Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD1

SHANK2-AS3, Putative uncharacterized protein SHANK2-AS3, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2-AS3Q9BTD1 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SHANK2-AS3Q9BTD1 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SHANK2-AS3Q9BTD1 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SHANK2-AS3Q9BTD1 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SHANK2-AS3Q9BTD1 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SHANK2-AS3Q9BTD1 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SHANK2-AS3Q9BTD1 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SHANK2-AS3Q9BTD1 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SHANK2-AS3Q9BTD1 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SHANK2-AS3Q9BTD1 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SHANK2-AS3Q9BTD1 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SHANK2-AS3Q9BTD1 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SHANK2-AS3Q9BTD1 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SHANK2-AS3Q9BTD1 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SHANK2-AS3Q9BTD1 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SHANK2-AS3Q9BTD1 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SHANK2-AS3Q9BTD1 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SHANK2-AS3Q9BTD1 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SHANK2-AS3Q9BTD1 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SHANK2-AS3Q9BTD1 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SHANK2-AS3Q9BTD1 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SHANK2-AS3Q9BTD1 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SHANK2-AS3Q9BTD1 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SHANK2-AS3Q9BTD1 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SHANK2-AS3Q9BTD1 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SHANK2-AS3Q9BTD1 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SHANK2-AS3Q9BTD1 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SHANK2-AS3Q9BTD1 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SHANK2-AS3Q9BTD1 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SHANK2-AS3Q9BTD1 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SHANK2-AS3Q9BTD1 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SHANK2-AS3Q9BTD1 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SHANK2-AS3Q9BTD1 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SHANK2-AS3Q9BTD1 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SHANK2-AS3Q9BTD1 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SHANK2-AS3Q9BTD1 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
SHANK2-AS3Q9BTD1 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SHANK2-AS3Q9BTD1 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SHANK2-AS3Q9BTD1 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SHANK2-AS3Q9BTD1 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SHANK2-AS3Q9BTD1 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SHANK2-AS3Q9BTD1 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SHANK2-AS3Q9BTD1 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SHANK2-AS3Q9BTD1 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SHANK2-AS3Q9BTD1 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SHANK2-AS3Q9BTD1 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SHANK2-AS3Q9BTD1 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SHANK2-AS3Q9BTD1 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SHANK2-AS3Q9BTD1 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SHANK2-AS3Q9BTD1 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SHANK2-AS3Q9BTD1 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SHANK2-AS3Q9BTD1 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SHANK2-AS3Q9BTD1 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SHANK2-AS3Q9BTD1 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SHANK2-AS3Q9BTD1 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SHANK2-AS3Q9BTD1 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SHANK2-AS3Q9BTD1 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SHANK2-AS3Q9BTD1 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SHANK2-AS3Q9BTD1 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SHANK2-AS3Q9BTD1 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SHANK2-AS3Q9BTD1 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SHANK2-AS3Q9BTD1 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SHANK2-AS3Q9BTD1 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SHANK2-AS3Q9BTD1 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SHANK2-AS3Q9BTD1 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SHANK2-AS3Q9BTD1 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SHANK2-AS3Q9BTD1 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SHANK2-AS3Q9BTD1 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SHANK2-AS3Q9BTD1 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SHANK2-AS3Q9BTD1 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SHANK2-AS3Q9BTD1 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SHANK2-AS3Q9BTD1 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SHANK2-AS3Q9BTD1 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SHANK2-AS3Q9BTD1 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SHANK2-AS3Q9BTD1 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SHANK2-AS3Q9BTD1 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SHANK2-AS3Q9BTD1 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SHANK2-AS3Q9BTD1 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SHANK2-AS3Q9BTD1 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SHANK2-AS3Q9BTD1 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SHANK2-AS3Q9BTD1 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SHANK2-AS3Q9BTD1 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SHANK2-AS3Q9BTD1 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SHANK2-AS3Q9BTD1 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SHANK2-AS3Q9BTD1 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SHANK2-AS3Q9BTD1 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SHANK2-AS3Q9BTD1 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SHANK2-AS3Q9BTD1 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SHANK2-AS3Q9BTD1 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SHANK2-AS3Q9BTD1 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SHANK2-AS3Q9BTD1 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SHANK2-AS3Q9BTD1 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SHANK2-AS3Q9BTD1 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SHANK2-AS3Q9BTD1 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SHANK2-AS3Q9BTD1 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms