Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX73

TM2D2, TM2 domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM2D2Q9BX73 NIN-206ENST00000453196 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
TM2D2Q9BX73 KIAA1324-210ENST00000529753 2903 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
TM2D2Q9BX73 RBL1-202ENST00000373664 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
TM2D2Q9BX73 XBP1-204ENST00000405219 1690 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
TM2D2Q9BX73 TRMT1L-201ENST00000367506 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
TM2D2Q9BX73 SLC5A11-202ENST00000424767 2399 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
TM2D2Q9BX73 AC008806.1-201ENST00000624962 2443 ntBASIC9.96□□□□□ -0.81
TM2D2Q9BX73 ABCA2-202ENST00000341511 8063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
TM2D2Q9BX73 CCDC187-203ENST00000569961 3158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
TM2D2Q9BX73 SLC45A2-201ENST00000296589 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
TM2D2Q9BX73 PLAT-202ENST00000352041 2516 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
TM2D2Q9BX73 CACNA1C-214ENST00000399634 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
TM2D2Q9BX73 CACNA1C-222ENST00000406454 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
TM2D2Q9BX73 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
TM2D2Q9BX73 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
TM2D2Q9BX73 AGAP3-205ENST00000463381 2730 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
TM2D2Q9BX73 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
TM2D2Q9BX73 AC237221.1-202ENST00000563054 2947 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
TM2D2Q9BX73 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
TM2D2Q9BX73 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
TM2D2Q9BX73 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
TM2D2Q9BX73 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
TM2D2Q9BX73 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
TM2D2Q9BX73 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
TM2D2Q9BX73 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
TM2D2Q9BX73 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
TM2D2Q9BX73 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
TM2D2Q9BX73 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
TM2D2Q9BX73 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
TM2D2Q9BX73 SSR1P1-201ENST00000407630 814 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
TM2D2Q9BX73 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
TM2D2Q9BX73 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
TM2D2Q9BX73 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
TM2D2Q9BX73 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
TM2D2Q9BX73 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
TM2D2Q9BX73 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
TM2D2Q9BX73 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
TM2D2Q9BX73 SOGA3-207ENST00000481848 11464 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
TM2D2Q9BX73 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
TM2D2Q9BX73 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
TM2D2Q9BX73 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
TM2D2Q9BX73 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
TM2D2Q9BX73 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
TM2D2Q9BX73 NFATC2IP-206ENST00000568148 1157 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
TM2D2Q9BX73 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
TM2D2Q9BX73 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
TM2D2Q9BX73 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
TM2D2Q9BX73 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC9.96□□□□□ -0.82
TM2D2Q9BX73 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
TM2D2Q9BX73 PM20D1-201ENST00000367136 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
TM2D2Q9BX73 HK3-201ENST00000292432 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
TM2D2Q9BX73 PARN-203ENST00000437198 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
TM2D2Q9BX73 LINC00869-206ENST00000610578 5734 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
TM2D2Q9BX73 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
TM2D2Q9BX73 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
TM2D2Q9BX73 RSPO2-201ENST00000276659 3111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
TM2D2Q9BX73 RTN3-210ENST00000540798 3124 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
TM2D2Q9BX73 BTBD3-204ENST00000405977 5137 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
TM2D2Q9BX73 MRVI1-201ENST00000423302 6126 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
TM2D2Q9BX73 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
TM2D2Q9BX73 SETD4-207ENST00000399215 4272 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
TM2D2Q9BX73 VAMP1-201ENST00000361716 3449 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
TM2D2Q9BX73 ITGA5-201ENST00000293379 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
TM2D2Q9BX73 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
TM2D2Q9BX73 LDB3-205ENST00000429277 5436 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
TM2D2Q9BX73 NEU3-204ENST00000531509 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
TM2D2Q9BX73 POU5F2-201ENST00000606183 8418 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
TM2D2Q9BX73 PSKH1-201ENST00000291041 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
TM2D2Q9BX73 TNC-212ENST00000542877 5517 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
TM2D2Q9BX73 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
TM2D2Q9BX73 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
TM2D2Q9BX73 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
TM2D2Q9BX73 ST3GAL1-211ENST00000522652 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
TM2D2Q9BX73 FLT4-212ENST00000619105 3806 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
TM2D2Q9BX73 RBPJ-203ENST00000345843 1682 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
TM2D2Q9BX73 FLNA-203ENST00000369850 8382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
TM2D2Q9BX73 ZNF263-202ENST00000538765 1721 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
TM2D2Q9BX73 GFPT2-201ENST00000253778 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
TM2D2Q9BX73 BCDIN3D-AS1-201ENST00000548872 3078 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
TM2D2Q9BX73 PRKCG-201ENST00000263431 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
TM2D2Q9BX73 ZNF239-205ENST00000535642 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
TM2D2Q9BX73 LCA5-202ENST00000392959 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
TM2D2Q9BX73 APBB1-223ENST00000618005 2107 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
TM2D2Q9BX73 KIAA1614-202ENST00000367588 9654 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
TM2D2Q9BX73 PITPNM3-202ENST00000421306 6945 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
TM2D2Q9BX73 CCNY-203ENST00000374704 3960 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
TM2D2Q9BX73 USP40-201ENST00000251722 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
TM2D2Q9BX73 URGCP-201ENST00000336086 5658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
TM2D2Q9BX73 RAPGEF6-207ENST00000507093 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
TM2D2Q9BX73 PCDHB2-201ENST00000194155 4126 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
TM2D2Q9BX73 FBLN1-208ENST00000442170 2531 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
TM2D2Q9BX73 SPOUT1-201ENST00000361256 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
TM2D2Q9BX73 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
TM2D2Q9BX73 TRAF6-202ENST00000526995 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
TM2D2Q9BX73 TTC39B-201ENST00000297615 3053 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
TM2D2Q9BX73 PDE7B-203ENST00000615259 5234 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
TM2D2Q9BX73 HOTTIP-203ENST00000521028 3345 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
TM2D2Q9BX73 AC073335.2-201ENST00000610177 3441 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
TM2D2Q9BX73 VASH2-203ENST00000366965 3572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
TM2D2Q9BX73 TNRC6C-205ENST00000588061 8419 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms