Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU1

TCF23, Transcription factor 23, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF23Q7RTU1 TESPA1-201ENST00000316577 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
TCF23Q7RTU1 CYB5D1-203ENST00000571846 1870 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
TCF23Q7RTU1 KLHL13-209ENST00000545703 3322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
TCF23Q7RTU1 HIC2-203ENST00000443632 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
TCF23Q7RTU1 PDHA1-212ENST00000540249 3277 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
TCF23Q7RTU1 C21orf59-203ENST00000382549 2503 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
TCF23Q7RTU1 NRXN1-207ENST00000404971 7578 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
TCF23Q7RTU1 MKLN1-203ENST00000421797 2460 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
TCF23Q7RTU1 EIF3C-201ENST00000331666 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
TCF23Q7RTU1 C15orf39-202ENST00000394987 4430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
TCF23Q7RTU1 LRRFIP1-202ENST00000289175 3709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
TCF23Q7RTU1 SLC39A6-204ENST00000590986 3003 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
TCF23Q7RTU1 WWTR1-203ENST00000465804 5030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
TCF23Q7RTU1 ASB15-207ENST00000540573 1651 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
TCF23Q7RTU1 AC040160.2-201ENST00000623816 1675 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
TCF23Q7RTU1 PHF21B-201ENST00000313237 3671 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
TCF23Q7RTU1 SLC38A1-204ENST00000546893 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
TCF23Q7RTU1 NACC2-202ENST00000371753 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
TCF23Q7RTU1 PLPP6-201ENST00000381883 2944 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.58
TCF23Q7RTU1 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
TCF23Q7RTU1 NME7-203ENST00000472647 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TCF23Q7RTU1 USP19-207ENST00000434032 4677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TCF23Q7RTU1 LINC01114-202ENST00000424321 2112 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TCF23Q7RTU1 VENTXP1-201ENST00000569334 2716 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
TCF23Q7RTU1 MYRIP-204ENST00000444716 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TCF23Q7RTU1 GNG12-AS1-201ENST00000413628 2058 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TCF23Q7RTU1 ERCC4-207ENST00000575156 2073 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TCF23Q7RTU1 COX6B2-210ENST00000593184 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TCF23Q7RTU1 PNKD-203ENST00000273077 3021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TCF23Q7RTU1 CHRFAM7A-201ENST00000299847 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TCF23Q7RTU1 NPTN-201ENST00000345330 2444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TCF23Q7RTU1 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TCF23Q7RTU1 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TCF23Q7RTU1 STRA6-202ENST00000395105 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TCF23Q7RTU1 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TCF23Q7RTU1 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TCF23Q7RTU1 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TCF23Q7RTU1 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TCF23Q7RTU1 AC108462.1-201ENST00000457467 850 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TCF23Q7RTU1 SCARNA12-201ENST00000459155 270 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
TCF23Q7RTU1 COQ10BP2-201ENST00000513804 724 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
TCF23Q7RTU1 LINC02369-202ENST00000540745 801 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TCF23Q7RTU1 ALG10B-203ENST00000551464 571 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TCF23Q7RTU1 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TCF23Q7RTU1 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TCF23Q7RTU1 AC087741.1-205ENST00000572730 750 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TCF23Q7RTU1 MIR4326-201ENST00000582203 59 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
TCF23Q7RTU1 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TCF23Q7RTU1 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TCF23Q7RTU1 AC139795.2-201ENST00000499900 1751 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TCF23Q7RTU1 DISC1-206ENST00000366637 6848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TCF23Q7RTU1 C15orf39-207ENST00000567617 4249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TCF23Q7RTU1 ZNF683-205ENST00000436292 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TCF23Q7RTU1 FTSJ1-203ENST00000396894 1669 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TCF23Q7RTU1 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TCF23Q7RTU1 AL355102.3-201ENST00000554299 1678 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
TCF23Q7RTU1 MGRN1-211ENST00000588994 1665 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TCF23Q7RTU1 TMC5-204ENST00000541464 3581 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TCF23Q7RTU1 AC239798.2-201ENST00000415338 3540 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TCF23Q7RTU1 ANKZF1-201ENST00000323348 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TCF23Q7RTU1 AC144450.1-201ENST00000366424 1641 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TCF23Q7RTU1 ODCP-201ENST00000459650 1639 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
TCF23Q7RTU1 CACNA1A-211ENST00000592864 1623 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TCF23Q7RTU1 RPUSD4-201ENST00000298317 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TCF23Q7RTU1 CACNA2D1-202ENST00000356860 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TCF23Q7RTU1 RNH1-224ENST00000534797 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TCF23Q7RTU1 TMEM9-203ENST00000367333 1564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TCF23Q7RTU1 TP53INP2-202ENST00000374810 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TCF23Q7RTU1 AMDHD2-202ENST00000302956 3273 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TCF23Q7RTU1 MINDY1-205ENST00000493834 1546 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TCF23Q7RTU1 KLKP1-203ENST00000600104 1532 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TCF23Q7RTU1 DYNC1I1-202ENST00000359388 2843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TCF23Q7RTU1 KYAT1-201ENST00000302586 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TCF23Q7RTU1 CPA5-206ENST00000474905 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TCF23Q7RTU1 USP51-201ENST00000500968 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TCF23Q7RTU1 CELF4-217ENST00000591282 1461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TCF23Q7RTU1 PPP2R1B-204ENST00000426998 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
TCF23Q7RTU1 TTC14-202ENST00000382584 2274 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TCF23Q7RTU1 ARHGEF4-217ENST00000611048 3486 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
TCF23Q7RTU1 ACTR3-201ENST00000263238 6718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TCF23Q7RTU1 SEC13-202ENST00000350697 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TCF23Q7RTU1 LHCGR-201ENST00000294954 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TCF23Q7RTU1 KCNJ9-201ENST00000368088 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TCF23Q7RTU1 NT5DC4-201ENST00000327581 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TCF23Q7RTU1 CCSER2-203ENST00000372088 7657 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
TCF23Q7RTU1 POLR1C-203ENST00000372389 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TCF23Q7RTU1 C11orf87-201ENST00000327419 5884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TCF23Q7RTU1 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TCF23Q7RTU1 DANT2-201ENST00000430756 2079 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
TCF23Q7RTU1 ZNF202-207ENST00000530393 3564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TCF23Q7RTU1 USH1G-202ENST00000614341 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TCF23Q7RTU1 TRIB2-202ENST00000381465 2778 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
TCF23Q7RTU1 PDLIM5-203ENST00000359265 1189 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TCF23Q7RTU1 TPM3-211ENST00000368531 1115 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TCF23Q7RTU1 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TCF23Q7RTU1 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC11.44□□□□□ -0.58
TCF23Q7RTU1 GGTLC4P-201ENST00000402176 664 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
TCF23Q7RTU1 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TCF23Q7RTU1 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
TCF23Q7RTU1 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.3 ms