Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NUP58Q9BVL2 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NUP58Q9BVL2 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NUP58Q9BVL2 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NUP58Q9BVL2 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NUP58Q9BVL2 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NUP58Q9BVL2 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NUP58Q9BVL2 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NUP58Q9BVL2 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NUP58Q9BVL2 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NUP58Q9BVL2 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NUP58Q9BVL2 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NUP58Q9BVL2 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NUP58Q9BVL2 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NUP58Q9BVL2 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
NUP58Q9BVL2 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NUP58Q9BVL2 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NUP58Q9BVL2 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NUP58Q9BVL2 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NUP58Q9BVL2 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NUP58Q9BVL2 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NUP58Q9BVL2 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NUP58Q9BVL2 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NUP58Q9BVL2 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NUP58Q9BVL2 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NUP58Q9BVL2 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NUP58Q9BVL2 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NUP58Q9BVL2 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NUP58Q9BVL2 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NUP58Q9BVL2 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NUP58Q9BVL2 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NUP58Q9BVL2 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NUP58Q9BVL2 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NUP58Q9BVL2 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NUP58Q9BVL2 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NUP58Q9BVL2 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NUP58Q9BVL2 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NUP58Q9BVL2 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NUP58Q9BVL2 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NUP58Q9BVL2 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NUP58Q9BVL2 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NUP58Q9BVL2 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
NUP58Q9BVL2 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NUP58Q9BVL2 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NUP58Q9BVL2 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NUP58Q9BVL2 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NUP58Q9BVL2 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NUP58Q9BVL2 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NUP58Q9BVL2 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NUP58Q9BVL2 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NUP58Q9BVL2 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NUP58Q9BVL2 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NUP58Q9BVL2 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NUP58Q9BVL2 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NUP58Q9BVL2 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NUP58Q9BVL2 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NUP58Q9BVL2 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NUP58Q9BVL2 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NUP58Q9BVL2 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NUP58Q9BVL2 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NUP58Q9BVL2 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NUP58Q9BVL2 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NUP58Q9BVL2 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NUP58Q9BVL2 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NUP58Q9BVL2 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NUP58Q9BVL2 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NUP58Q9BVL2 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NUP58Q9BVL2 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NUP58Q9BVL2 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NUP58Q9BVL2 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NUP58Q9BVL2 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NUP58Q9BVL2 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NUP58Q9BVL2 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NUP58Q9BVL2 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NUP58Q9BVL2 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NUP58Q9BVL2 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NUP58Q9BVL2 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NUP58Q9BVL2 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NUP58Q9BVL2 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NUP58Q9BVL2 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NUP58Q9BVL2 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NUP58Q9BVL2 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NUP58Q9BVL2 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NUP58Q9BVL2 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NUP58Q9BVL2 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NUP58Q9BVL2 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NUP58Q9BVL2 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NUP58Q9BVL2 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NUP58Q9BVL2 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NUP58Q9BVL2 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NUP58Q9BVL2 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NUP58Q9BVL2 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NUP58Q9BVL2 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NUP58Q9BVL2 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NUP58Q9BVL2 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NUP58Q9BVL2 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NUP58Q9BVL2 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NUP58Q9BVL2 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NUP58Q9BVL2 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NUP58Q9BVL2 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms