Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVW6

ARID3B, AT-rich interactive domain-containing protein 3B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3BQ8IVW6 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ARID3BQ8IVW6 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARID3BQ8IVW6 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARID3BQ8IVW6 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARID3BQ8IVW6 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARID3BQ8IVW6 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARID3BQ8IVW6 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ARID3BQ8IVW6 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARID3BQ8IVW6 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARID3BQ8IVW6 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARID3BQ8IVW6 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARID3BQ8IVW6 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ARID3BQ8IVW6 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARID3BQ8IVW6 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARID3BQ8IVW6 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARID3BQ8IVW6 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARID3BQ8IVW6 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARID3BQ8IVW6 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARID3BQ8IVW6 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARID3BQ8IVW6 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARID3BQ8IVW6 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARID3BQ8IVW6 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARID3BQ8IVW6 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ARID3BQ8IVW6 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ARID3BQ8IVW6 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ARID3BQ8IVW6 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ARID3BQ8IVW6 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ARID3BQ8IVW6 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARID3BQ8IVW6 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARID3BQ8IVW6 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARID3BQ8IVW6 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARID3BQ8IVW6 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ARID3BQ8IVW6 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARID3BQ8IVW6 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARID3BQ8IVW6 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARID3BQ8IVW6 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARID3BQ8IVW6 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARID3BQ8IVW6 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARID3BQ8IVW6 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARID3BQ8IVW6 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARID3BQ8IVW6 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARID3BQ8IVW6 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARID3BQ8IVW6 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARID3BQ8IVW6 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARID3BQ8IVW6 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARID3BQ8IVW6 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARID3BQ8IVW6 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARID3BQ8IVW6 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARID3BQ8IVW6 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
ARID3BQ8IVW6 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
ARID3BQ8IVW6 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARID3BQ8IVW6 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARID3BQ8IVW6 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARID3BQ8IVW6 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ARID3BQ8IVW6 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARID3BQ8IVW6 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARID3BQ8IVW6 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARID3BQ8IVW6 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARID3BQ8IVW6 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARID3BQ8IVW6 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARID3BQ8IVW6 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARID3BQ8IVW6 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARID3BQ8IVW6 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARID3BQ8IVW6 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARID3BQ8IVW6 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARID3BQ8IVW6 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARID3BQ8IVW6 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARID3BQ8IVW6 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARID3BQ8IVW6 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARID3BQ8IVW6 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARID3BQ8IVW6 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARID3BQ8IVW6 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ARID3BQ8IVW6 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARID3BQ8IVW6 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARID3BQ8IVW6 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARID3BQ8IVW6 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARID3BQ8IVW6 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARID3BQ8IVW6 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARID3BQ8IVW6 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARID3BQ8IVW6 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARID3BQ8IVW6 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARID3BQ8IVW6 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARID3BQ8IVW6 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARID3BQ8IVW6 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARID3BQ8IVW6 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARID3BQ8IVW6 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARID3BQ8IVW6 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARID3BQ8IVW6 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARID3BQ8IVW6 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARID3BQ8IVW6 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARID3BQ8IVW6 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARID3BQ8IVW6 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARID3BQ8IVW6 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARID3BQ8IVW6 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARID3BQ8IVW6 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARID3BQ8IVW6 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARID3BQ8IVW6 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARID3BQ8IVW6 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ARID3BQ8IVW6 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ARID3BQ8IVW6 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 136.6 ms