Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY77

POLDIP3, Polymerase delta-interacting protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLDIP3Q9BY77 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
POLDIP3Q9BY77 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
POLDIP3Q9BY77 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
POLDIP3Q9BY77 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
POLDIP3Q9BY77 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
POLDIP3Q9BY77 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
POLDIP3Q9BY77 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
POLDIP3Q9BY77 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
POLDIP3Q9BY77 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLDIP3Q9BY77 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLDIP3Q9BY77 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLDIP3Q9BY77 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLDIP3Q9BY77 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLDIP3Q9BY77 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLDIP3Q9BY77 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLDIP3Q9BY77 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLDIP3Q9BY77 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLDIP3Q9BY77 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLDIP3Q9BY77 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLDIP3Q9BY77 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
POLDIP3Q9BY77 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLDIP3Q9BY77 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
POLDIP3Q9BY77 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
POLDIP3Q9BY77 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
POLDIP3Q9BY77 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
POLDIP3Q9BY77 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
POLDIP3Q9BY77 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
POLDIP3Q9BY77 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
POLDIP3Q9BY77 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
POLDIP3Q9BY77 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
POLDIP3Q9BY77 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
POLDIP3Q9BY77 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
POLDIP3Q9BY77 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
POLDIP3Q9BY77 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
POLDIP3Q9BY77 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
POLDIP3Q9BY77 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
POLDIP3Q9BY77 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
POLDIP3Q9BY77 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
POLDIP3Q9BY77 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
POLDIP3Q9BY77 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
POLDIP3Q9BY77 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
POLDIP3Q9BY77 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
POLDIP3Q9BY77 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
POLDIP3Q9BY77 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
POLDIP3Q9BY77 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
POLDIP3Q9BY77 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
POLDIP3Q9BY77 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
POLDIP3Q9BY77 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
POLDIP3Q9BY77 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
POLDIP3Q9BY77 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
POLDIP3Q9BY77 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
POLDIP3Q9BY77 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
POLDIP3Q9BY77 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
POLDIP3Q9BY77 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
POLDIP3Q9BY77 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
POLDIP3Q9BY77 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
POLDIP3Q9BY77 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
POLDIP3Q9BY77 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
POLDIP3Q9BY77 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
POLDIP3Q9BY77 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
POLDIP3Q9BY77 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
POLDIP3Q9BY77 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
POLDIP3Q9BY77 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
POLDIP3Q9BY77 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
POLDIP3Q9BY77 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
POLDIP3Q9BY77 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
POLDIP3Q9BY77 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
POLDIP3Q9BY77 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
POLDIP3Q9BY77 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
POLDIP3Q9BY77 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
POLDIP3Q9BY77 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
POLDIP3Q9BY77 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
POLDIP3Q9BY77 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
POLDIP3Q9BY77 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
POLDIP3Q9BY77 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
POLDIP3Q9BY77 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
POLDIP3Q9BY77 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
POLDIP3Q9BY77 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
POLDIP3Q9BY77 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
POLDIP3Q9BY77 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
POLDIP3Q9BY77 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
POLDIP3Q9BY77 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
POLDIP3Q9BY77 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
POLDIP3Q9BY77 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
POLDIP3Q9BY77 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
POLDIP3Q9BY77 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
POLDIP3Q9BY77 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
POLDIP3Q9BY77 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
POLDIP3Q9BY77 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
POLDIP3Q9BY77 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
POLDIP3Q9BY77 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
POLDIP3Q9BY77 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
POLDIP3Q9BY77 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
POLDIP3Q9BY77 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
POLDIP3Q9BY77 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
POLDIP3Q9BY77 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
POLDIP3Q9BY77 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
POLDIP3Q9BY77 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
POLDIP3Q9BY77 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
POLDIP3Q9BY77 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 257.4 ms