Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2G0

EFR3B, Protein EFR3 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 817 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFR3BQ9Y2G0 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EFR3BQ9Y2G0 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EFR3BQ9Y2G0 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EFR3BQ9Y2G0 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EFR3BQ9Y2G0 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EFR3BQ9Y2G0 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EFR3BQ9Y2G0 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
EFR3BQ9Y2G0 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
EFR3BQ9Y2G0 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
EFR3BQ9Y2G0 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
EFR3BQ9Y2G0 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EFR3BQ9Y2G0 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EFR3BQ9Y2G0 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EFR3BQ9Y2G0 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EFR3BQ9Y2G0 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EFR3BQ9Y2G0 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EFR3BQ9Y2G0 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EFR3BQ9Y2G0 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EFR3BQ9Y2G0 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EFR3BQ9Y2G0 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EFR3BQ9Y2G0 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EFR3BQ9Y2G0 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EFR3BQ9Y2G0 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EFR3BQ9Y2G0 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EFR3BQ9Y2G0 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EFR3BQ9Y2G0 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
EFR3BQ9Y2G0 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EFR3BQ9Y2G0 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EFR3BQ9Y2G0 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
EFR3BQ9Y2G0 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EFR3BQ9Y2G0 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EFR3BQ9Y2G0 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EFR3BQ9Y2G0 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EFR3BQ9Y2G0 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EFR3BQ9Y2G0 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EFR3BQ9Y2G0 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EFR3BQ9Y2G0 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
EFR3BQ9Y2G0 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EFR3BQ9Y2G0 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EFR3BQ9Y2G0 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EFR3BQ9Y2G0 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EFR3BQ9Y2G0 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EFR3BQ9Y2G0 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EFR3BQ9Y2G0 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EFR3BQ9Y2G0 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EFR3BQ9Y2G0 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EFR3BQ9Y2G0 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EFR3BQ9Y2G0 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EFR3BQ9Y2G0 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EFR3BQ9Y2G0 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EFR3BQ9Y2G0 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EFR3BQ9Y2G0 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EFR3BQ9Y2G0 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EFR3BQ9Y2G0 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EFR3BQ9Y2G0 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
EFR3BQ9Y2G0 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EFR3BQ9Y2G0 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EFR3BQ9Y2G0 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EFR3BQ9Y2G0 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EFR3BQ9Y2G0 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EFR3BQ9Y2G0 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EFR3BQ9Y2G0 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EFR3BQ9Y2G0 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EFR3BQ9Y2G0 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
EFR3BQ9Y2G0 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EFR3BQ9Y2G0 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EFR3BQ9Y2G0 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EFR3BQ9Y2G0 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EFR3BQ9Y2G0 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EFR3BQ9Y2G0 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EFR3BQ9Y2G0 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EFR3BQ9Y2G0 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EFR3BQ9Y2G0 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EFR3BQ9Y2G0 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EFR3BQ9Y2G0 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EFR3BQ9Y2G0 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EFR3BQ9Y2G0 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EFR3BQ9Y2G0 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
EFR3BQ9Y2G0 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EFR3BQ9Y2G0 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EFR3BQ9Y2G0 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EFR3BQ9Y2G0 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
EFR3BQ9Y2G0 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
EFR3BQ9Y2G0 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EFR3BQ9Y2G0 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EFR3BQ9Y2G0 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EFR3BQ9Y2G0 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EFR3BQ9Y2G0 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EFR3BQ9Y2G0 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EFR3BQ9Y2G0 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EFR3BQ9Y2G0 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EFR3BQ9Y2G0 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EFR3BQ9Y2G0 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EFR3BQ9Y2G0 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EFR3BQ9Y2G0 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
EFR3BQ9Y2G0 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EFR3BQ9Y2G0 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EFR3BQ9Y2G0 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EFR3BQ9Y2G0 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EFR3BQ9Y2G0 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms