Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBZ0

CCDC110, Coiled-coil domain-containing protein 110, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC110Q8TBZ0 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC110Q8TBZ0 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC110Q8TBZ0 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC110Q8TBZ0 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC110Q8TBZ0 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC110Q8TBZ0 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC110Q8TBZ0 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC110Q8TBZ0 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC110Q8TBZ0 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC110Q8TBZ0 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC110Q8TBZ0 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC110Q8TBZ0 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC110Q8TBZ0 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC110Q8TBZ0 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC110Q8TBZ0 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC110Q8TBZ0 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC110Q8TBZ0 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC110Q8TBZ0 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC110Q8TBZ0 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC110Q8TBZ0 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC110Q8TBZ0 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC110Q8TBZ0 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC110Q8TBZ0 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC110Q8TBZ0 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC110Q8TBZ0 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC110Q8TBZ0 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC110Q8TBZ0 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC110Q8TBZ0 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC110Q8TBZ0 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC110Q8TBZ0 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC110Q8TBZ0 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC110Q8TBZ0 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC110Q8TBZ0 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC110Q8TBZ0 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC110Q8TBZ0 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC110Q8TBZ0 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC110Q8TBZ0 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC110Q8TBZ0 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC110Q8TBZ0 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC110Q8TBZ0 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC110Q8TBZ0 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC110Q8TBZ0 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC110Q8TBZ0 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC110Q8TBZ0 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC110Q8TBZ0 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC110Q8TBZ0 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC110Q8TBZ0 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC110Q8TBZ0 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC110Q8TBZ0 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC110Q8TBZ0 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC110Q8TBZ0 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC110Q8TBZ0 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC110Q8TBZ0 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC110Q8TBZ0 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC110Q8TBZ0 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC110Q8TBZ0 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC110Q8TBZ0 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC110Q8TBZ0 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC110Q8TBZ0 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC110Q8TBZ0 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC110Q8TBZ0 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC110Q8TBZ0 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC110Q8TBZ0 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC110Q8TBZ0 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC110Q8TBZ0 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC110Q8TBZ0 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC110Q8TBZ0 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC110Q8TBZ0 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC110Q8TBZ0 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC110Q8TBZ0 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC110Q8TBZ0 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC110Q8TBZ0 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC110Q8TBZ0 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC110Q8TBZ0 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC110Q8TBZ0 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC110Q8TBZ0 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC110Q8TBZ0 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC110Q8TBZ0 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC110Q8TBZ0 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC110Q8TBZ0 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC110Q8TBZ0 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC110Q8TBZ0 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC110Q8TBZ0 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC110Q8TBZ0 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC110Q8TBZ0 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC110Q8TBZ0 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC110Q8TBZ0 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC110Q8TBZ0 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC110Q8TBZ0 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC110Q8TBZ0 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC110Q8TBZ0 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC110Q8TBZ0 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC110Q8TBZ0 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC110Q8TBZ0 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC110Q8TBZ0 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC110Q8TBZ0 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC110Q8TBZ0 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC110Q8TBZ0 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC110Q8TBZ0 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC110Q8TBZ0 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms