175 2254 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 PTPRK-207ENST00000368226 6087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 UBE2W-201ENST00000419880 2315 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 AC245140.2-201ENST00000624054 1939 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
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RNF182Q8N6D2 SYK-204ENST00000375754 5005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 PCCB-210ENST00000471595 6090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 NCDN-201ENST00000356090 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 ELOVL4-201ENST00000369816 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 SLC22A2-202ENST00000366953 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 BCL2L1-203ENST00000376062 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 GULP1-207ENST00000409843 2643 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 TMEM100-201ENST00000424486 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 VMP1-201ENST00000262291 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 SAP30BP-225ENST00000584667 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 PPFIBP1-215ENST00000542629 3208 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 ARMCX2-201ENST00000328766 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 TCEA3-201ENST00000374601 1197 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RNF182Q8N6D2 BX679664.3-201ENST00000414070 555 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
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