Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MCMBPQ9BTE3 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MCMBPQ9BTE3 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MCMBPQ9BTE3 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MCMBPQ9BTE3 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MCMBPQ9BTE3 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MCMBPQ9BTE3 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MCMBPQ9BTE3 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MCMBPQ9BTE3 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MCMBPQ9BTE3 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MCMBPQ9BTE3 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MCMBPQ9BTE3 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MCMBPQ9BTE3 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MCMBPQ9BTE3 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MCMBPQ9BTE3 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MCMBPQ9BTE3 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MCMBPQ9BTE3 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MCMBPQ9BTE3 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MCMBPQ9BTE3 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MCMBPQ9BTE3 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MCMBPQ9BTE3 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MCMBPQ9BTE3 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MCMBPQ9BTE3 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MCMBPQ9BTE3 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MCMBPQ9BTE3 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MCMBPQ9BTE3 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MCMBPQ9BTE3 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MCMBPQ9BTE3 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MCMBPQ9BTE3 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MCMBPQ9BTE3 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MCMBPQ9BTE3 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MCMBPQ9BTE3 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MCMBPQ9BTE3 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MCMBPQ9BTE3 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
MCMBPQ9BTE3 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MCMBPQ9BTE3 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MCMBPQ9BTE3 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MCMBPQ9BTE3 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MCMBPQ9BTE3 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MCMBPQ9BTE3 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MCMBPQ9BTE3 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MCMBPQ9BTE3 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MCMBPQ9BTE3 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MCMBPQ9BTE3 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MCMBPQ9BTE3 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MCMBPQ9BTE3 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MCMBPQ9BTE3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MCMBPQ9BTE3 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MCMBPQ9BTE3 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MCMBPQ9BTE3 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MCMBPQ9BTE3 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MCMBPQ9BTE3 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MCMBPQ9BTE3 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MCMBPQ9BTE3 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
MCMBPQ9BTE3 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MCMBPQ9BTE3 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
MCMBPQ9BTE3 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MCMBPQ9BTE3 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MCMBPQ9BTE3 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MCMBPQ9BTE3 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MCMBPQ9BTE3 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
MCMBPQ9BTE3 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MCMBPQ9BTE3 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MCMBPQ9BTE3 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MCMBPQ9BTE3 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MCMBPQ9BTE3 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MCMBPQ9BTE3 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MCMBPQ9BTE3 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MCMBPQ9BTE3 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MCMBPQ9BTE3 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MCMBPQ9BTE3 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MCMBPQ9BTE3 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MCMBPQ9BTE3 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MCMBPQ9BTE3 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MCMBPQ9BTE3 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MCMBPQ9BTE3 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MCMBPQ9BTE3 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MCMBPQ9BTE3 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MCMBPQ9BTE3 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MCMBPQ9BTE3 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MCMBPQ9BTE3 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MCMBPQ9BTE3 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MCMBPQ9BTE3 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MCMBPQ9BTE3 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MCMBPQ9BTE3 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
MCMBPQ9BTE3 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MCMBPQ9BTE3 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MCMBPQ9BTE3 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MCMBPQ9BTE3 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
MCMBPQ9BTE3 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MCMBPQ9BTE3 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MCMBPQ9BTE3 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MCMBPQ9BTE3 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MCMBPQ9BTE3 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MCMBPQ9BTE3 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MCMBPQ9BTE3 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MCMBPQ9BTE3 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MCMBPQ9BTE3 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MCMBPQ9BTE3 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MCMBPQ9BTE3 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.3 ms